New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1866624 | 39 (0.800) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.7% | coding (342/534 nt) | PP_1670 | lipoprotein |
? | NC_002947 | = 1866651 | 46 (0.990) | coding (369/534 nt) | PP_1670 | lipoprotein |
CGGCCTGATCAAGTATGTGTACCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGCCAAGCGGGTGATTCCGCAAGGGCATC > NC_002947/1866504‑1866799 | cGGCCTGATCAAGTATGTGTACCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGc > 1:221415‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCTGATCAAGTATGTGTACCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGcag < 2:275483‑M2/149‑4 (MQ=255) cTGATCAAGTATGTGTACCGTGATGCTGCTGGAATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGAGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACAAGTGGCGGCTCGcaggt < 6:80470‑M2/149‑6 (MQ=255) tGATCAAGTATGTGTACCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGcaggt < 8:68825‑M2/148‑6 (MQ=255) tCAAGTATGTGTACCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGc < 3:206424/149‑1 (MQ=255) gtgtACCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCgg > 1:17414/1‑149 (MQ=255) tACCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCAt < 6:156009/149‑1 (MQ=255) aCCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCAt < 8:218849/148‑1 (MQ=255) ccGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATc > 7:211420/1‑148 (MQ=255) aTGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGca > 4:59254‑M2/1‑122 (MQ=255) aTGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGca < 3:59254‑M2/124‑3 (MQ=255) gctgctGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGc > 7:184156/1‑134 (MQ=255) gctgctGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGc < 8:184156/134‑1 (MQ=255) gctgctGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCgg > 8:186756/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCgg < 1:206908/148‑1 (MQ=255) tgctgGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTc < 7:135885/145‑1 (MQ=255) tgctgGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTc > 8:135885/1‑145 (MQ=255) tgGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACg > 6:74907/1‑149 (MQ=255) cATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGgc < 8:211420/149‑1 (MQ=255) aTCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGgcg > 4:94373/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGtgc < 2:17414/148‑1 (MQ=255) ccGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGGCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGtgc < 5:80470/148‑1 (MQ=255) aCGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTc > 3:51401/1‑149 (MQ=255) agaTGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGt < 1:153263/149‑1 (MQ=255) agaTGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGt < 3:94373/149‑1 (MQ=255) agaTGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGt < 6:95587/149‑1 (MQ=255) atgatTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTgg > 2:72739/1‑149 (MQ=255) gatTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCa > 8:20086/1‑149 (MQ=255) tCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTg > 2:215917/1‑149 (MQ=255) gcgcACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTg < 1:275483/149‑1 (MQ=255) cgcACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGt > 7:266796/1‑141 (MQ=255) cgcACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGt < 8:266796/141‑1 (MQ=255) aCCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACt < 5:74907/149‑1 (MQ=255) ccACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTAc > 5:86203/1‑149 (MQ=255) cACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTAcc < 6:86203/149‑1 (MQ=255) tGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTc > 2:199345/1‑148 (MQ=255) cAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACa > 2:269368/1‑146 (MQ=255) cAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACa < 1:269368/146‑1 (MQ=255) gCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTgg < 7:186756/148‑1 (MQ=255) gCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTgg < 1:72739/148‑1 (MQ=255) cGGTGCCCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGcaggtcaccggactgcagcgaactggcatccaccgtgggtgcgcgcatgacaatcatctctcgcgtcgagcgcggcagactgatgccagcagcatcacggtacacatactt < 1:55323‑M2/148‑112 (MQ=255) ggTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGcaggtcaccggactgcagcgaactggcatccaccgtgggtgcgcgcatgacaatcatctctcgcgtcgagcgcggcagactgatgccagcagcatcacggtacacatacttga < 2:243716‑M2/149‑114 (MQ=255) gTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTAc > 6:63917/1‑149 (MQ=255) cTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGcaggtcaccggactgcagcgaactggcatccaccgtgggtgcgcgcatgacaatcatctctcgcgtcgagcgcggcagactgatgccagcagcatcacggtacacatacttgatcaggc > 1:243716‑M2/1‑30 (MQ=255) tGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTa > 6:104685/1‑112 (MQ=255) tGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTa < 5:104685/112‑1 (MQ=255) tGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTc < 1:110911/118‑1 (MQ=255) tGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTc > 2:110911/1‑118 (MQ=255) tGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTgg < 1:1202/131‑1 (MQ=255) tGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTgg > 2:1202/1‑131 (MQ=255) gtgtTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGc > 1:33855/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGCCaa > 6:96658/1‑149 (MQ=255) aGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGCCAAGCGGGTGATTcc > 2:108101/1‑149 (MQ=255) gcggcTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGCCAAGCGGGTGATTCCGc > 3:39885/1‑147 (MQ=255) ggcTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGCCAAGCGGGTGATTCCGCAAgg < 7:20086/149‑1 (MQ=255) ggcTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGCCAAGCGGGTGATTCCGCAAgg < 5:63917/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGCCAAGCGGGTGATTCCGCAAGGGCATc > 4:231680/1‑149 (MQ=255) | CGGCCTGATCAAGTATGTGTACCGTGATGCTGCTGGCATCAGTCTGCCGCGCTCGACGCGAGAGATGATTGTCATGCGCGCACCCACGGTGGATGCCAGTTCGCTGCAGTCCGGTGACCTGGTGTTCTTCGCCACCAGTGGCGGCTCGCAGGTCAGCCATGCCGGCATCTATGTCGGGGACGGGCGCTTCGTGCATGCACCTTCCACCGGTGGCACCGTGCGCCTGGACTACCTGTCGAACAGCTACTGGGCCAAGGCCTACCTGCAGGCCAAGCGGGTGATTCCGCAAGGGCATC > NC_002947/1866504‑1866799 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |