Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,747,374 | T→G | 6.9% | M130L (ATG→CTG) ‡ | etfB ← | electron transfer flavoprotein subunit beta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,747,374 | 0 | T | G | 6.9% | 266.7 / 8.9 | 87 | M130L (ATG→CTG) ‡ | etfB | electron transfer flavoprotein subunit beta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/39); new base G (4/2); total (46/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.50e-01 |
GTCGGTGGTGACGATCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGATGGCACGGTCG > NC_002947/4747231‑4747522 | gTCGGTGGTGACGATCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGc < 7:114117/149‑1 (MQ=255) gtggtgACGATCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGATGCTGGCCgcg < 1:118903/149‑3 (MQ=255) gtgACGATCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCACCGACTACGACCTTCCACGCAAAGCTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTATg > 2:98708/1‑149 (MQ=255) aCGATCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGgtt < 5:39192/149‑1 (MQ=255) gATCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGgttgt > 5:246996/1‑149 (MQ=255) gATCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGgttgt > 1:288342/1‑149 (MQ=255) aTCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGgttgtt < 7:89101/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGgtt > 4:260998/1‑145 (MQ=255) tCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGgtt < 3:260998/145‑1 (MQ=255) tCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGttgttg < 2:23870/149‑1 (MQ=255) gcaggcagGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTc < 6:172112/149‑1 (MQ=255) gcaggTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTg > 1:210458/1‑149 (MQ=255) gcaggTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTg > 1:215007/1‑149 (MQ=255) gcaggTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCACTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTg > 5:280395/1‑149 (MQ=255) gcaggTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCAAGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTg > 4:185074/1‑149 (MQ=255) gcaggTTCAGTGCAACGGTCTGCACGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGATTCTCGCCAGCGACATCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGCGCGAAGCCACTCAGCGCGGCCACAATCTCGCCGGTCTGGTTGTTCTCACTg > 4:77993/1‑149 (MQ=255) gaGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGTGAGTTGGACCTTGGTCGCTAAGTTACCGTGTGCGAAGCCTGTCAGCGCGGCCTGCTTCTGGCGGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATg < 1:98708/147‑1 (MQ=255) cAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATg < 3:77993/148‑1 (MQ=255) aGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGc > 6:123056/1‑149 (MQ=255) tGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCt > 1:40361/1‑149 (MQ=255) aaCGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCt > 8:29909/1‑149 (MQ=255) aaCGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCt > 6:50508/1‑149 (MQ=255) aaCGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCAAGCATCTGGCCGGTATGGTAGTTGTCACTGTCGATGTCCTTCt > 5:92167/1‑149 (MQ=255) ggTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGc > 4:191205/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAg > 4:251565/1‑148 (MQ=255) cAGGCCGCCATCTATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGa < 5:58527/146‑1 (MQ=255) ggCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATg < 2:40361/149‑1 (MQ=255) gccgccATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGa < 7:29909/149‑1 (MQ=255) cgccATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGAc > 6:531/1‑148 (MQ=255) gccATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGAc > 1:174727/1‑147 (MQ=255) aTCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCt < 2:174727/149‑1 (MQ=255) tttCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGgc < 2:105721/149‑1 (MQ=255) cACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGgctg < 3:251565/148‑1 (MQ=255) aCGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGTCTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGgctgct > 6:259321/1‑149 (MQ=255) gggTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTcc > 4:243451/1‑149 (MQ=255) gTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCtt > 7:28638/1‑149 (MQ=255) aTTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa > 8:132250/1‑149 (MQ=255) aTTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa > 2:229238/1‑149 (MQ=255) aTTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa < 5:123056/149‑1 (MQ=255) aTTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa < 3:84548/149‑1 (MQ=255) ttAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa > 8:152733/1‑148 (MQ=255) gCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGGCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACg < 3:185074/149‑1 (MQ=255) gCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACg < 5:50508/149‑1 (MQ=255) ttGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGc > 3:96509/1‑149 (MQ=255) ttGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACACTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACgg > 5:178498/1‑148 (MQ=255) ttGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTAACCTGGGCGAAGCAAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCATCTGCGGCTGCTACTTGTCGACAACGGc > 5:182937/1‑149 (MQ=255) gTCTCCAGCGACTTCTTAGCTGTACTCAAAGGTACCGTGGTCGAAGCCAGTCTGCGCGGCCAGCAGCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTGACTGTCGATGGCCTGGTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACgggg < 4:245090/148‑3 (MQ=255) gTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa > 4:105645/1‑140 (MQ=255) gTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa < 3:105645/140‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGcc < 6:280395/148‑1 (MQ=255) gCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCa < 1:229238/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCa < 7:132250/149‑1 (MQ=255) cTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTg < 3:191205/149‑1 (MQ=255) ttCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTgg > 2:267551/1‑149 (MQ=255) gACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCa < 3:243451/149‑1 (MQ=255) gCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGa < 5:259321/149‑1 (MQ=255) gCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGa < 7:152733/149‑1 (MQ=255) aaaGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCtt > 7:135630/1‑78 (MQ=255) aaaGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCtt < 8:135630/78‑1 (MQ=255) aaaGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGagt > 8:106028/1‑149 (MQ=255) cccTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGagttcagtt < 7:106028/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGagtt > 5:147720/1‑142 (MQ=255) ccTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGagtt < 6:147720/142‑1 (MQ=255) ccTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCg > 7:129414/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGt > 5:238520/1‑149 (MQ=255) 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gcgcGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAg > 8:135521/1‑148 (MQ=255) gaccgGCCAGATGCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAg > 1:20610/4‑148 (MQ=255) cgcgGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa > 6:267059/1‑86 (MQ=255) cgcgGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGa < 5:267059/86‑1 (MQ=255) accgGCCAGATGCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGa > 7:26505/3‑149 (MQ=255) accgGCCAGATGCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGa > 7:219893/3‑149 (MQ=255) ccgGCCAGATGCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGAt > 5:129609/2‑149 (MQ=255) cgGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGATg < 2:90453/149‑1 (MQ=255) ccAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGATGGCa < 1:87691/149‑1 (MQ=255) cAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGATGGCAc > 4:158769/1‑149 (MQ=255) gCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGATGGCACg > 5:316718/1‑148 (MQ=255) aTCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGATGGCACGGTc < 2:288342/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGATGGCACGGTCg > 2:287289/1‑149 (MQ=255) | GTCGGTGGTGACGATCGCAGGCAGGTTCAGTGCAACGGTCTGCAGGCCGCCATCGATTTCACGGGTGACATTAAGCTTGTCGCCAGCGACTTCGACCTTGGACGCAAAGGTACCCTGGGCGAAGCCAGTCAGCGCGGCCAGCATCTGGCCGGTCTGGTTGTTGTCACTGTCGATGGCCTGCTTGCCGAGGATGACCAGCTGCGGCTGCTCCTTGTCGACAACGGCCTTCAGCGCCTTGGCCACGGCCAGGGAGTTCAGTTCGTCAGCGGCTTCTACCAGGATGGCACGGTCG > NC_002947/4747231‑4747522 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |