| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4586034 = | 22 (0.450) | 5 (0.120) | 7/218 | NT | 26.8% | intergenic (+117/+98) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
| ? | NC_002947 | 4586105 = | 9 (0.220) | intergenic (+188/+27) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase | |||||
GCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTCTGC‑GGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑C‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGC > NC_002947/4585887‑4586181 | gccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑gg > 8:87539/1‑149 (MQ=255)gccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGACAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑gg < 4:70258/149‑1 (MQ=255)caaggtgccgcggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgg < 3:84060‑M1/1‑1 (MQ=255) aggtgccgcggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGt > 1:120929‑M1/147‑149 (MQ=255) gccgcggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAAc < 3:234680‑M1/7‑1 (MQ=255) ccgcggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAAcc < 4:34817‑M1/8‑1 (MQ=255) gcggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCg < 2:246595‑M1/10‑1 (MQ=255) ggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCt > 1:111138‑M1/138‑149 (MQ=255) ggtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCt > 3:5692‑M1/138‑149 (MQ=255) gtatatacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTc > 6:25507‑M1/137‑149 (MQ=255) aCCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 4:86293/1‑149 (MQ=255) tacgttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTAc > 1:16763‑M1/132‑148 (MQ=255) tacgttttgtcgacgagtacccgatgacagtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:175487‑M1/17‑1 (MQ=255) ggCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑cc > 6:201213/1‑148 (MQ=255) ggCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑cc > 1:55212/1‑148 (MQ=255) ggCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑cc < 4:75361/149‑2 (MQ=255) gagtagccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAgg > 8:6914‑M1/118‑138 (MQ=255) gagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAgg < 7:6914‑M1/21‑1 (MQ=255) ggTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGc < 7:87539/149‑1 (MQ=39) ggaGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGcc < 4:193374/147‑1 (MQ=38) gTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGcc < 6:214984/149‑1 (MQ=39) gTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGc < 8:261577/148‑1 (MQ=39) gACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCtt < 2:55212/148‑1 (MQ=39) gACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCtt < 3:86293/148‑1 (MQ=39) cGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATgc‑g < 5:270477/144‑1 (MQ=38) cGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATgc‑g > 6:270477/1‑144 (MQ=38) ccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑CCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGc > 3:202028‑M1/99‑148 (MQ=255) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCt < 1:127593/148‑1 (MQ=39) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑ccgtgc > 2:221756/1‑118 (MQ=38) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑ccgtgc < 1:221756/123‑6 (MQ=38) cAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGGTGCCCCTGGt < 6:143017/149‑1 (MQ=38) cAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGGTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGt < 5:201213/149‑1 (MQ=38) gtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑CCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAg > 1:51126‑M1/91‑149 (MQ=255) tgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcggggtgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑CCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAgg > 8:66416‑M1/90‑149 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACCAGGGAA‑C‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCGGGGAg > 7:147917/1‑148 (MQ=38) gctgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGccc > 8:84050/1‑132 (MQ=38) gctgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGccc < 7:84050/132‑1 (MQ=38) tgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑CCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTg > 1:112221‑M1/75‑129 (MQ=255) tgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcggccggcctcttcgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑CCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTg < 2:112221‑M1/55‑1 (MQ=255) ggTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCt < 8:215116/98‑1 (MQ=25) cggccTCTTCGCGGGTAAAACCGCTGCTACCAGGG‑ACC‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGCGGCCGGCCGCGCCAGCACATCACCCCGCAGCTGCAGCCGCACTCTCCGCCacacg > 4:97129/1‑147 (MQ=37) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑G‑CAGCGCCG‑CATTCAAGGCCGGCACGGTCCCAGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACg < 4:63374‑M1/144‑1 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑CAGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCACATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAACACACg < 2:175487‑M1/144‑1 (MQ=255) GGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑G‑CAGCGCCG‑CATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGc > 3:63374‑M1/1‑149 (MQ=255) | GCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTCTGC‑GGTAAACCCGCTCCTACCAGGG‑A‑C‑GTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGC > NC_002947/4585887‑4586181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |