Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,304,814 | Δ1 bp | 5.7% | coding (2438/3483 nt) | recC ← | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,304,814 | 0 | T | . | 5.7% | 225.8 / 6.4 | 70 | coding (2438/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/34); new base . (2/2); total (34/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 |
CGCAAGAAGTCATTCAGCTGGTGCAGACTCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCA > NC_002947/5304673‑5304961 | cgcAAGAAGTCATTCAGCTGGTGCAGACTCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGaa < 3:16203/149‑1 (MQ=255) cgcAAGAAGTCATTCAGCTGGTGCAGACTCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTCCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGaa < 1:237869/149‑1 (MQ=255) aagaagTCATTCAGCTGGTGCAGACTCAGGGCTTCACCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCGGGTGCAGCTCCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGgtagta < 4:138401/149‑1 (MQ=255) aTTCAGCTGGTGCAGACTCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGc < 3:290287/149‑1 (MQ=255) ttCAGCTGGTGCAGACTCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCt > 5:126870/1‑149 (MQ=255) ttCACCTGGTGCAGACTCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGc > 2:273530/1‑148 (MQ=255) tCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCggg > 2:48559/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCC‑TCTGGAAGTACCGAggg > 1:229488/1‑130 (MQ=255) tCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCC‑TCTGGAAGTACCGAggg > 1:233451/1‑130 (MQ=255) tCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCC‑TCTGGAAGTACCGAggg < 2:233451/130‑1 (MQ=255) tCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCC‑TCTGGAAGTACCGAggg < 2:229488/130‑1 (MQ=255) aGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGGTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCggg < 4:56630/147‑1 (MQ=255) aGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAg > 8:87332/1‑143 (MQ=255) aGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAg < 7:87332/143‑1 (MQ=255) aGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTg > 1:139293/1‑149 (MQ=255) ggCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAggg > 6:1018/1‑127 (MQ=255) ggCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAggg < 5:1018/127‑1 (MQ=255) ggCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCt > 5:243712/1‑149 (MQ=255) gCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGt < 2:211059/149‑1 (MQ=255) tCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAg > 3:189317/1‑149 (MQ=255) tGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAgtgc > 6:30972/1‑149 (MQ=255) aTAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAgtgcgt < 1:47746/149‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCaa > 7:157967/1‑149 (MQ=255) gcAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGt > 5:75106/1‑149 (MQ=255) aGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGc > 8:250180/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCt < 6:243712/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGATGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCg > 6:39670/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCg > 1:112496/1‑149 (MQ=255) cGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACTTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTgg < 8:155576/124‑1 (MQ=255) cGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACATGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTgg > 7:155576/1‑124 (MQ=255) gctcTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCgg < 8:157967/147‑1 (MQ=255) tGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTcgc > 5:297616/1‑149 (MQ=255) cgcgTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCgg < 2:139293/149‑1 (MQ=255) gtctgtctCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCt > 6:46173/1‑149 (MQ=255) tctgtctCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTg < 2:145640/149‑1 (MQ=255) tctcACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGccc > 3:118833/1‑149 (MQ=255) tctcACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGccc > 5:175571/1‑149 (MQ=255) tctcACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGcc < 4:254633/148‑1 (MQ=255) aCCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCctg < 6:126870/147‑1 (MQ=255) aCCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGACATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCctgct > 8:46085/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGt > 5:277390/1‑116 (MQ=255) ccTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGt < 6:277390/116‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCtgctgc < 7:46085/149‑1 (MQ=255) ctgGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGt > 2:20314/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGt < 1:101102/109‑1 (MQ=255) gTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGt > 2:101102/1‑109 (MQ=255) gTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCg < 5:46173/148‑1 (MQ=255) cagcaCCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACGGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGcc > 2:17622/1‑148 (MQ=255) cagcaCCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGcc < 4:118833/148‑1 (MQ=255) caCCTGCCATTCATGGGCATTGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTgcgc > 6:153397/1‑138 (MQ=255) caCCTGCCATTCATGGGCATTGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTgcgc < 5:153397/138‑1 (MQ=255) caCCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAAt < 1:273530/149‑1 (MQ=255) caCCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAAt < 5:30972/149‑1 (MQ=255) ccATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCa < 4:189317/147‑1 (MQ=255) ccATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGc < 6:75106/149‑1 (MQ=255) cATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGcc > 3:7180/1‑149 (MQ=255) cATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGACCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCGGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGcc > 6:8734/1‑149 (MQ=255) aTTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCa < 2:85189/145‑1 (MQ=255) aTTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCa > 1:85189/1‑145 (MQ=255) gCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGAt < 1:20314/149‑1 (MQ=255) cTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGc > 6:79257/1‑106 (MQ=255) cTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGc < 5:79257/106‑1 (MQ=255) cTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATc < 6:297616/149‑1 (MQ=255) cTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATc < 4:7180/149‑1 (MQ=255) aaCAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATcgcg > 5:287004/1‑149 (MQ=255) aaCAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATc < 5:283750/146‑1 (MQ=255) aaCAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATc > 6:283750/1‑146 (MQ=255) ccTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGACCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGAt > 3:25080/1‑148 (MQ=255) cTTCTGGATGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCa < 5:39670/149‑1 (MQ=255) cTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCa < 6:175571/149‑1 (MQ=255) | CGCAAGAAGTCATTCAGCTGGTGCAGACTCAGGGCTTCAGCGTCCTGATAAGGCGGCAAGCCCGGCTCGCTCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCA > NC_002947/5304673‑5304961 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |