New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1375310 | 58 (1.190) | 4 (0.080) | 3/254 | NT | 7.0% | coding (930/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
? | NC_002947 | = 1375342 | 50 (1.050) | coding (962/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
ATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTT > NC_002947/1375195‑1375477 | aTTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGg > 4:272560‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGggcc > 3:95446‑M2/1‑144 (MQ=255) ttCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATAGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCtt > 6:78077/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTcc > 6:279689/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTcc > 4:117680/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTcc > 2:284497/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATAGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTcc < 5:78077/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGGTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTcc < 8:198895/149‑1 (MQ=255) ggTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGAc > 6:54866/1‑149 (MQ=255) tGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGAccc > 4:276665/1‑149 (MQ=255) ttGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGc > 5:86708/1‑147 (MQ=255) ctgctgcAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTACTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGc < 1:288317/149‑1 (MQ=255) ctgctgcAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTACTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGc < 1:292892/149‑1 (MQ=255) gcAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATc > 6:242332/1‑148 (MQ=255) aaaaCCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAg < 5:65647/149‑1 (MQ=255) ccGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTggg > 3:46835/1‑149 (MQ=255) ccGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTggg < 1:47984/149‑1 (MQ=255) cGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGc < 3:117680/149‑1 (MQ=255) ggCCTCGCGCAATCCGTGCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGTCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCtata < 7:127986/149‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCtata < 8:118083/149‑1 (MQ=255) gcgcAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCcgc > 1:127314/1‑149 (MQ=255) aaTCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCAt < 6:86708/149‑1 (MQ=255) ccGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGAGCATGCa > 5:90198/1‑149 (MQ=255) tATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGAtt > 7:235310/1‑147 (MQ=255) tCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTc < 5:279689/146‑1 (MQ=255) tCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAg < 1:284497/148‑1 (MQ=255) tgctgGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCGACGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGca > 1:91697/1‑149 (MQ=255) ctgGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCacac < 8:235310/149‑1 (MQ=255) ctgGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCacac > 7:81470/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCt < 1:204524/148‑1 (MQ=255) gcgcCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTc < 4:46835/149‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAg < 5:242332/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGcac < 5:308311/136‑1 (MQ=255) cTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGcac > 6:308311/1‑136 (MQ=255) cgcTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAg > 6:263775/1‑146 (MQ=255) cgcTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCa < 5:263775/148‑1 (MQ=255) ctgcCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGc < 3:276665/148‑1 (MQ=255) tgcCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAgggg > 1:271337/1‑146 (MQ=255) tgcCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAg < 2:127314/149‑1 (MQ=255) ccGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAgg < 8:283922/142‑1 (MQ=255) ccGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAgg > 7:283922/1‑142 (MQ=255) gTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATc > 1:245099/1‑148 (MQ=255) gggCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGAATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTgg > 6:179200/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTg > 2:86318/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCCCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTg > 5:59699/1‑149 (MQ=255) ccaccaTGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGcgacg > 8:3231/1‑120 (MQ=255) ccaccaTGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGcgacg < 7:3231/120‑1 (MQ=255) caccaTGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggc < 3:285862‑M2/149‑108 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggccg < 8:13044‑M2/148‑110 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggatt > 6:175316‑M2/1‑39 (MQ=255) caTGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggatt < 5:175316‑M2/105‑67 (MQ=255) ggCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATGTACATTGGTGCGGTGAACTg > 2:113552/1‑147 (MQ=255) ccACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACg < 5:54866/149‑1 (MQ=255) ttATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGAtg < 2:91697/149‑1 (MQ=255) cc‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGc < 1:86318/149‑1 (MQ=255) aGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCgtggtg < 2:271337/149‑1 (MQ=255) gCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGtt > 4:35676/1‑149 (MQ=255) | ATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCC‑TCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTT > NC_002947/1375195‑1375477 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |