New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1600146 = | 61 (1.250) | 4 (0.090) | 4/248 | NT | 7.1% | coding (1038/2292 nt) | bglX | beta‑D‑glucoside glucohydrolase |
? | NC_002947 | 1600188 = | 47 (1.020) | coding (996/2292 nt) | bglX | beta‑D‑glucoside glucohydrolase |
CGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCG > NC_002947/1600046‑1600335 | cgcgGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTc < 3:257055/148‑1 (MQ=255) ggTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCg < 7:283432/149‑1 (MQ=255) ggTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTcagc < 6:261286/149‑1 (MQ=255) ccGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCgg < 4:146151/149‑1 (MQ=255) cGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGc > 7:262826/1‑149 (MQ=255) cGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGc < 2:270738/149‑1 (MQ=255) cGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCACCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCgg > 5:228255/1‑148 (MQ=255) tCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTc < 1:258096/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCg < 4:180155/149‑1 (MQ=255) cTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTc < 3:136683/127‑1 (MQ=255) cTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTc > 4:136683/1‑127 (MQ=255) ttCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGcc > 4:199908/1‑149 (MQ=255) ttCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGcc < 7:216603/149‑1 (MQ=255) tCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTc < 6:208080/145‑1 (MQ=255) tCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTc > 5:208080/1‑145 (MQ=255) aGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGt < 3:249755/148‑1 (MQ=255) aTCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCg > 4:5382/1‑142 (MQ=255) aTCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCg < 3:5382/142‑1 (MQ=255) tCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAg < 5:177288/149‑1 (MQ=255) tttCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCTCCGTACAGGGTa > 8:51492/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCGCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCTCCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTAt < 2:62899/148‑1 (MQ=255) ggCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGt > 5:166338/1‑149 (MQ=255) gataccctgtacggcgaagagctgccgggcctgctgaagtccggcgaggtgACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTc > 6:157221‑M1/52‑94 (MQ=255) gataccctgtacggcgaagagctgccgggcctgctgaagtccggcgaggtgACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTc < 5:157221‑M1/43‑1 (MQ=255) cgcACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGt < 7:164075/148‑1 (MQ=255) tACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCa > 6:136073/1‑133 (MQ=255) tACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCa < 5:136073/133‑1 (MQ=255) cGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCgg < 6:166338/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCt < 6:39336/149‑1 (MQ=255) cTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGa > 5:38880/1‑149 (MQ=255) ttGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTca < 1:151639/85‑1 (MQ=255) ttGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTca > 2:151639/1‑85 (MQ=255) gAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATc < 3:199908/148‑1 (MQ=255) gAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATc < 6:38880/148‑1 (MQ=255) aGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAg > 2:285734/1‑149 (MQ=255) ccATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGc < 1:89620/86‑1 (MQ=255) aTGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTggc < 8:262826/149‑1 (MQ=255) gTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAgg < 1:190846/100‑1 (MQ=255) gTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAgg > 2:190846/1‑100 (MQ=255) gTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCtt > 3:22586/1‑149 (MQ=255) gTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTAGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGTCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCtt < 6:16574/149‑1 (MQ=255) tACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCtt > 8:181087/1‑148 (MQ=255) ggCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGc > 5:90898/1‑149 (MQ=255) gacccagcgcgagctggaccaggcggtgcgtgaagtgctgggtCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATc < 5:157221‑M2/51‑1 (MQ=255) gacccagcgcgagctggaccaggcggtgcgtgaagtgctgggtCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATc > 6:157221‑M2/44‑94 (MQ=255) acccagcgcgagctggaccaggcggtgcgtgaagtgctgggtCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGt > 1:186925‑M2/43‑149 (MQ=255) CCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTc > 1:285734‑M1/1‑149 (MQ=255) ccagcgcgagctggaccaggcggtgcgtgaagtgctgggtCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCa > 2:235420‑M2/41‑149 (MQ=255) ccTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCg < 5:213581/143‑1 (MQ=255) ccTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCg > 1:205942/1‑148 (MQ=255) ccTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTAACGGGCGACGCCg > 6:213581/1‑143 (MQ=255) cTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGaa > 8:64699/1‑149 (MQ=255) tCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAg > 3:259886/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGc < 7:181087/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTgg < 2:49683/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTgg > 1:49683/1‑148 (MQ=255) gctgggtCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATg < 4:259886‑M2/142‑1 (MQ=255) tCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCg < 7:51492‑M2/148‑1 (MQ=255) | CGCGGTGCAGGCGGTCGTTGCCGTAGTAGTCCTTCAGATCGGTTTCGGCCTTGCCGATGCGCACGTACGGGTCCTTGAACAGGCCCATGTCGTACTTGGCACCCAGCACTTCACGCACCGCCTGGTCCAGCTCGCGCTGGGTCACCTCGCCGGACTTCAGCAGGCCCGGCAGCTCTTCGCCGTACAGGGTATCGTTCATGCTCATGTCGATGCCGGCCTTGATCGCCAGCTTGGCGGCTTCACGGCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCG > NC_002947/1600046‑1600335 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |