| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,482,750 | T→A | 6.7% | A252A (GCT→GCA) | PP_3974 → | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,482,750 | 0 | T | A | 6.7% | 227.6 / 3.8 | 74 | A252A (GCT→GCA) | PP_3974 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/32); new base A (2/3); total (39/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
GATTACCGATCCCTTCGCTGAGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGAAAGTCCTGGC > NC_002947/4482603‑4482892 | gATTACCGATCCCTTCGCTGAGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTa > 8:242686/1‑149 (MQ=255) cGATCCCTTCGCTGAGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTgcgg < 3:142355/149‑1 (MQ=255) tCCCTTCGCTGAGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCAATAgcggcac < 6:159999/149‑3 (MQ=255) ccTTCGCTGAGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGc < 6:137192/149‑1 (MQ=255) cTTCGCTGAGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGcc > 5:135425/1‑149 (MQ=255) tGAGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCGTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGtt > 7:169173/1‑149 (MQ=255) aGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGtt < 8:169173/147‑1 (MQ=255) ggTCAGGAATGGGTTTCCTACTCGGGAGGGTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAATCTACGTCGTATGTGGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTAGCGCAGTGATTCCGTGGCGGCAGGAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTg < 4:51669/148‑1 (MQ=255) gTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGt > 4:266797/1‑149 (MQ=255) gTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGGGCCCTCTGAGATTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTTGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGt < 7:89304/149‑1 (MQ=255) aTGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTtcctcc < 7:242686/149‑1 (MQ=255) ggTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCt < 6:135425/149‑1 (MQ=255) gTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTg > 1:179273/1‑149 (MQ=255) gTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTg > 8:268450/1‑149 (MQ=255) tATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGc < 8:197382/149‑1 (MQ=255) aTCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCa > 8:146574/1‑149 (MQ=255) tACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACTGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTgg < 8:281535/131‑1 (MQ=255) tACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACTGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTgg > 7:281535/1‑131 (MQ=255) tACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCt > 8:39148/1‑149 (MQ=255) tACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCt > 3:250091/1‑149 (MQ=255) tACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCt > 3:234500/1‑149 (MQ=255) tCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTATAATGTCGGGTGCCCTCTGAGCTTATTTCTTACCGCACTGCTTCCGTGGAGTCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTTGTTTCATACCCTGCATGCAggg > 6:251536/1‑149 (MQ=255) gggAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCt < 2:161496/144‑1 (MQ=255) gggAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCt > 1:161496/1‑144 (MQ=255) gggAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGc < 2:179273/148‑1 (MQ=255) gAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGa > 1:187690/1‑148 (MQ=255) gAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGAc < 2:267428/149‑1 (MQ=255) gCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACAt > 7:162674/1‑148 (MQ=255) tGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGAtt < 4:273773/148‑1 (MQ=255) caacaaGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGa < 7:39148/149‑1 (MQ=255) aacaaGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAg > 2:9314/1‑149 (MQ=255) cTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGACGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGTTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGa < 4:230279/142‑1 (MQ=255) cTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGACGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGa > 3:230279/1‑142 (MQ=255) tCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAgtg < 7:268450/149‑1 (MQ=255) aaTGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAgtggtg < 4:234500/149‑1 (MQ=255) cccTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATGCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCa < 2:300342/149‑1 (MQ=255) ccTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAg > 1:324653/1‑149 (MQ=255) cTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGc < 5:184176/123‑1 (MQ=255) cTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGc > 6:184176/1‑123 (MQ=255) cTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGACGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAg > 8:224757/1‑148 (MQ=255) tCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGAATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGa > 7:30544/1‑149 (MQ=255) gAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGAATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGa < 8:30544/149‑1 (MQ=255) cTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGt > 1:117096/1‑148 (MQ=255) ttATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTtg > 7:225275/1‑149 (MQ=255) ttATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGCGCCTGGGATTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGAGGTGCAGGAGCTACAGCATGAGTtg > 2:270093/1‑149 (MQ=255) aTTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTtgt < 4:250091/148‑1 (MQ=255) aTTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGACTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTtgtg > 5:117142/1‑149 (MQ=255) tttCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTgg < 7:289200/149‑1 (MQ=255) aCCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGgctgct < 5:215121/148‑1 (MQ=255) gCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGgctgc > 8:290565/1‑144 (MQ=255) gCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGgctgc < 7:290565/144‑1 (MQ=255) gCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTcacc < 3:266797/149‑1 (MQ=255) cACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTcaccc > 8:6768/1‑149 (MQ=255) tGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTcacccac > 7:36087/1‑148 (MQ=255) tGATTCCATGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGGGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTcacccac > 2:79946/1‑148 (MQ=255) aTTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACccacca < 2:187690/148‑1 (MQ=255) aTTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAg > 1:87031/1‑149 (MQ=255) tCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGa > 7:174405/1‑149 (MQ=255) gTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAg > 1:100070/1‑123 (MQ=255) gTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAg < 2:100070/123‑1 (MQ=255) ggcggcAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCCTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACAt > 6:279152/1‑147 (MQ=255) cggcAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGa < 2:87031/149‑1 (MQ=255) gcagcaAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGa > 8:130767/1‑147 (MQ=255) gcaAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCCGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGAAAGTc > 3:163363/1‑149 (MQ=255) gcaAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGAAAGTc < 2:324653/149‑1 (MQ=255) gcccgCCGCAATAGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGa < 3:235384/131‑1 (MQ=255) gcccgCCGCAATAGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGa > 4:235384/5‑135 (MQ=255) aGTGCCGCTATTTCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCGCTGCATGCTGGGCTACATTACCCGCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATTAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGAAAGTCCTg < 3:105906/149‑1 (MQ=255) ccgCCGCAATAGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTgg > 8:208787/3‑116 (MQ=255) ccgCCGCAATAGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTgg < 7:208787/114‑1 (MQ=255) tGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGgctg > 2:128457/1‑118 (MQ=255) tGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGgctg < 1:128457/118‑1 (MQ=255) tGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGAAAGTCCTGGc < 8:174405/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGAAAGTCCTGGc > 5:187184/1‑149 (MQ=255) | GATTACCGATCCCTTCGCTGAGGGTCAGGCATGGGTATCCTACTCGGGAGGCTTGTGCGGTTTGAAGGCAACAAGCTACGTCGAATGTCGGGTGCCCTCGGAGCTTATTTCTTACCGCACTGATTCCGTGGCGGCAGCAAGTGCCGCTATTGCGGCGGGCCTGGGTTTTGGTTTCCTCCCCTGCATGCTGGGCGACATTACCCCCGGATTGGTTCGAGCCGGCCCAGTGGTGCAGGAGCTTCAGGATGAGTTGTGGCTGCTCACCCACCAGGACATCAGAAAGTCCTGGC > NC_002947/4482603‑4482892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |