New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 667006 = | 79 (1.610) | 4 (0.090) | 4/250 | NT | 5.1% | coding (3872/4902 nt) | yfhM | lipoprotein |
? | NC_002947 | 667041 = | 72 (1.540) | coding (3907/4902 nt) | yfhM | lipoprotein |
GCACTGAAGAAGGCCAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCGGGCCTGGGCATTAGCCGTGG > NC_002947/666894‑667186 | gCACTGAAGAAGGCCAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGtt < 6:137557/149‑1 (MQ=255) gCACTGAAGAAGGCCAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGtt < 2:258851/149‑1 (MQ=255) aCTGTAGAAGGCCAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTgg > 7:127275/1‑149 (MQ=255) aCTGAAGAAGGCCAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTgg < 2:49101/149‑1 (MQ=255) cggcacgcggtttgtcgcccattttgtccagcgccactgccagttgtaccagcggcagaccggagcgggcatcggcgcgacgttcgaacagcccgcgcagggcacccaaCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTggg < 2:101078‑M1/40‑1 (MQ=255) ggcacgcggtttgtcgcccattttgtccagcgccactgccagttgtaccagcggcagaccggagcgggcatcggcgcgacgttcgaacagcccgcgcagggcacccaaCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTggg > 1:101078‑M1/109‑148 (MQ=255) aagaagGCGAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGAAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGt < 8:156297/147‑1 (MQ=255) gaagGCCAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGccc < 5:228656/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTgcg > 3:154127/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGAGCGCCTGCTACATTACCTACCAGAACGCAACCTGATCGAAGTCAAAAACAACAAGAAAACAGACCACACACGCTTTTAGGTGCAGGCAAACGAGGCGCAGGTGCTGTCCCGAAACCAGCAGGCCCCGTGGGTAGCCCtcca > 8:46891/1‑146 (MQ=255) cAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGcgcg > 8:282527/1‑149 (MQ=255) gTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCggg < 8:127275/149‑1 (MQ=255) tGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGc < 7:282527/149‑1 (MQ=255) ctgctgCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCgg > 7:30468/1‑140 (MQ=255) ctgctgCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCgg < 8:30468/140‑1 (MQ=255) gctgcGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGtt < 1:219864/144‑1 (MQ=255) gctgcGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGtt > 2:219864/1‑144 (MQ=255) cGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTc < 3:263839/148‑1 (MQ=255) cGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTc < 5:223462/148‑1 (MQ=255) agcgccactgccagttgtaccagcggcagaccggagcgggcatcggcgcgacgttcgaacagcccgcgcagggcacccaaCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGtt < 8:148906‑M1/37‑1 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gaATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTc > 1:263644/1‑97 (MQ=255) gaATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTgg > 5:11414/1‑149 (MQ=255) aTGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGgcg < 7:46891/149‑1 (MQ=255) ccGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTTCAACTGGCAGTGGCGCt < 2:187349/148‑1 (MQ=255) cacGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGTCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACaaaa < 4:206110/149‑1 (MQ=255) acGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAAt > 3:234420/1‑149 (MQ=255) 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GGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAg < 1:128978‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAg < 6:295669‑M1/149‑1 (MQ=255) GCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGc > 1:108512‑M1/1‑149 (MQ=255) CTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCtt > 8:246097‑M1/1‑149 (MQ=255) CTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCtt > 4:3664‑M1/1‑149 (MQ=255) gTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTg > 6:131227/1‑147 (MQ=255) tGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAg < 1:289798/149‑1 (MQ=255) tCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTgg < 2:225565/97‑1 (MQ=255) tCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCgg < 5:295669/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCgg > 2:167813/1‑146 (MQ=255) gcgcAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCgg < 1:167813/146‑1 (MQ=255) gccagcAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCGGGCCTGGGc < 7:264088/149‑1 (MQ=255) ccagcAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCGGGCCTGGGCa > 7:198616/1‑149 (MQ=255) gcagGCGCCGGTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCGGGCCTGGGCATTa < 4:154127/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCGGGCCTGGGCATTAGcc < 2:221298/149‑1 (MQ=255) cgccgTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCGGGCCTGGGCATTAGCCGt < 1:301651‑M2/144‑1 (MQ=255) ccgTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCGGGCCTGGGCATTAGCCGTgg > 7:18106‑M2/4‑149 (MQ=255) | GCACTGAAGAAGGCCAGTGAGCGCCTGCTGCGTTACCTGCAGGAACGCAACCTGATCGAAGTCGACTACAGCGAGAATGCCGACCACACGCGCTTTGCGGTGCAGGCCTACGCGGCGCTGGTGCTGTCGCGCAGCCAGCAGGCGCCGTTGGGTGCCCTGCGCGGGCTGTTCGAACGTCGCGCCGATGCCCGCTCCGGTCTGCCGCTGGTACAACTGGCAGTGGCGCTGGACAAAATGGGCGACAAACCGCGTGCCGAGCAAGCCTTGCAGGCGGGCCTGGGCATTAGCCGTGG > NC_002947/666894‑667186 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |