New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 426730 | 57 (1.170) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.6% | coding (1069/2433 nt) | PP_0350 | ferrichrome‑iron receptor |
? | NC_002947 | = 426754 | 46 (0.990) | coding (1045/2433 nt) | PP_0350 | ferrichrome‑iron receptor |
TTCTGGCGGAACTGCCAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTGGGT > NC_002947/426585‑426874 | ttatGGCGGAACTGCCAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTAACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTTGTGCCCTg < 3:189816/146‑1 (MQ=255) tGGCGGAACTGCCAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCt < 5:54522/145‑1 (MQ=255) tGGCGGAACTGCCAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCt > 6:54522/1‑145 (MQ=255) ggAACTGCCAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGc < 1:237220/149‑1 (MQ=255) ggAACTGCCAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGc > 7:206046/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCg < 3:23483/149‑1 (MQ=255) ccAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAAct > 7:27149/1‑149 (MQ=255) ccAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGAGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAAct > 1:170444/1‑149 (MQ=255) cAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGATTAAAGTTGCCGAACGGCATGTAGATATTGGTGCCCTGGATGGGCCGGaaa > 1:102314/1‑148 (MQ=255) aGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGACGGAActgg > 3:91860/1‑149 (MQ=255) gTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGACGTAActggcgta > 7:74340/1‑146 (MQ=255) gATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcac < 7:49101‑M2/149‑6 (MQ=255) aTGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcac > 3:223426‑M2/1‑143 (MQ=255) cGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCaccagccagttccggcccatccagggcaccaag < 7:256128‑M1/149‑34 (MQ=255) cGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGt < 8:148216/149‑1 (MQ=255) ggTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCtggt < 7:114357/139‑1 (MQ=255) ggTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCtggt > 8:114357/1‑139 (MQ=255) ttCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGt > 5:126328/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCaccagccagttccggcccatccagggcaccaa < 2:274267‑M1/141‑33 (MQ=255) cGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCaccagccagttccggcccatccagggcaccaa > 1:274267‑M1/1‑109 (MQ=255) cGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATc > 6:71305/1‑145 (MQ=255) cGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATc < 5:71305/145‑1 (MQ=255) cGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCa > 7:149574/1‑149 (MQ=255) cGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTg < 4:91860/149‑1 (MQ=255) cGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTg < 6:126328/149‑1 (MQ=255) aaCCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAAc > 8:187443/1‑149 (MQ=255) aaCCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAAc > 2:281629/1‑149 (MQ=255) cccAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTgg < 6:95912‑M2/124‑3 (MQ=255) cccAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTgg > 5:95912‑M2/1‑122 (MQ=255) cAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTggg > 8:73085/1‑149 (MQ=255) aGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGt < 7:73085/149‑1 (MQ=255) gcgcGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTg < 8:149574/149‑1 (MQ=255) gcgcGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGCATCGTCACGGGTGAACTGGGTg < 8:27149/149‑1 (MQ=255) cgcgTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGa < 2:170444/149‑1 (MQ=255) gtagtaAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGa < 1:281629/149‑1 (MQ=255) gtaAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGAGGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAg < 8:81791/148‑1 (MQ=255) aGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCATGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCAAGTCGATCTTGGTGCCCAGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTgg < 7:103710‑M2/110‑3 (MQ=255) gTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCa < 3:85315/148‑1 (MQ=255) tGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGc < 4:201472/149‑1 (MQ=255) tGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAAAGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTCGCACCGGTTTCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCa > 4:85315/1‑147 (MQ=255) tCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGTCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGcgtcgt > 4:242633/1‑149 (MQ=255) cTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGt < 8:49101/149‑1 (MQ=255) cTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGt > 8:141542/1‑149 (MQ=255) aTCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGTCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGt > 3:208793/1‑149 (MQ=255) tCCGGGTCACGCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGTGATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGAGTCGTGTCTTCGTCAATGtt > 7:72161/1‑149 (MQ=255) ggTCATCGAGGTTGTTGTGGTGCGA‑‑GATATTGCCGAACGGAATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAg < 4:208793/149‑1 (MQ=255) aCCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAAct < 4:215370/71‑1 (MQ=255) aCCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAAct > 3:215370/1‑71 (MQ=255) ccAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAgg > 6:275423/1‑149 (MQ=255) cAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAg > 3:287505/1‑142 (MQ=255) cAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAg < 4:287505/142‑1 (MQ=255) gTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTg < 5:275423/149‑1 (MQ=255) ttCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTgg < 3:242633/149‑1 (MQ=255) cTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTggg < 7:187443/148‑1 (MQ=255) tgtgGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTATTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGc > 8:113887/1‑148 (MQ=255) gtgCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAAtg < 2:102314/148‑1 (MQ=255) ga‑‑gaTCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTa < 8:206046/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGGTGTAGCGCt > 8:257631/1‑149 (MQ=255) gAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTtgttgt > 3:275528/1‑149 (MQ=255) aaCGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTTTCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTtgttgtt > 1:58037/1‑148 (MQ=255) cATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCa > 4:6809/1‑124 (MQ=255) cATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCa < 3:6809/124‑1 (MQ=255) aTGTCGATCTTTGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCTCGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGAtgtg < 5:107502/149‑1 (MQ=255) aTGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACTGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAATGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGtt < 6:175470/104‑1 (MQ=255) aTGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACTGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGtt > 5:175470/1‑104 (MQ=255) tCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTTTCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTTGATGTGGTc < 2:58037/149‑1 (MQ=255) tCGATATTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGt < 8:72161/148‑1 (MQ=255) aTCTTGGTGCCCTGGATGGGCCTGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTAAGGGTTGGGGCAATGTTGTAGCGATTATTGTCCATTTGGTCGAt > 8:219826/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttactacgcgctgggttacgccttcgaacaccg < 7:256128‑M2/149‑117 (MQ=255) ttGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttactacgcgctgggttacgccttcg < 2:274267‑M2/141‑110 (MQ=255) ttGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttactacgcgctgggttacgccttcg > 1:274267‑M2/1‑32 (MQ=255) gTGCCaccagccagttccggcccatccagggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttactacgcgctgggttacgccttcgaacaccgcatc < 7:49101‑M1/149‑145 (MQ=255) gTGCCaccagccagttccggcccatccagggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttactacgcgctgggttacgccttcgaacaccgcat > 3:223426‑M1/1‑5 (MQ=255) ccaccagccagttccggcccatcctgggcaccaagatcgacttgccgttcggcaagatctcgcaccacatgaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcact < 7:103710‑M1/110‑109 (MQ=255) ccaccagccagttccggcccatccagggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttactacgcgctggg < 6:95912‑M1/124‑123 (MQ=255) ccaccagccagttccggcccatccagggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttactacgcgctggg > 5:95912‑M1/1‑2 (MQ=255) | TTCTGGCGGAACTGCCAGACGTCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGA‑‑GATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTGGGT > NC_002947/426585‑426874 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |