| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,231,841:1 | +C | 7.4% | coding (872/1545 nt) | glpD ← | aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,231,841 | 1 | . | C | 7.4% | 261.4 / 15.4 | 68 | coding (872/1545 nt) | glpD | aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (36/27); new base C (3/2); total (39/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.61e-01 | |||||||||||
GAAGGGTTGTCCGACTCGTCGTTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGGCGCGGCACGATAATGTGG > NC_002947/1231694‑1231981 | gAAGGGTTGTCCGACTCGTCGTTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCg‑g < 8:31275/149‑1 (MQ=255)gAAGGGTTGTCCGACTCGTCGTTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCg‑g < 8:201901/149‑1 (MQ=255) ttGTCCGACTCGTCGTTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACC‑CGGCCGCGGTcgcc < 2:302341/149‑1 (MQ=255) gACTCGTCGTTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTTGGGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTg > 1:238585/1‑148 (MQ=255) aCTCGTCGTTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTAt < 4:145281/149‑1 (MQ=255) cTCGTCGTTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTAtt > 7:78569/1‑149 (MQ=255) gtcgtTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTccc > 1:179464/1‑149 (MQ=255) gtcgtTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTc < 8:254018/147‑1 (MQ=255) ttGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGt > 7:85305/1‑148 (MQ=255) acaGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAgtg > 6:307970/1‑149 (MQ=255) acaGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAgtg > 2:88958/1‑149 (MQ=255) acaGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGAACGCGGCCG‑GGTAGCCGCTGTATTCCCGGTCCgtg > 3:226162/1‑149 (MQ=255) gCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAgtggtg < 8:78569/149‑1 (MQ=255) cGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTATTGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAgtggt < 2:31938/147‑1 (MQ=255) cGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAgtggtgg > 1:31938/1‑148 (MQ=255) cGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGAt > 7:267459/1‑149 (MQ=255) aCGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAg > 2:89272/1‑149 (MQ=255) aGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAg < 3:32063/149‑1 (MQ=255) tAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAACGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCg < 1:88958/149‑1 (MQ=255) ggTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCgg < 5:169866/148‑1 (MQ=255) aTGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATTGAGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGAGGTc > 3:243811/1‑147 (MQ=255) tGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTc > 6:306704/1‑146 (MQ=255) cAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGa > 6:290563/1‑148 (MQ=255) gATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACg > 6:47221/1‑149 (MQ=255) tCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATc > 8:255633/1‑123 (MQ=255) tCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATc < 7:255633/123‑1 (MQ=255) tCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGa < 1:25741/148‑1 (MQ=255) ggCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATg > 2:250890/1‑148 (MQ=255) gCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCagaaga > 3:112928/1‑149 (MQ=255) cTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGAc < 1:89272/149‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTGTTTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGAc > 1:76267/1‑149 (MQ=255) gtggtTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGGCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATgcgc < 2:238585/148‑1 (MQ=255) gtTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACg > 8:11687/1‑125 (MQ=255) gtTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACg < 7:11687/125‑1 (MQ=255) cTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCt > 5:52236/1‑142 (MQ=255) cTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCt < 6:52236/142‑1 (MQ=255) cGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGCCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGc < 8:267459/149‑1 (MQ=255) acgacCTTCAACATGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGa < 5:71663/147‑1 (MQ=255) acgacCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGAt < 8:203718/113‑1 (MQ=255) acgacCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGAt > 7:203718/1‑113 (MQ=255) acgacCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGa > 6:71663/1‑147 (MQ=255) gacCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATg > 3:172045/1‑148 (MQ=255) gacCTTCAACAGGTAATGTC‑TTTCATGCTCGGTAATGCCGACCCCGCCCG‑GGTCGCAGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTTCCGATCAGGCTAAAGCGTTCCAGATACGCGATGCAGAAAACGATGCGCTGGAATTCATTCTGAATAATg > 6:274704/1‑148 (MQ=255) ccgtCAACAGGTACTGGG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCTACCGCGGCCG‑GGTCGCCGATGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATTCGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGATTGTAg < 4:226162/146‑1 (MQ=255) ccTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAg < 5:307970/149‑1 (MQ=255) ccTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAg > 7:242873/1‑149 (MQ=255) cAACAGTTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCATGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGCTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTTGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCa < 1:250890/148‑1 (MQ=255) cAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGc < 2:179464/147‑1 (MQ=255) aaCAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATg > 2:238196/1‑149 (MQ=255) aGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTc > 6:143002/1‑149 (MQ=255) aTGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCtt < 8:242873/149‑1 (MQ=255) aTGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCtt > 8:202984/1‑149 (MQ=255) tgtg‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCtt > 8:67650/1‑148 (MQ=255) tgtg‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTc < 7:67650/149‑1 (MQ=255) tttCCTGCACGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATa < 7:277906/148‑1 (MQ=255) tGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGgcg > 8:199694/1‑149 (MQ=255) gCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGATCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGgcgc > 7:70463/1‑149 (MQ=255) ggTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGGCGCGGCa > 3:85142/1‑149 (MQ=255) tAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGGCGCGGCAc > 5:14993/1‑148 (MQ=255) agcggCGACC‑CGGCCGCGGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGGCGCGGCACGa > 5:85787/4‑149 (MQ=255) 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4:271129/111‑1 (MQ=255) gACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTa > 3:271129/1‑111 (MQ=255) gACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGGCGCGGCACGATAAtgt > 7:75694/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGGCGCGGCACGATAATGTgg < 5:274704/149‑1 (MQ=255) | GAAGGGTTGTCCGACTCGTCGTTGCACAGCGGCCGAACGCCGGAGTAGGTATGCAGGATGTCGGCTT‑GGCTCAGTTGGTGGTTGAAGTGCTCGTTGACGACCTTCAACAGGTAATGTG‑TTTCCTGCTCGGTAATGGCGACCGCGGCCG‑GGTCGCCGCTGTATTCCCGGTCAGTGGTGCCGATCAGGGTAAAGCGGTCCAGATACGGGATGCAGAAGACGATGCGCTGGTCTTCATTCTGCAGAATGTAGGCATGTTCGCCTTCATACAGGCGCGGCACGATAATGTGG > NC_002947/1231694‑1231981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |