| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,674,750:1 | +G | 100% | intergenic (+112/+28) | rhlE‑II → / ← yceI | ATP‑dependent RNA helicase/polyisoprene‑binding acidic stress response factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,674,750 | 1 | . | G | 100.0% | 312.9 / NA | 91 | intergenic (+112/+28) | rhlE‑II/yceI | ATP‑dependent RNA helicase/polyisoprene‑binding acidic stress response factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (52/39); total (52/39) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGC‑GCGCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCA > NC_002947/5674612‑5674892 | ccAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCg > 1:112770/1‑149 (MQ=255)ccAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCg > 2:232235/1‑149 (MQ=255) aGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCATGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGt > 5:15575/1‑149 (MQ=255) ctgctgACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTc < 7:201637/149‑1 (MQ=255) aCCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCt < 8:257345/147‑1 (MQ=255) ccGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTgg > 4:66767/1‑147 (MQ=255) gggCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGtttt > 5:685/1‑134 (MQ=255) gggCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGtttt < 6:685/134‑1 (MQ=255) gCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTAc > 2:8692/1‑149 (MQ=255) gAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGc < 2:112770/148‑1 (MQ=255) aaGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGAGCTCTACAGGAGCGGCCTTGGGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTGTCAGCTGGCAGAACTTACTTCTgggt > 5:233136/1‑146 (MQ=37) tACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTca > 6:303140/1‑148 (MQ=255) cGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCac‑ac > 4:283813/1‑148 (MQ=255) cGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑Acc > 3:67958/1‑149 (MQ=255) aGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCTCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCtt < 2:70716/149‑1 (MQ=255) aGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAGAAATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCt > 1:76279/1‑149 (MQ=38) gggggCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTc < 5:253061/149‑1 (MQ=255) ggCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATCGGGCCGCAAAGCGGCCCCCGCGGGTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGac > 3:49892/1‑149 (MQ=38) ctgctTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGacac < 5:303140/149‑1 (MQ=255) ctTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGa > 6:175493/1‑149 (MQ=255) ttCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGa > 4:236342/1‑148 (MQ=255) cGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGatat > 6:55980/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATAtc < 3:66767/149‑1 (MQ=255) cAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATAtcc < 5:55980/149‑1 (MQ=255) aGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATAtc > 2:48872/1‑147 (MQ=255) gCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCATGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATAtccag < 6:15575/149‑1 (MQ=255) cccTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATAtccagg < 5:237820/149‑1 (MQ=255) tCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAgc‑ggc > 3:235567/1‑80 (MQ=255) tCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAgc‑ggc < 4:235567/82‑3 (MQ=255) tCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATAtccaggtccag > 8:177131/1‑149 (MQ=255) tCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATAtccaggtccag > 2:20254/1‑149 (MQ=255) aCGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATAtccaggtccagg < 3:283813/148‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCGGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCCGCCTAGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCCGTTTTCACCTGGCAGAAATTAAGACTGCTTCCC‑ACAATCGACACTGATATACAGGTCCAGGGTc > 4:11637/1‑149 (MQ=255) cacaAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGGTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTGAC‑ACCATCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTg > 5:51157/1‑149 (MQ=38) acaAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGc > 2:191348/1‑149 (MQ=255) acaAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGc > 5:146858/1‑149 (MQ=255) acaAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGc > 4:76379/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCg > 6:126959/1‑148 (MQ=255) aaGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCg < 5:126959/148‑1 (MQ=255) aGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGaa < 1:191348/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAg > 2:238664/1‑149 (MQ=255) gccgccCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGt < 7:238076/149‑1 (MQ=255) gCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGt < 1:232235/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTa < 4:122158/149‑1 (MQ=255) ccGCTCAAGCAGAG‑AATTTCTTCATCTCTACAGGAGCGGCCATCTCTCGTGATAGGGCCGCAAACCGGCCCCCTCCGTTTTCAGCTGGCACAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTACGCCACACAAAACCACGACCAGCGTATGCGAAGTa > 8:289092/1‑149 (MQ=255) 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tCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCACAACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGa < 1:238664/148‑1 (MQ=39) cTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGc > 3:227469/1‑149 (MQ=255) tGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGcc < 6:52504/148‑1 (MQ=255) gctcgctACCGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCTACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGCAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCg < 6:233136/143‑1 (MQ=38) aTCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCg > 5:24102/1‑147 (MQ=255) 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tAGGGCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGt < 7:289092/149‑1 (MQ=255) gggCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTg < 1:48872/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCACAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGCAGTCGTTCAGGTTCAGAGTGGTGGTGGCGTTg > 6:49597/1‑148 (MQ=255) gCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCgttcaggtt < 8:272103/128‑1 (MQ=255) gCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCgttcaggtt > 7:272103/1‑128 (MQ=255) gCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTg > 6:34604/1‑147 (MQ=255) gCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTg > 6:30081/1‑147 (MQ=255) gCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGaa < 8:231404/149‑1 (MQ=255) gCCGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGaa < 3:236342/149‑1 (MQ=255) ccGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCACCCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGaa < 1:234842/149‑1 (MQ=255) cGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGc > 1:187398/1‑149 (MQ=255) cGCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGc > 2:31437/1‑149 (MQ=255) gCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGc > 2:71255/1‑148 (MQ=255) gCAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGc > 3:147394/1‑148 (MQ=255) cAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGc > 6:190530/1‑128 (MQ=255) cAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGc < 5:190530/128‑1 (MQ=255) cAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCa < 1:71255/149‑1 (MQ=255) cAAAGCGGCCCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCa < 4:218381/149‑1 (MQ=255) | CCAGCGCTGCTGACCCGCAAGGGCTGATAGAAGTACCGAGGGGGCTGCTTCGCAGCCCTATCACGACACAAGGCCGCTCCTGCAGAG‑AATTTCTTGATCTCTACAGGAGCGGCCTTGTGTCGTGATAGGGCCGCAAAGC‑GCGCCCTCGGTTTTCAGCTGGCAGAAATTACTTCTGCTTCAC‑ACCTTCGACACTGATATCCAGGTCCAGGGTCTGCGAAGTAGCA‑CCCGGGCCTTTGATGCCGAAGTCGTTCAGGTTCAGCGTGGTGGTGGCGTTGAAGCCA > NC_002947/5674612‑5674892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |