Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,552,436 | A→T | 6.0% | K31N (AAA→AAT) | PP_3137 → | group 2 family glycosyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,552,436 | 0 | A | T | 6.0% | 200.5 / 2.5 | 67 | K31N (AAA→AAT) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/37); new base T (2/2); total (28/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
CCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTT > NC_002947/3552288‑3552582 | cctgCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGTCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACaaa < 2:262005/146‑1 (MQ=255) cGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAg > 2:83694/1‑149 (MQ=255) gCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGt > 6:222162/1‑148 (MQ=255) ccATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGGGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGGGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCa < 4:292234/149‑1 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCa < 1:3734/149‑1 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt < 1:269997/149‑1 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt > 2:269997/1‑149 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt < 2:198054/149‑1 (MQ=255) atcatcAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATg > 4:215799/1‑149 (MQ=255) aaGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGt < 8:77828/148‑1 (MQ=255) aaGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGACCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTc > 2:167300/1‑149 (MQ=255) gCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCggg > 6:41760/1‑149 (MQ=255) gCACCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCggg < 8:203091/149‑1 (MQ=255) cGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCa > 2:189175/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCa < 2:51937/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc < 5:37133/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGATGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc > 4:185292/1‑149 (MQ=255) cgccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCggg > 4:154891/1‑140 (MQ=255) cgccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCggg < 3:154891/140‑1 (MQ=255) gccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGAt < 4:35272/149‑1 (MQ=255) gccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGAt < 6:167955/149‑1 (MQ=255) ccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATg > 7:66220/1‑149 (MQ=255) cgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATgg < 3:215799/149‑1 (MQ=255) gTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGt < 5:222162/149‑1 (MQ=255) ggCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTc < 8:231310/149‑1 (MQ=255) aTCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCt > 5:246229/1‑149 (MQ=255) ggTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGATGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCa < 3:185292/149‑1 (MQ=255) gTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAATGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAg > 8:145122/1‑149 (MQ=255) aGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgccgc > 1:206564/1‑149 (MQ=255) tATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCTCCTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAAcc > 3:56829/1‑149 (MQ=255) tGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCtt > 2:61339/1‑149 (MQ=255) tGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCAAGAGCCTCGA‑GCGCT‑GACTTGTTT‑CGATGGCGCACGGGGCCGACAAAg > 3:22148/1‑93 (MQ=255) aaCGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGCTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCg > 5:278325/1‑149 (MQ=255) ggggaggggggTGGTGGTATTCGGCCGAAATGAAGGCCTGGGCGTCGA‑GGGCT‑GCTTTGTGT‑CGCTGGCGCAGGGGGCGGTTAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTgg < 1:265492/142‑1 (MQ=255) ggTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTgg < 5:41760/149‑1 (MQ=255) ggTGAGGGGGGTGGTGGTCAGCGGCCGCAAGGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCCCGGGGCGGGGTAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTGGGCCGCCAACCTTGGCGTgg < 1:261449/149‑1 (MQ=255) tGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCa < 8:66220/149‑1 (MQ=255) ggtgtggtggtAATCGGCAGCAATGAAGGCCAGCGTCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGGCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGTTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTTGCGTGGCAGTAc < 4:56829/145‑1 (MQ=255) gtAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGa < 6:246229/149‑1 (MQ=255) tAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGAc < 4:181149/149‑1 (MQ=255) tAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGAc < 3:126513/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGGGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACa > 5:280464/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt > 2:243563/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt < 2:206564/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 1:83694/148‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCACT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 7:152718/148‑1 (MQ=255) gCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAg > 6:170517/1‑148 (MQ=255) aaTGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATccc > 8:257136/1‑149 (MQ=255) aacaaGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCg > 5:19457/4‑149 (MQ=255) tGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATg > 1:204272/1‑139 (MQ=255) tGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATg < 2:204272/139‑1 (MQ=255) aaGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGGGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTc < 6:280464/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAc < 1:61339/149‑1 (MQ=255) aggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGGCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAATGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAg < 7:56753/116‑1 (MQ=255) aggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGGCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAATGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACAGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAg > 8:56753/4‑119 (MQ=255) gA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACgcgc < 6:19457/149‑1 (MQ=255) gcgcT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGccc < 1:189175/149‑1 (MQ=255) ttGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATg > 2:4559/1‑147 (MQ=255) gTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAg < 1:94124/148‑1 (MQ=255) tt‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATcc < 6:64465/116‑1 (MQ=255) tt‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATcc > 5:64465/1‑116 (MQ=255) tt‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGtt > 6:281834/1‑149 (MQ=255) gcACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCt < 7:138803/149‑1 (MQ=255) cACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 2:304653/100‑1 (MQ=255) cACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCtt < 7:257136/149‑1 (MQ=255) ggCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCaa < 3:300958/126‑1 (MQ=255) ggCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCaa > 4:300958/1‑126 (MQ=255) gACAATGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCt < 7:145122/149‑1 (MQ=255) aaaGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGtt < 3:197882/149‑1 (MQ=255) | CCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTT‑CGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTT > NC_002947/3552288‑3552582 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |