Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,396,295 | A→T | 5.1% | L1121H (CTT→CAT) | PP_2100 ← | two‑component system sensor protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,396,295 | 0 | A | T | 5.1% | 246.6 / 2.0 | 78 | L1121H (CTT→CAT) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/36); new base T (2/2); total (40/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
TCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGG > NC_002947/2396148‑2396439 | tCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAg < 6:222563/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGc < 8:45655/149‑1 (MQ=255) gCCGCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTTCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGcgc < 6:73412/147‑3 (MQ=255) ccTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTgg < 6:261329/149‑1 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCTTCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCAACTTGTGGGCCTGCTCGGCTATGGCGCGGCTGTCGTTTTGCGGGTGAAGCGCCATCTGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt < 1:192691/149‑1 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt > 3:274631/1‑149 (MQ=255) cTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt > 1:323383/1‑149 (MQ=255) tCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTg > 5:141887/1‑149 (MQ=255) cTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGtt < 4:64826/149‑1 (MQ=255) ttCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGttt > 6:125661/1‑149 (MQ=255) ttCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGttt > 2:320311/1‑149 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCCGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCa < 4:243189/149‑1 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGt < 2:51104/137‑1 (MQ=255) acaGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTcc < 5:125661/148‑1 (MQ=255) aGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAg > 1:153518/1‑148 (MQ=255) gccgccATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTTCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATgg < 2:308826/126‑1 (MQ=255) gccgccATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCTTCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATgg > 1:308826/1‑126 (MQ=255) cgccATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAgc > 1:213178/1‑149 (MQ=255) cATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCt < 6:218978/149‑1 (MQ=255) cATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCt > 1:190865/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCt > 1:41188/1‑148 (MQ=255) tcaggtcaggGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGa < 5:118747/149‑1 (MQ=255) ggggCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAAc < 1:320311/149‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCgg > 8:114650/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCggg > 5:324527/1‑149 (MQ=255) cgcgcgGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGa < 4:224222/148‑1 (MQ=255) cTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCAcggcg > 7:227619/1‑139 (MQ=255) cTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCAcggcg < 8:227619/139‑1 (MQ=255) cTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGt > 4:114714/1‑149 (MQ=255) cTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGt > 2:85624/1‑149 (MQ=255) cTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGt > 6:324329/1‑149 (MQ=255) ttGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGTGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTc > 8:225153/1‑149 (MQ=255) gtgGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTc < 2:213178/147‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCGTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCg < 8:225055/140‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCGTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCg > 7:225055/1‑140 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg < 4:49867/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg < 2:190865/149‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTgg > 3:152081/1‑148 (MQ=255) ggCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCt > 1:58580/1‑149 (MQ=255) ggCAATGGCGCCGCTGTCGTGTGGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAg < 8:131037/147‑1 (MQ=255) gCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCtt < 6:141887/149‑1 (MQ=255) aaTGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGc > 8:184741/1‑149 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAg > 3:117894/1‑101 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAg < 4:117894/101‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCggg < 7:114650/149‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCggg > 3:142013/1‑149 (MQ=255) ccgcTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCgggg < 7:184741/149‑1 (MQ=255) tCGTGTTGGGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCGTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGTAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCCCGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTGGCGTCGGGGGCGTTg > 4:6290/1‑149 (MQ=255) tCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTg < 5:325055/149‑1 (MQ=255) tCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTg > 3:84674/1‑149 (MQ=255) gtgtTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGc < 4:142013/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTggcgg < 4:274631/148‑1 (MQ=255) ccagagcCTTCAGGCCGACCTGGCCAGCCTGATGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCggg > 7:285543/6‑149 (MQ=38) aaGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGc < 2:58580/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGc < 6:205980/149‑1 (MQ=255) gcgcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCg > 5:156691/1‑148 (MQ=255) gcgcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCg > 4:62529/1‑148 (MQ=255) gcgcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAAACGGGTCAGGCCAGACCACGGCGGACAGGCCGTCCAGCTGGTACAGGTTGGGTGGGGGGGGTTGGTGggggggggggggt > 2:128258/1‑146 (MQ=255) gcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACGGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCGGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 3:6290/149‑1 (MQ=255) gcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 6:119116/149‑1 (MQ=255) gcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt > 3:273975/1‑149 (MQ=255) gcCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAAt < 5:324329/149‑1 (MQ=255) cATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCCCGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgc > 5:321987/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgc > 5:205444/1‑148 (MQ=255) aTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCAAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTgg > 4:39611/1‑132 (MQ=255) aTCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCAAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTgg < 3:39611/132‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgccagc < 2:153518/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATgccagc > 8:301153/1‑148 (MQ=255) tGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAgg > 4:302814/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCgct > 2:66955/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCgct > 6:162557/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCgct > 2:198336/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCACCTGGTACAGATTGCGTCGGGGGCGTTGCTGCAGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCgct > 8:40904/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCgctgg < 3:302814/149‑1 (MQ=255) ggCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGa < 7:40904/149‑1 (MQ=255) ccTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTATAGCTTGCGTC‑GGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAggg > 3:98684/1‑149 (MQ=255) ccTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAgg < 6:205444/149‑1 (MQ=255) ccTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAgg < 3:62529/149‑1 (MQ=255) | TCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAATGGCGCCGCTGTCGTGTTGCGGGTGAAGCGCCATCAGGCTGGCCAGGTCGGCCTGAAGGCTCTGGTGCAAGGTTTCCAGGAAGCGCTGACGGTCAACCGGGTCAGGCCCGACCACGGCGGCCAGGCCGTCCAGCTGGTACAGCTTGCGTCGGGGGCGTTGCTGGCGGCGCGGGCGAATGCCAGCCAGGCGCTGGCTGAGGG > NC_002947/2396148‑2396439 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |