New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 455472 | 44 (0.900) | 4 (0.090) | 4/248 | NT | 8.0% | coding (1183/1839 nt) | PP_0375 | prolyl oligopeptidase family protein |
? | NC_002947 | = 455551 | 50 (1.080) | coding (1104/1839 nt) | PP_0375 | prolyl oligopeptidase family protein |
TCGGCCACGTCACTTTCGCCCCAGCGCAGGTGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGTATTTC > NC_002947/455324‑455619 | tCGGCCACGTCCCTTTCGCCCCAGCGCCGGTGCAGTGCCTGGCGGTAGTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCCGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGC < 8:293296‑M1/149‑1 (MQ=255) tCGGCCACGTCACTTTCGCCCCAGCGCAGGTGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGC > 1:205039‑M1/1‑149 (MQ=255) cACGTCACTTTCGCCCCAGCGCAGGTGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAgg < 6:203903/149‑1 (MQ=255) gTCACTTTCGCCCCAGCGCAGGTGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTg > 7:53741/1‑149 (MQ=255) tCACTTTCGCCCCAGCGCAGGTGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTgg < 5:133975/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGaa < 5:309209/149‑1 (MQ=255) gcAGGTGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGaa > 5:311865/1‑148 (MQ=255) tGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAAcaccac < 1:269131/149‑1 (MQ=255) cGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTgcggc > 5:245638/1‑149 (MQ=255) tATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGcc > 1:255330/1‑149 (MQ=255) tCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGGCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTg > 7:148714/1‑149 (MQ=255) cccGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCccatggtttcttctacccgccagcgcagccgcaaggcgccgcaccgctg > 1:181195‑M1/1‑100 (MQ=255) ccGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCg > 2:107904/1‑149 (MQ=255) cATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTgc < 5:67763/149‑1 (MQ=255) cATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATCAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTgc > 2:96801/1‑149 (MQ=255) aTAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTgcg < 6:70445/149‑1 (MQ=255) tgctgcCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCggg < 6:311865/149‑1 (MQ=255) ctgcCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTa < 8:53741/149‑1 (MQ=255) gcCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAac > 2:29077/1‑106 (MQ=255) gcCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAac < 1:29077/106‑1 (MQ=255) ccccGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTagaa < 6:245638/149‑1 (MQ=255) ccccGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTagaa < 1:107904/149‑1 (MQ=255) ccccGGAAGTTGATGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACAGGATGCGCGGGTCCAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGTCCCGACGTGGATGAACACCACCAGACGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCCGCTag > 8:115089/1‑147 (MQ=255) cccGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAacac < 3:272099/106‑1 (MQ=255) cccGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAacac > 4:272099/1‑106 (MQ=255) ggTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCTCCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGaaa > 4:33939/1‑149 (MQ=255) ggTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGGCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGGTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGaaa < 8:148714/149‑1 (MQ=255) ccACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGACCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTcg > 4:94584/1‑149 (MQ=255) cACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCccatggtttcttctacccgccagcgcagccgcaaggcgccgcaccgctggtggtgttcatccacggcgggccaacctcagcctgctatc < 2:181195‑M1/149‑90 (MQ=255) cACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTcgc > 4:33538/1‑149 (MQ=255) cAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCa > 6:247375/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCccatggtttcttctacccgccagcgcagccgcaaggcgccgcaccgctggtggtgttcatccacggcgggccaacctc > 1:129909‑M1/1‑48 (MQ=255) aCGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCccatggtttcttctacccgccagcgcagccgcaaggcgccgcaccgctggtggtgttcatccacggcgggccaacctc < 2:129909‑M1/126‑79 (MQ=255) cGCTTGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGGCTACCTCGGGATATCAGGCTGACGTTGGGCCGCCGTTGATGAACACCACCAGCCGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGGTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCTCCACTGCCGTa < 7:115089/149‑1 (MQ=255) cTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGTGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGt < 3:33538/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGa < 2:205039/149‑1 (MQ=255) tCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATc > 5:169569/1‑149 (MQ=255) ggATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATTAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCg < 6:67968/147‑1 (MQ=255) ggATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCgga > 5:67968/1‑148 (MQ=255) gATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCACGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGCTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCgg > 3:23530/1‑147 (MQ=255) cgcgGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCt < 5:247375/149‑1 (MQ=255) gcgGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCCTGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCGGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGcg > 6:165585/1‑147 (MQ=255) gcgGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCt > 5:79642/1‑148 (MQ=255) gcgGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCt > 3:23688/1‑148 (MQ=255) gTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGAttt > 8:80012/1‑149 (MQ=255) gAGCACGGGATAGGAGGCGGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGcc < 5:165585/149‑1 (MQ=255) gAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCTCCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGcc < 3:33939/149‑1 (MQ=255) gCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCct < 2:255330/149‑1 (MQ=255) gggTTATCAGGGTGTGGTTGGCCCGCTGTGGATGATCTCGACTAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGATTCCATGGGCCTGATCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCctgct < 4:23530/148‑1 (MQ=255) gATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGgcctgctatcccgtgctcgacccgcgcatccagtactggacccagcgtggctttgccgtg < 2:181195‑M2/149‑61 (MQ=255) aTAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCa < 7:80012/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGNAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGt < 1:96801/148‑1 (MQ=255) cAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGTAt > 6:131060/1‑149 (MQ=255) ggCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGTAttt < 2:89538/149‑1 (MQ=255) ggCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGTAttt > 1:89538/1‑149 (MQ=255) gCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGTAttt < 6:168112/148‑1 (MQ=255) gCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGTAttt > 5:168112/1‑148 (MQ=255) gCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGTATTTc > 3:120605/1‑149 (MQ=255) | TCGGCCACGTCACTTTCGCCCCAGCGCAGGTGCAGTGCCTGGCGGTATTCCCGACCATAGCCGGTGCTGCCCCGGTAGTTGAGGTCGGCCACGGCAAAGCCACGCTGGGTCCAGTACTGGATGCGCGGGTCGAGCACGGGATAGCAGGCTGAGGTTGGCCCGCCGTGGATGAACACCACCAGCGGTGCGGCGCCTTGCGGCTGCGCTGGCGGGTAGAAGAAACCATGGGCCTGCTCGCCGCCACTGCCGTAGTGGATCGGCTGCGGTAGGCTGATTTGCCCTGCTGGCAGTATTTC > NC_002947/455324‑455619 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |