Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,726,809 | Δ1 bp | 12.3% | coding (157/2574 nt) | opgH ← | glucans biosynthesis glucosyltransferase H |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,726,809 | 0 | C | . | 12.3% | 169.8 / 18.2 | 57 | coding (157/2574 nt) | opgH | glucans biosynthesis glucosyltransferase H |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (22/28); new base . (3/4); total (25/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCCATGGCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGAG > NC_002947/5726662‑5726957 | gcCATGGCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACg > 7:277108/1‑149 (MQ=255) gCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCg < 5:93413/149‑1 (MQ=255) cTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCgg < 2:6560/149‑1 (MQ=255) cTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCgg < 2:293955/149‑1 (MQ=255) tCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCGCCGAGGC‑CGTGCA‑GGCCTCggg > 8:56327/1‑148 (MQ=255) gggCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCGCCGAGGCAG‑TGCA‑GGCCTCggtgg < 7:170969/149‑4 (MQ=255) gggCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCGCCGAGGC‑CGTGCA‑GGCCTCggtgg < 7:56327/149‑4 (MQ=255) gggCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑CGTGCA‑GGCCTCggt < 4:301277/147‑2 (MQ=255) ggCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCa > 6:90745/1‑147 (MQ=255) ggCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCa < 5:90745/147‑1 (MQ=255) cGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTg < 2:269687/149‑1 (MQ=255) gCGTTTGATCGGAGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCAGTTCGGCTTCTTCAAGCTCGGCGGCGCTGCCAACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCAGCAGAGCTGCCGGCCGGGt > 5:218681/1‑149 (MQ=255) tGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCgg < 3:107947/126‑1 (MQ=255) tGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGgc < 6:5074/148‑1 (MQ=255) gATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGt > 7:16848/1‑143 (MQ=255) gATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGt < 8:16848/143‑1 (MQ=255) tCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGGCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGgccgcc < 5:158033/149‑1 (MQ=255) cggGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGc < 8:277108/149‑1 (MQ=255) cggGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGc < 1:182367/149‑1 (MQ=255) cggGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGACCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGc < 2:308629/149‑1 (MQ=255) ggCGTTCTTCAGGCACAGGCGGCCGGTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGtt < 6:226089/149‑1 (MQ=255) ggCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGtt < 7:235626/149‑1 (MQ=255) gCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGGTg > 7:151535/1‑149 (MQ=255) cAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGgt < 2:203152/143‑1 (MQ=255) ggCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑AGCACCGCCTCGGCAGAGCAGGCCGCCGGGTTGGCCCCCCAGCGTTGGTGTAGCTc > 2:146090/1‑148 (MQ=255) aGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCACAGCTGGCGGCCGCGTTGGCCGCCAACCGTTCGTGTAGCTCACTGaa > 5:131511/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTg > 6:255493/1‑149 (MQ=255) ccGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGc < 5:255493/148‑1 (MQ=255) gAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCt > 7:237056/1‑146 (MQ=255) gAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCt < 8:237056/146‑1 (MQ=255) ttcCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCGCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGGTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCACCTGGCAAGCAAAGCCCCCTGCTCGTCGc > 2:177437/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCt > 3:131968/1‑148 (MQ=255) ccAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCt > 2:84388/1‑148 (MQ=255) ccAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGGTGGCCGCCAAGCGGTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCt > 5:11959/1‑148 (MQ=255) cAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCCCGGCCGCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCCAGCGTTGGTGTAGCTCACTGCACGCGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCt > 7:170065/1‑147 (MQ=255) cggcggCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGt < 1:84388/149‑1 (MQ=255) ggcggcGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCtcgt < 3:115673/137‑1 (MQ=255) ggcggcGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGt < 1:177437/148‑1 (MQ=255) gcgcTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTg > 6:300018/1‑149 (MQ=255) cccACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCACTCAGTGGTAGGTGGGCCAg > 3:214181/1‑149 (MQ=255) cACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGt < 1:146090/149‑1 (MQ=255) cACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCCTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCACCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCGCAGTGGTAGGTGGGCGAgg > 2:269641/1‑148 (MQ=255) cGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCACTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTAc < 4:214181/149‑1 (MQ=255) gcgGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGc < 8:151535/149‑1 (MQ=255) ggCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGAt < 3:231534/149‑1 (MQ=255) ctgccGAGGC‑CGTGCA‑GGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCaa > 7:213116/4‑141 (MQ=255) ctgccGAGGC‑CGTGCA‑GGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCaa < 8:213116/138‑1 (MQ=255) cACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCg > 4:134557/1‑149 (MQ=255) ccGAGGC‑CGTGCA‑GGCCTCGGTAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGc > 6:142990/1‑149 (MQ=255) ccGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGc > 5:45353/1‑149 (MQ=255) c‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGc > 5:4601/1‑117 (MQ=255) c‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGc < 6:4601/117‑1 (MQ=255) c‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTgcgc > 6:77184/1‑149 (MQ=255) gCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGAtt > 4:284/1‑135 (MQ=255) gCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGAtt < 3:284/135‑1 (MQ=255) aCGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGa < 5:300018/149‑1 (MQ=255) aCGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGa < 8:170065/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGAg < 6:11959/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGAg < 4:131968/149‑1 (MQ=255) | GCCATGGCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGC‑C‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTTGCGCTTGAG > NC_002947/5726662‑5726957 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |