| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,348,705 | A→G | 64.7% | intergenic (‑70/+404) | PP_3820 ← / ← galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,348,705 | 0 | A | G | 64.7% | 35.4 / 58.8 | 68 | intergenic (‑70/+404) | PP_3820/galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (14/10); new base G (25/19); total (39/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACC > NC_002947/4348593‑4348848 | gCATTACGGTTACCAAAGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGAGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCa > 7:285158/1‑149 (MQ=17) cATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCAGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCaa < 1:208199/149‑1 (MQ=17) cGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGTGTa > 4:104642/1‑149 (MQ=18) ccAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAtc > 5:61615/1‑149 (MQ=21) gagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCa < 5:239927/149‑1 (MQ=21) gagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCAAAGTGGCCAGCGTACAGATCGcc > 4:59714/1‑147 (MQ=255) gaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAgg < 4:90938/149‑1 (MQ=21) aCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAggg < 5:252522/149‑1 (MQ=34) cTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc < 3:295616/149‑1 (MQ=34) tACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 6:262403/1‑148 (MQ=21) cTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGAc < 3:59714/149‑1 (MQ=34) tGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGAcc > 5:256435/1‑149 (MQ=21) ggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTcc < 8:99011/149‑1 (MQ=21) gcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCt < 2:98822/149‑1 (MQ=21) aaCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCt > 2:34589/1‑148 (MQ=21) ccTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt > 7:40887/1‑149 (MQ=34) cTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTcc > 5:75288/1‑118 (MQ=25) cTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTcc < 6:75288/118‑1 (MQ=25) cTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATg > 5:123276/1‑149 (MQ=34) gTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGcc > 1:155327/1‑149 (MQ=21) ggCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTc < 3:207388/149‑1 (MQ=21) ggCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTc > 6:92874/1‑149 (MQ=34) gCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCg > 5:247778/1‑149 (MQ=21) cccTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTc < 3:297804/147‑1 (MQ=21) cccTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTc > 4:297804/1‑147 (MQ=21) ccTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGa > 6:215542/1‑149 (MQ=34) ggtggCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATc < 5:262403/147‑1 (MQ=21) tggCGCGGTTAACCGACACTTACTACGGCTTCGGCTTACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCATTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCTCGCGACATTACTGCTTATGCATGTCGGATCTACg > 4:13848/1‑149 (MQ=11) gcgcGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCGCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGt < 6:331463/148‑1 (MQ=21) cgGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTcaca < 8:40887/149‑1 (MQ=34) ggTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAg < 5:92874/149‑1 (MQ=34) gTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGc > 2:264659/1‑149 (MQ=21) aaCCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt > 2:41637/1‑123 (MQ=25) aaCCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt < 1:41637/123‑1 (MQ=25) aaCCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGt > 8:158967/1‑148 (MQ=21) aCCGCCACTTAGTACTGATTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCTAGCGTACAGATCTCCGAGTGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGtt < 8:285158/148‑1 (MQ=11) ccGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATACCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTcc > 7:98153/1‑149 (MQ=21) cGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCCTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCg > 3:43218/1‑149 (MQ=21) cACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGc < 3:287309/149‑1 (MQ=34) cTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCaa < 8:234235/149‑1 (MQ=21) ttACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAg > 5:18708/1‑149 (MQ=34) tactacGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGt > 8:141298/1‑64 (MQ=18) tactacGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGt < 7:141298/64‑1 (MQ=18) ctacGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTAt > 3:212610/1‑149 (MQ=34) tacGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTAtt > 7:187740/1‑149 (MQ=21) cGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTgg < 8:269921/149‑1 (MQ=21) cGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTgg > 3:61976/1‑149 (MQ=34) ggCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGt > 8:16575/1‑124 (MQ=35) ggCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGt < 7:16575/124‑1 (MQ=35) gCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATATCCCAGGGTAATTCGGGCGACCTTGCTGCTTATGCCTTTCGGATATACGTAACAGCGTTACGTGCAATTATTGGGc > 1:226657/1‑149 (MQ=11) cGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCttt < 6:247778/148‑1 (MQ=21) ggCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGTGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTg < 3:104642/148‑1 (MQ=21) cTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGc > 4:158684/1‑148 (MQ=21) aCTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTgg < 4:248464/144‑1 (MQ=34) aCTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGATCCGTGCAAGTATTGGGCTTTgg > 3:248464/1‑144 (MQ=21) ttCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc > 7:270239/1‑96 (MQ=37) ttCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc < 8:270239/96‑1 (MQ=37) ttCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGTCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGAtt < 3:304353/147‑1 (MQ=21) ttCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtg > 1:10154/1‑149 (MQ=21) ttCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGATCGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGGTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGAttt > 1:189205/1‑149 (MQ=255) ttCTGCAAGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGAGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATATCCCAGGGTAATTCGCGCGAACTTCCTGCTAATGTCTGTCGGATCTACGTCACAGCATTCCGTGCAAGTAATGGCCTTTGgagaat > 4:304353/1‑145 (MQ=11) cTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTgg > 7:252672/1‑140 (MQ=34) cTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTgg < 8:252672/140‑1 (MQ=34) tGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGc > 5:198671/1‑149 (MQ=21) gCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTAATCGGCTTTGGCGATTTGTGc > 5:285780/1‑148 (MQ=255) cACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGcc < 1:34589/148‑1 (MQ=21) cACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCa > 6:175796/1‑149 (MQ=21) cGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAcc > 4:308456/1‑149 (MQ=21) | GCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGA‑CGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACC > NC_002947/4348593‑4348848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |