New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 916036 = | 52 (1.060) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 6.8% | coding (497/540 nt) | PP_0797 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 916126 = | 58 (1.210) | coding (1441/1491 nt) | PP_0798 | GGDEF domain‑containing protein |
AGCGACATGACCTACAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGT > NC_002947/915978‑916271 | aGCGACATGACCTACAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTa < 3:151930/149‑1 (MQ=255) cATGACCTACAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAgcg < 7:21965/149‑1 (MQ=255) ggcacccagcaggaccttggcaggctgctgggtgctgcggacgaagcgctctACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAgcgc > 8:67369‑M1/53‑149 (MQ=255) aTGACCTACAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAgcgc > 6:306102/1‑149 (MQ=255) tGACCTACAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCt > 8:166560/1‑149 (MQ=255) aCCTACAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTc < 8:202115/149‑1 (MQ=255) cAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTc > 6:79990/1‑147 (MQ=255) cAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTc < 5:79990/147‑1 (MQ=255) aggatggtggAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCgc < 5:306102/145‑1 (MQ=255) ccTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCgcag > 4:115360/1‑149 (MQ=255) ggtggAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑c > 5:102429/1‑149 (MQ=255) gAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCcag > 3:78594/1‑149 (MQ=255) aaaGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCcagca < 4:265809/149‑1 (MQ=255) aaaGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCcag > 3:265809/1‑147 (MQ=255) gcagcTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑cc > 7:133738/1‑141 (MQ=255) gcagcTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑cc < 8:133738/141‑1 (MQ=255) aGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCcagcag > 4:244929/1‑130 (MQ=255) aGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCcagcag < 3:244929/130‑1 (MQ=255) gcgcAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTggg > 8:17010/1‑149 (MQ=255) cgcAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTggga < 7:195516/149‑2 (MQ=255) cgcAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGt < 5:224886/149‑1 (MQ=255) gcgctctaccgggccaaggccaatggccgcaatcgggtagagggcccgcttgattaggagcgggcgcgagcggcgttgcgcagggccttgacctggtAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑Gcc > 8:67369‑M2/98‑149 (MQ=255) aCCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCACCCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑Gcc < 1:4231/149‑1 (MQ=255) aCCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCg < 3:144633/149‑1 (MQ=255) aCCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCg < 2:152671/149‑1 (MQ=255) aCCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCg < 7:17010/149‑1 (MQ=255) cATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGa > 7:134725/1‑149 (MQ=255) aTGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGt < 4:254787/142‑1 (MQ=255) aTGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGt > 3:254787/1‑142 (MQ=255) tGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGa > 3:57019/1‑147 (MQ=255) CCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGAc > 3:213283‑M1/1‑149 (MQ=255) ggccaaggccaatggccgcaatcgggtagagggcccgcttgattaggagcgggcgcgagcggcgttgcgcagggccttgacctggtAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccga > 1:168464‑M2/87‑149 (MQ=255) aaGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccgatacc < 2:108645/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccgataccga < 3:49627/149‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccgataccgat < 4:57019/149‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccgataccgat > 7:148763/1‑149 (MQ=255) cccTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCCGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATg > 5:100950/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCACGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccgataccga < 7:74585/139‑1 (MQ=255) aaCGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccgataccga > 8:74585/1‑139 (MQ=255) aaCGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCtcacggt > 6:86357/1‑149 (MQ=255) cgccgcTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCGATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCtcacggtca < 7:166560/149‑1 (MQ=255) cTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGcc > 2:229373/1‑93 (MQ=255) cTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGcc < 1:229373/93‑1 (MQ=255) tagagggcccgcttgattaggagcgggcgcgagcggcgttgcgcagggccttgacctggtAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTgg < 2:168464‑M2/89‑1 (MQ=255) gcgcCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGt < 7:55639/147‑1 (MQ=255) cccGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGca > 8:139459/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGcat > 5:152632/1‑149 (MQ=255) ccTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATcc > 1:219976/1‑149 (MQ=255) cTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCg > 7:191494/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCaaa < 2:219976/149‑1 (MQ=255) tCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGT‑GGCATCATCCGCAAAc < 6:102429/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccgataccga < 1:108255/113‑1 (MQ=255) aaGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGaccgataccga > 2:108255/1‑113 (MQ=255) ccTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCtca > 8:266154/1‑111 (MQ=255) ccTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCtca < 7:266154/111‑1 (MQ=255) ctctACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAgcg > 1:153443/1‑149 (MQ=255) ctACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGcc > 2:260927/1‑149 (MQ=255) cGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGAc > 5:65666/1‑149 (MQ=255) cagggccttgacctggtAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGa < 7:67369‑M2/132‑1 (MQ=255) aTTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGa < 8:134725/149‑1 (MQ=255) gccttggccCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGc < 8:148763/148‑1 (MQ=255) gccttggccCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGc < 5:86357/148‑1 (MQ=255) ccttggccCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGCCGTTGGCTCGGATGCGt > 4:212534/1‑149 (MQ=255) ccttggccCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGt < 2:153443/149‑1 (MQ=255) cttggccCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATACGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGAGGTTGGATCGGATGCGtt > 4:249643/1‑149 (MQ=255) gccCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAg < 6:152632/148‑1 (MQ=255) ccGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGTGGCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGc > 1:80184/1‑148 (MQ=255) ggtAGAGCGCGTCGTCCGCAGCA‑ACCAGCATCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGAACGATACAGATGCTAACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGAAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGt < 4:271605‑M2/146‑1 (MQ=255) gtAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTAGGCTCGGATGAGTTCAGCCAg > 8:263530‑M2/3‑147 (MQ=255) | AGCGACATGACCTACAGCCTGGTGGAAAAGCAGCTGCAAGGCGTGCAGCGCAACCATGACCAGGTCAAGGCCCTGCGCAACGCCGCTCGCGCCCGCTCCTAATCAAGCGGGCCCTCTACCCGATTGCGGCCATTGGCCTTGGCCCGGTAGAGCGCTTCGTCCGCAGCA‑CCCAGCAGCCTGCCAAGGTCCTGCTGGGT‑GCCGGACAGACCGATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGT > NC_002947/915978‑916271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |