New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 242456 = | 60 (1.230) | 3 (0.070) | 3/242 | NT | 5.7% | coding (166/507 nt) | PP_0190 | disulfide bond formation protein B |
? | NC_002947 | 242550 = | 43 (0.950) | coding (260/507 nt) | PP_0190 | disulfide bond formation protein B |
AGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCTTGCCTGGAGTTTTCTCGATC > NC_002947/242411‑242696 | aGCCAAGGGGTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTgg < 5:244032/147‑1 (MQ=255) ccAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTg > 1:223857/1‑148 (MQ=255) aaCGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAg > 5:189020/1‑149 (MQ=255) aaCGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAg < 4:230665/149‑1 (MQ=255) ctgctTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGa < 3:42556/149‑1 (MQ=255) ggCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGt > 6:149588/1‑149 (MQ=255) gCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGt < 2:86189/148‑1 (MQ=255) ggTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAAt < 8:83658/149‑1 (MQ=255) tACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGa < 3:247232/149‑1 (MQ=255) cgcgCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAg < 6:216416/148‑1 (MQ=255) gcgcTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAgg > 1:176888/1‑148 (MQ=255) gcgcTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAgg > 6:104517/1‑148 (MQ=255) gcgcTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAgg > 4:254110/1‑148 (MQ=255) gcgcTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGt < 2:176888/149‑1 (MQ=255) gcTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTAt < 1:56937/149‑1 (MQ=255) gcTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTAt < 8:30828/149‑1 (MQ=255) tgtgTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAg < 8:206651/140‑1 (MQ=255) tgtgTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAg > 7:206651/1‑140 (MQ=255) tttCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAggggg > 6:232892/1‑128 (MQ=255) tttCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAggggg < 5:232892/128‑1 (MQ=255) tttCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGc < 3:254110/149‑1 (MQ=255) tttCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGc > 1:39120/1‑149 (MQ=255) tttCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGc > 3:50091/1‑149 (MQ=255) ttCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGcc > 3:207939/1‑149 (MQ=255) gCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGAt < 6:189020/149‑1 (MQ=255) CCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCggg > 6:99807‑M1/1‑149 (MQ=255) cgtgctgccagcaaagcgccggccagcgagcagcccagcgccagccgagcataacgaaggatgccccgcgtgcccggcgcctgcagcacggcATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGt > 3:225951‑M2/93‑138 (MQ=255) cgtgctgccagcaaagcgccggccagcgagcagcccagcgccagccgagcataacgaaggatgccccgcgtgcccggcgcctgcagcacggcATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGt < 4:225951‑M2/46‑1 (MQ=255) CGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGc > 3:62224‑M1/1‑149 (MQ=255) CGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGc > 4:50091‑M1/1‑149 (MQ=255) tgctgccagcaaagcgccggccagcgagcagcccagcgccagccgagcataacgaaggatgccccgcgtgcccggcgcctgcagcacggcATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGc > 2:116709‑M2/91‑147 (MQ=255) GCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGt > 8:265191‑M1/1‑126 (MQ=255) GCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGt < 7:265191‑M1/126‑1 (MQ=255) CTGCAGGCGCTGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAgt < 2:163864‑M1/149‑1 (MQ=255) GCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAgtgt > 2:39120‑M1/1‑149 (MQ=255) aGGCGCCGGGCAGGCTGGGAATCCGTCGTTATGCTCGGCTGGAGCTGGGATGCTCGCTGGCCGGAGCTTTGCTGGCAGCACGGAATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGATGTATGTCCGGTGCCTATCGTGCGAGTTTTc < 2:253869/149‑1 (MQ=255) gcgGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCTGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGa < 2:223857/149‑1 (MQ=255) ggggCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGt < 7:83390/149‑1 (MQ=255) gCATCCTTCGTTTTGCTCGGCTGGCGCTGGGCGGCTCGCTGGCCGGCGGTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAg < 4:207939/149‑1 (MQ=255) tCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAggcg > 1:46463/1‑149 (MQ=255) ttCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCTTGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGCTTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAggcggct > 6:152869/1‑148 (MQ=255) gTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGcggcacgg < 5:104517/149‑1 (MQ=255) cTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAActg > 5:294371/1‑149 (MQ=255) tCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCCGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGACTGGATGCAGGGGGCTGACGGGCTCAATCAGGTATCTCCGGTGCCGAACGGGCCAGTGTTCGAACAAACCAGCAGTGAGCCGGCACGGCAActg > 2:15799/1‑148 (MQ=255) ggCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGccc > 2:210826/1‑149 (MQ=255) ggCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGccc < 2:46463/149‑1 (MQ=255) ctCGGTGGCCGGCGCTTTGCTGGCATCACGCCATGTCTGGTTGCAGGGGGCGGAGGGGGGCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGAtt < 1:15799/149‑1 (MQ=255) tCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAActgctgc‑t > 6:124625/1‑134 (MQ=255) tGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGt > 3:100592/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTc > 5:118407/1‑149 (MQ=255) ggCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCt > 3:147870/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCtt < 5:149588/149‑1 (MQ=255) tttGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCTTGCCt > 3:119159/1‑149 (MQ=255) gCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCTTGCCTg > 7:137196/1‑147 (MQ=255) cagcacggcATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCTTGCCTGGAGtttt < 6:294371‑M2/140‑1 (MQ=255) cacggcATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCTTGCCTGGAGTTTtctc < 1:213425‑M2/143‑1 (MQ=255) aCGGCATTGCTGGGTGCCGGGGGCGGAGGGGGGCAATGAGGTATGTCCGGGGCCGCTCGGGCGAGGGTTCGTACAATTCTGGATTGATGCGGCAAGGCAACTGCTGCTTGGGGGGCCCGGATTGCCGTTCGCTTGCCTGGAGTTTtctc < 1:210826/149‑1 (MQ=255) gcATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCTTGCCTGGAGTTTTCTCGATc > 4:92561‑M2/3‑149 (MQ=255) | AGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGC‑TGGGTGGCCCGGATTGCCGTTCGCTTGCCTGGAGTTTTCTCGATC > NC_002947/242411‑242696 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |