New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5534108 = | 63 (1.290) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 5.2% | coding (367/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 5534150 = | 48 (1.020) | coding (325/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
TGCAACACCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATCGCC > NC_002947/5533960‑5534252 | tGCAACACCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGc > 2:261045/1‑149 (MQ=255) gCAACACCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGc > 2:295805/1‑148 (MQ=255) aacgccgctggtggcgtgaatggcgagaaaatcgtcctggtcaaaggcgatgacgcctgtgaaccgaagcaagccgtggccgtggccaaccgcctggtcgatcaggacaaggtgattggcgtggtgggccacttctgttcctccaacac < 1:128574‑M1/1‑1 (MQ=255) aaCACCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGAt > 4:238656/1‑149 (MQ=255) cacCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCa < 8:151603/149‑1 (MQ=255) cacCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTAGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATCAGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTCACCTCAGGGTAGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGagaa > 3:285578/1‑146 (MQ=255) ccGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCCCGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCAcg > 6:69089/1‑149 (MQ=255) ccGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCAcg > 8:279671/1‑149 (MQ=255) gCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCAcgcc > 4:197059/1‑149 (MQ=255) cAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCAcgccc > 7:105718/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTc < 4:219499/147‑1 (MQ=255) gCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTc < 2:183848/147‑1 (MQ=255) cccTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCata < 5:52291/149‑1 (MQ=255) cccTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCata > 8:241973/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCAtata < 7:167779/149‑1 (MQ=255) aCGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGa > 1:126970/1‑149 (MQ=255) gTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGCTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGAc < 1:75559/149‑1 (MQ=255) aggaTGTAGTCGCCAGCGACGATAGCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCAAATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCg < 4:285578/146‑1 (MQ=255) tcaaaggcgatgacgcctgtgaaccgaagcaagccgtggccgtggccaaccgcctggtcgatcaggacaaggtgattggcgtggtgggccacttctgttcctccaacaCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATc < 4:240170‑M1/41‑1 (MQ=255) tAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCgt < 5:166783/149‑1 (MQ=255) tAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCgt > 6:166783/1‑149 (MQ=255) gTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGCTCgtg < 7:279671/148‑1 (MQ=255) aggcgatgacgcctgtgaaccgaagcaagccgtggccgtggccaaccgcctggtcgatcaggacaaggtgattggcgtggtgggccacttctgttcctccaacaCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCgtgt > 3:240170‑M1/105‑149 (MQ=255) cgatgacgcctgtgaaccgaagcaagccgtggccgtggccaaccgcctggtcgatcaggacaaggtgattggcgtggtgggccacttctgttcctccaacaCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgg > 4:74126‑M1/102‑149 (MQ=255) ccAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgga < 5:205581/149‑1 (MQ=255) cAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTggag < 7:241973/149‑1 (MQ=255) aGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCTGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTggagg < 1:295805/149‑1 (MQ=255) cgacgaTACCCTGCTGGTCGTCACGGTCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGaa < 2:269825/149‑1 (MQ=255) gacgaTACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGaa > 4:30261/1‑148 (MQ=255) gacgaTACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAAc < 8:105718/149‑1 (MQ=255) cccTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGCTCGTGTTGGAGGAACCGCAGTg > 3:233248/1‑149 (MQ=255) cccTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGt < 3:197059/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCTCTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTAGGACGCCGGGATCGTGTTCGAGGAACAGAAGTgg > 2:238394/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgga > 2:184554/1‑136 (MQ=255) ccTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTgg > 2:73120/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTAATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgga < 1:184554/136‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACg > 3:13978/1‑119 (MQ=255) ctgctgGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACg < 4:13978/119‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGc > 8:178488/1‑149 (MQ=255) gtcgtcACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCccacca > 8:291061/1‑149 (MQ=255) gtcACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAg < 8:237074/133‑1 (MQ=255) gtcACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAg > 7:237074/1‑133 (MQ=255) aCGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCa > 6:227424/1‑148 (MQ=255) ggCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAAt > 6:149417/1‑148 (MQ=255) gCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCg > 8:259823/1‑107 (MQ=255) gCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCg < 7:259823/107‑1 (MQ=255) gCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCa > 6:27089/1‑149 (MQ=255) cGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCAcc < 1:261045/149‑1 (MQ=255) cacaTGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCtt < 5:27089/149‑1 (MQ=255) acaTGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCACGTCATATACCTCGGACGCCgg > 5:59410/1‑103 (MQ=255) acaTGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCACGTCATATACCTCGGACGCCgg < 6:59410/103‑1 (MQ=255) gAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGAt < 5:69089/149‑1 (MQ=255) gAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGAt < 7:291061/149‑1 (MQ=255) gAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGAt < 1:254690/149‑1 (MQ=255) cATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGa < 3:238656/149‑1 (MQ=255) aTGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGtt < 8:70417/101‑1 (MQ=255) aTGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGtt > 7:70417/1‑101 (MQ=255) aTGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGAc > 7:14185/1‑149 (MQ=255) ggcctcTCAGCGCGCGCTCCGGGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGAcc < 4:233248/144‑1 (MQ=255) ggCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGAc > 7:148328/1‑147 (MQ=255) gCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCa < 7:178488/148‑1 (MQ=255) cACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAgg < 4:78340/149‑1 (MQ=255) cACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCGGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAgg > 3:154845/1‑149 (MQ=255) aCTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCGGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGc < 4:154845/149‑1 (MQ=255) gTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGgctt > 2:226459/1‑143 (MQ=255) gTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGgctt < 1:226459/143‑1 (MQ=255) gAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGATGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTcac < 3:251232/148‑1 (MQ=255) aGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAg < 2:126970/149‑1 (MQ=255) ccTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGc > 5:216323/1‑149 (MQ=255) ggTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCAt < 5:227424/149‑1 (MQ=255) gTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATc < 5:149417/149‑1 (MQ=255) gATGGCGATCACGCCCGCCACGACATAAACCTCGGACGCCGGGAACGTGATGGAGGAACAGAAGTGGCCCAACAAGCCAATCACCTAGACCTTATCGACCAGCCGGTAGCCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGACGTCaaagc > 2:70222/1‑145 (MQ=255) aTGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATCGcc > 2:128574/1‑149 (MQ=255) aTGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGCCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATCGcc > 1:256136/1‑149 (MQ=255) | TGCAACACCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGG‑TGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATCGCC > NC_002947/5533960‑5534252 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |