New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1062897 = | 49 (1.000) | 4 (0.090) | 4/250 | NT | 8.3% | coding (992/1050 nt) | xenB | xenobiotic reductase B |
? | NC_002947 | 1062966 = | 42 (0.900) | coding (923/1050 nt) | xenB | xenobiotic reductase B |
CCCGCGAATGGCCCTCAATCACAACCGCGGATAATCGATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCCTCCCGCTCCCGCGAG > NC_002947/1062821‑1063109 | cccGCGAATGGCCCTCAATCACAACCGCGGATAATCGATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCa > 7:211193/1‑148 (MQ=255) ccGCGAATGGCCCTCAATCACAACCGCGGATAATCGATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCaaa < 4:32218/149‑1 (MQ=255) gtcaacgagcggttcgacaaggccagtgccaatgcgggcctggccagtggcaaagcggatgccgtggcgtttggTGTGCCTCGTTCAACGTCGCATCCGCTGCGAGACGTGCCGGCAGGTCGGGTTTGGCGATGAACGGCACACGaaa > 8:30212‑M1/75‑148 (MQ=255) cccTCAATCACAACCGCGGATAATCGATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCa > 5:125225/1‑149 (MQ=255) tCACAACCGCGGATAATCGATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGcct > 2:41594/1‑147 (MQ=255) gcgGATAATCGATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCAACCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTg < 1:96240/149‑1 (MQ=255) tCGATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑c > 3:67159/1‑149 (MQ=255) gATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCTGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGTG‑cc > 7:16543/1‑148 (MQ=255) aCCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATc > 1:64828/1‑120 (MQ=255) aCCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATc < 2:64828/120‑1 (MQ=255) aCCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTgg > 7:267396/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACt > 4:241198/1‑149 (MQ=255) ccGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTg < 8:140286/149‑1 (MQ=255) ggCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGc < 6:207672/149‑1 (MQ=255) ggCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTCGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGc > 6:261080/1‑149 (MQ=255) gCCCCTTGCCATAGAAGGT‑‑‑‑GGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGt < 3:41142/149‑1 (MQ=255) ttGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTc > 5:150571/1‑149 (MQ=255) ccATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGaa < 3:252214/149‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCt < 8:211193/149‑1 (MQ=255) aaGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCa < 1:150135/129‑1 (MQ=255) aaGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCa > 2:150135/1‑129 (MQ=255) aaGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTc < 3:241198/149‑1 (MQ=255) gTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGtt < 2:2618/149‑1 (MQ=255) tCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGa < 4:67159/148‑1 (MQ=255) tttcgtgtgccgttcatcgccaaacccgacctgccggcacgtctcgcagcggatgcgacgttgaacgaggcacaCCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGC‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGAc > 8:30212‑M2/75‑148 (MQ=255) tgtgccgttcatcgccaaccccgacctgccggcacggctggcagcggatgcgccgttgaacgaggcacaCCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTa > 7:389‑M2/70‑149 (MQ=255) GCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACgg < 1:27075‑M1/149‑1 (MQ=255) GCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACgg < 6:22904‑M1/149‑1 (MQ=255) actgcgaATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCTGCGTAGGAGATGAACGTCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGCG‑ACGCATTGGAACTGGCCTTGTCGAACCGCTCTTTGACGATGTACGGGCCACAGa > 4:102944/4‑147 (MQ=255) aCGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAAt < 6:125225/149‑1 (MQ=255) gcgcATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGcc < 6:131007/149‑1 (MQ=255) cATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCctct < 6:150571/149‑1 (MQ=255) cATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGATCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCctct > 8:256856/1‑149 (MQ=255) gacctgccggcacggctggcagcggatgcgccgttgaacgaggcacaCCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTg < 8:389‑M2/102‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGGCCCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTa < 1:59068/126‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTa > 2:59068/1‑125 (MQ=255) ccAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGc > 5:49255/1‑149 (MQ=255) cggcacggctggcagcggatgcgccgttgaacgaggaacaCCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGGCAGGG‑CCGCATTGGCTCTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCg < 7:30212‑M2/109‑1 (MQ=255) aGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCgg > 8:87973/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATg < 5:22904/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATg > 5:210821/1‑149 (MQ=255) cGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGc > 3:164073/1‑56 (MQ=255) cGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGc < 4:164073/56‑1 (MQ=255) ggCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCt < 8:267396/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCGGGGTCGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTg < 5:261080/149‑1 (MQ=255) gTCGTGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCg < 8:14942/139‑1 (MQ=255) gTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCg > 7:14942/1‑139 (MQ=255) gTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTgtcgt < 6:210821/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCct < 6:49255/149‑1 (MQ=255) gATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCctccc > 2:205555/1‑146 (MQ=255) gATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCctccc < 1:205555/146‑1 (MQ=255) aCGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCCtcccgctcccgc > 4:48469/1‑149 (MQ=255) aCGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACAGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCCtcccgctcccgc > 8:210558/1‑149 (MQ=255) cGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTAc > 8:174446/1‑88 (MQ=255) cGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTAc > 8:179029/1‑88 (MQ=255) cGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTAc < 7:179029/88‑1 (MQ=255) cGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTAc < 7:174446/88‑1 (MQ=255) cGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCCTCCCGCTCCcgcg < 7:256856/149‑1 (MQ=255) ggcacaCCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCCCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCCtcccgctcccgc > 2:128343‑M2/7‑147 (MQ=255) cacaCCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCCTCCCGCTCCCGCGAg > 1:244813‑M2/5‑148 (MQ=255) | CCCGCGAATGGCCCTCAATCACAACCGCGGATAATCGATGTAACCCACCGGCCCCTTGCCATAGAAGGTTTCGGGATGTGCCTCGTTCAACGGCGCATCCGCTGCCAGCCGTGCCGGCAGGTCGGGGTTGGCGATGAACGGCACACCAAACGCCACGGCATCCGCTTTGCCACTGGCCAGGG‑CCGCATTGGCACTGGCCTTGTCGAACCGCTCGTTGACGATGTACGGGCCACCGAATGCCTCTTTGATCAGCGGCCCGATGCTGTCGTCGGCCTCCCGCTCCCGCGAG > NC_002947/1062821‑1063109 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |