| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 74,159 | A→T | 9.3% | K212M (AAG→ATG) | PP_0063 → | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 74,159 | 0 | A | T | 9.3% | 276.7 / 14.8 | 97 | K212M (AAG→ATG) | PP_0063 | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/44); new base T (3/6); total (47/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.02e-01 | |||||||||||
GCGTGGCACCGTCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGC > NC_002947/74012‑74306 | gcgTGGCACCGTCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCaa < 4:184718/148‑1 (MQ=255) cgTGGCACCGTCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGt < 4:71807/149‑1 (MQ=255) aCCGTCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGc > 5:4569/1‑149 (MQ=255) gTCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGa < 8:294869/149‑1 (MQ=255) gTCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGa < 2:195721/149‑1 (MQ=255) ccAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATg > 5:292889/1‑149 (MQ=255) ccAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGAGCCGAACATg > 4:129740/1‑149 (MQ=255) cAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCCGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGc > 7:264355/1‑149 (MQ=255) cAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGc > 8:273654/1‑149 (MQ=255) aaggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCt < 3:278689/149‑1 (MQ=255) aggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTg < 8:27270/149‑1 (MQ=255) aggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTg < 3:196621/149‑1 (MQ=255) ggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGTGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTgg < 7:31884/149‑1 (MQ=255) ggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTgg < 6:169163/149‑1 (MQ=255) ggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTgg > 6:125224/1‑149 (MQ=255) gaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGc < 7:171175/149‑1 (MQ=255) aggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCg < 5:296196/149‑1 (MQ=255) ggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCgg > 7:143056/1‑149 (MQ=255) aTCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTgg > 4:107464/1‑149 (MQ=255) aTCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTgg > 1:158711/1‑149 (MQ=255) cTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGc > 5:324277/1‑147 (MQ=255) cTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCaa < 6:324277/149‑1 (MQ=255) tCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGACGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAg > 6:214968/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTACTGCCGACCAGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAg > 5:205771/1‑149 (MQ=255) 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tCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGCACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGgt < 3:94048/149‑1 (MQ=255) cAAGGAAGTGCGGCGTGGTGGCCAGGTGGGTTTGCCTGCCGACGCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCGAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGgt < 8:264355/148‑1 (MQ=255) aaGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGgtgt > 7:275478/1‑149 (MQ=255) aaGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCAGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGgtgt < 6:205771/149‑1 (MQ=255) ggAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCt < 8:188618/123‑1 (MQ=255) ggAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCt > 7:188618/1‑123 (MQ=255) gAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGgt > 8:144508/1‑144 (MQ=255) gAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGgt < 7:144508/144‑1 (MQ=255) gTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCt < 6:4569/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCt < 8:143056/149‑1 (MQ=255) cgcCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTg < 5:9649/117‑1 (MQ=255) cgcCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTg > 6:9649/1‑117 (MQ=255) cgcCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGc < 8:275478/148‑1 (MQ=255) gtggCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTg < 8:75249/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCg < 7:305450/149‑1 (MQ=255) gCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGATCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCgg > 2:77368/1‑149 (MQ=255) tGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATCCGCTGCGGTTGCCg < 7:273654/149‑1 (MQ=255) 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> 1:96849/1‑142 (MQ=255) cGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTa > 1:249686/1‑148 (MQ=255) cGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTAc < 3:107464/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAg > 2:44713/1‑149 (MQ=255) tCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCAcc > 2:108025/1‑149 (MQ=255) gCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAg > 7:1323/1‑142 (MQ=255) gCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAg < 8:1323/142‑1 (MQ=255) aCCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGAtgt < 1:18291/149‑1 (MQ=255) aCCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGAtgt < 5:125224/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGc > 1:120620/1‑139 (MQ=255) ccAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGc < 2:120620/139‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGaa < 8:258641/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCATGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAAt < 6:129605/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAAt < 3:23343/149‑1 (MQ=255) gcgcTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAAtgt < 2:249686/149‑1 (MQ=255) gcTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATgtgt < 2:291260/149‑1 (MQ=255) ccggccAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGTCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTc > 2:219551/5‑93 (MQ=25) ccggccAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGTCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTc < 1:219551/89‑1 (MQ=25) gccAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGa < 4:284091/103‑1 (MQ=38) gccAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGa > 3:284091/2‑104 (MQ=38) cAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGCCGGTTGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAaga > 8:86637/1‑117 (MQ=255) cAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGCCGGTTGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAaga < 7:86637/117‑1 (MQ=255) cAGCATGTTCGGCACGAACTTGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGGTGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGt < 8:243555/122‑1 (MQ=255) cAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTcggcgg > 4:95058/1‑149 (MQ=255) gCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTcggcggcg < 5:232431/149‑1 (MQ=255) gCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTcggcggcg > 3:10692/1‑149 (MQ=255) cAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTcggcggcgg > 2:66451/1‑149 (MQ=255) aaGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCggcggcggc < 7:181468/149‑1 (MQ=255) aGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCggcggcggc > 8:70112/1‑148 (MQ=255) | GCGTGGCACCGTCGACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGGCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGCTGGCCGGTGGCAAGGC‑GGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGC > NC_002947/74012‑74306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |