Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,787,349 | A→G | L429P (CTG→CCG) | PP_3350 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,787,349 | 0 | A | G | 100.0% | 117.5 / NA | 35 | L429P (CTG→CCG) | PP_3350 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (17/18); total (17/18) |
CATGTGTGGCCCTCTGTTGTTGTTATCGGTCGGGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCAGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGC > NC_002947/3787206‑3787490 | cATGTGTGGCCCTCTGTTGTTGTTATCGGTCGGGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGtt < 2:234810/148‑1 (MQ=255) cATGTGTGGCCCTCTGTTGTTGTTATCGGTCGGGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTg < 8:144638/149‑1 (MQ=255) aTGTGTGGCCCTCTGTTGTTGTAATCGGTCGGGTGGTCAATGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCGGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTgg < 5:111500/149‑1 (MQ=255) tgtgGCCCTCTGTTGTTGTTATCGGTCGGGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGa < 6:281304/148‑1 (MQ=255) cccTCTGTTGTTGTTATCGGTCGGGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGAGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGc > 1:82428/1‑148 (MQ=255) gttgttgttATCGGTCGGGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAg > 1:179643/1‑149 (MQ=255) gttATCGGTCGGGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGt < 2:82428/148‑1 (MQ=255) gtcggGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGgcgc < 6:226544/149‑1 (MQ=255) gtcggGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCACGCGCTGgctt < 2:179643/149‑3 (MQ=255) gtggtCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCgg > 8:144437/1‑146 (MQ=255) ggAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACa > 5:195723/1‑149 (MQ=255) aaCGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATg < 7:144437/149‑1 (MQ=255) agaCAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCgg < 6:195723/149‑1 (MQ=255) acgacgAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTg > 7:220791/1‑149 (MQ=255) cgaATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCgg > 8:299083/1‑106 (MQ=255) cgaATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCgg < 7:299083/106‑1 (MQ=255) cgccgcCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGa < 3:180307/111‑1 (MQ=255) cgccgcCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGa > 4:180307/1‑111 (MQ=255) ccgccAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCACGCGCTGgctt < 7:339188/94‑3 (MQ=255) ccgccAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCACGCGCTGgctt > 8:339188/1‑92 (MQ=255) aGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGGTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGgt < 1:258510/126‑1 (MQ=255) aGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGgt > 2:258510/1‑126 (MQ=255) 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cAGGTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCcaca > 3:168909/1‑149 (MQ=255) gTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATg > 4:144236/1‑115 (MQ=255) gTCAAGGTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATg < 3:144236/115‑1 (MQ=255) gTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTc > 6:330960/1‑120 (MQ=255) gTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTc < 5:330960/120‑1 (MQ=255) gTCCAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCg > 8:104459/1‑145 (MQ=255) cAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGc < 6:92379/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCGGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGc > 5:170483/1‑149 (MQ=255) | CATGTGTGGCCCTCTGTTGTTGTTATCGGTCGGGTGGTCAAAGGCGGAACGTGGCGCGTACTGAGACAAACGACGAATCTTCGCCGCCAGCCTCCTTGATGGCCGTGCCCACGTCGTAGTACTTCAGGTCAAGGTCCAGGGTCAGGTTGGGAGTGGCAAGCCAGCGCGTGCTGGCGCGGTAGATGGTACCGACATGGCGACCCGTGCCGCGGGTGTTGGCCAGCATGCTCATGCCGGGCATGTACACGCCGTCTTCCTCACGCTGTTTCCACACTTCGAAGATGC > NC_002947/3787206‑3787490 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |