New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6121080 = | 48 (0.980) | 4 (0.090) | 4/250 | NT | 7.4% | coding (1070/1386 nt) | PP_5371 | rubredoxin/rubredoxin reductase |
? | NC_002947 | 6121167 = | 54 (1.160) | coding (983/1386 nt) | PP_5371 | rubredoxin/rubredoxin reductase |
CGGGAGGTGTCAGCAGGCACAGAGGGACGACCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCA > NC_002947/6120934‑6121220 | cGGGAGGTGTCAGCAGGCACAGAGGGACGACCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTgg > 2:97246/1‑149 (MQ=255) cacgaccttgcagtgcatcgagccggacggcgaaggctaccgactgacccttgccgacggtcaggtcgtcggtgcagacctggtgctcagtgcagtgggcttgcgccccaaccttgagctggcgctggaagccggcctggactgTGGcc < 3:184017‑M1/5‑1 (MQ=255) aGGTGTCAGCAGGCACAGAGGGACGACCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGt < 3:106287/149‑1 (MQ=255) tgtCAGCAGGCACAGAGGGACGACCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGa > 8:55839/1‑149 (MQ=255) gtCAGCAGGCACAGAGGGACGACCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGa > 8:87123/1‑148 (MQ=255) agcagGCACAGAGGGACGACCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGAtctc < 5:198563/149‑1 (MQ=255) gcagGCACAGAGGGACGACCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGAtctc > 2:59406/1‑148 (MQ=255) gacCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAgg > 6:210350/1‑149 (MQ=255) cGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCa > 3:269205/1‑148 (MQ=255) cGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCAt < 5:210350/149‑1 (MQ=255) ggggTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGCAGCAATCGACCAAggaa > 6:213766/1‑145 (MQ=255) gggTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCa > 5:309156/1‑146 (MQ=255) gggTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCa > 6:33629/1‑146 (MQ=255) gggTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAg < 6:224511/149‑1 (MQ=255) aCCGTCACGTGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCg < 5:33629/148‑1 (MQ=255) aCCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGa < 7:26281/121‑1 (MQ=255) aCCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGa > 8:26281/1‑121 (MQ=255) aCCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCg < 7:87123/148‑1 (MQ=255) cGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGtt < 1:59406/149‑1 (MQ=255) aCGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGa < 3:223498/149‑1 (MQ=255) ggCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGt < 8:78308/149‑1 (MQ=255) cAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTa < 7:55839/149‑1 (MQ=255) tGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGtt > 8:55122/1‑149 (MQ=255) tAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGc > 4:247550/1‑149 (MQ=255) gtcgtcggtgcagacctggtgctcagtgcagtgggcttgcgccccaaccttgagctggcgctggaagccggcctggactgTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTc < 2:175430‑M1/68‑1 (MQ=255) gcggcgGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGAc > 8:10419/1‑149 (MQ=255) gcggTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCtt < 4:269205/149‑1 (MQ=255) gcggTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCtt > 2:163439/1‑149 (MQ=255) gtTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTtgt > 5:90854/1‑131 (MQ=255) gtTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTtgt < 6:90854/131‑1 (MQ=255) gCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCgg < 7:55122/148‑1 (MQ=255) cccAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGa < 3:297148/139‑1 (MQ=255) cccAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGa > 4:297148/1‑139 (MQ=255) cccAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGc > 7:13288/1‑148 (MQ=255) ctcagtgcagtgggcttgcgccccaaccttgagctggcgctggaagccggcctggactgTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTAGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCcaca > 1:175430‑M1/60‑148 (MQ=255) ttGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGcc > 3:26725/1‑149 (MQ=255) ttGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGcc > 3:220217/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGcc < 6:309156/147‑1 (MQ=255) ggCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCgg > 8:77370/1‑149 (MQ=255) gCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGc < 4:26725/149‑1 (MQ=255) gCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGc < 1:186821/149‑1 (MQ=255) ggCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTc > 1:137473/1‑147 (MQ=255) cACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAATGCATAGATGGCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAgc < 5:213766/149‑1 (MQ=255) caaccttgagctggcgctggaagccggcctggactgTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAg > 3:159537‑M1/37‑126 (MQ=255) caaccttgagctggcgctggaagccggcctggactgTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAg < 4:159537‑M1/90‑1 (MQ=255) cTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTc > 5:16096/1‑148 (MQ=255) cGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCaa < 8:13288/147‑1 (MQ=255) ttGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGtt < 2:137473/149‑1 (MQ=255) gATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTgg > 8:26343/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTgg < 7:77370/148‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGAGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTggg < 1:97246/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTgggg > 2:79478/1‑149 (MQ=255) gcgcGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGgcg > 3:177708/1‑148 (MQ=255) gcagcaACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCcactgca > 3:185341/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTggg < 6:300025/126‑1 (MQ=255) cTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTggg > 5:300025/1‑126 (MQ=255) | CGGGAGGTGTCAGCAGGCACAGAGGGACGACCGGGGTTTTCACCGTCACGGGCGCCAATGGGTAGTGGGCGGCGGTCGGTTGGCCCAGCAAGGTCTTGGCGAGGGCACGAATGCCTTCGTTGATCGGCGCGAGGTAAGGCAGCAACTGGCCGTTGATCTCGACGCAATCGCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCA > NC_002947/6120934‑6121220 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |