New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3552623 | 45 (0.920) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 8.7% | coding (280/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
? | NC_002947 | = 3552650 | 41 (0.870) | coding (307/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
TGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGA > NC_002947/3552507‑3552795 | tGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGcgcag < 7:84413‑M2/149‑6 (MQ=255) cTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACCCGACCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTCGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCAAGCCGCAGGCttt > 7:284445/1‑149 (MQ=255) gACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTATTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCt > 1:215788/1‑149 (MQ=255) tGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGag < 2:185628/149‑1 (MQ=255) tATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGcgcag < 2:6598‑M2/133‑6 (MQ=255) tCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCCCGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCAc > 6:18233/1‑149 (MQ=255) ccGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCAccc > 8:214107/1‑149 (MQ=255) cGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGA‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCAcccc > 1:99667/1‑149 (MQ=255) cACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGATATGGCCACGGcgc < 1:256542‑M2/123‑4 (MQ=255) aCCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGt > 6:292249/1‑149 (MQ=255) ccgcACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTgg > 8:196699/1‑147 (MQ=255) cACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCa < 6:240576/146‑1 (MQ=255) cACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCa > 5:240576/1‑146 (MQ=255) cgcgCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAgtggt < 8:106610/149‑1 (MQ=255) cAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGtt < 8:84413/149‑2 (MQ=255) attaaGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGGCTGTTGCCATCGATGCAGGTTTTTTTTTTTTTCTTTGTCGAGTGCTTGTT‑TTATGTCATCTGGC‑TGGGCTCGGCGCAGGCTTTTTTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGgtgtg < 6:270617/139‑1 (MQ=255) aTGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGgtgtg > 5:270617/1‑142 (MQ=255) tGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGAGGTGTGTCGTCGcc > 8:72060/1‑149 (MQ=255) cgccTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCt > 2:5524/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACgg < 1:114551/77‑1 (MQ=255) gcgcCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACgg > 2:114551/1‑77 (MQ=255) gcgcCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGc > 6:229552/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTc > 5:217006/1‑149 (MQ=255) cATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGGAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGATTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGATTCCCGCAGCGTTCGGTGTa > 1:58124/1‑149 (MQ=255) cATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTAc < 2:215788/149‑1 (MQ=255) aTCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTgg > 1:106395/1‑98 (MQ=255) aTCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTgg < 2:106395/98‑1 (MQ=255) tGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTg < 3:269221/149‑1 (MQ=255) cAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCt > 1:300599/1‑149 (MQ=255) cTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCtgtg > 7:15761/1‑149 (MQ=255) cTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCtgtg < 1:5524/149‑1 (MQ=255) aCAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGAcc > 8:153686/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGAcc < 6:217006/148‑1 (MQ=255) cAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCt < 7:196699/149‑1 (MQ=255) aGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTg > 7:258578/1‑149 (MQ=255) gtcgATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACt > 7:24553/1‑130 (MQ=255) gtcgATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACt < 8:24553/130‑1 (MQ=255) gtcgATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGt < 5:34687/148‑1 (MQ=255) tGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGcgcagtcgccatcgacgaactgtaccagctgcatcgatggcaacaggcgctgcaaggcggcaaaaccttcattgcgggcgcgtgcggcggtgaacgggatactcatgtc < 3:273894‑M2/147‑110 (MQ=255) gCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATAcc < 7:214107/149‑1 (MQ=255) cGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGcgcagtcgccatcgacgaactgtaccagctgcatcgatggcaacaggcgctgcaaggcggcaaaaccttcattgcgggcgcgtgcggcg < 6:207139‑M2/124‑90 (MQ=255) cGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGcgcagtcgccatcgacgaactgtaccagctgcatcgatggcaacaggcgctgcaaggcggcaaaaccttcattgcgggcgcgtgcggcg > 5:207139‑M2/1‑35 (MQ=255) gCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTCTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtc > 7:94718/1‑149 (MQ=255) cGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcg < 5:18233/149‑1 (MQ=255) aGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGTCCACTGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCAGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt < 7:72060/149‑1 (MQ=255) aGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCATGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt > 4:167485/1‑149 (MQ=255) gT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGa < 8:258578/149‑1 (MQ=255) gT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGGGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGa < 2:99667/149‑1 (MQ=255) t‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAg < 8:15761/149‑1 (MQ=255) aTGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGcgcagtcgccatcgacgaactgtaccagctgcatcgatggcaacaggcgctgcaaggcggcaaaaccttcattgcgggcgcgtgcggcggtgaacgggatactcatgtccagcgccagtactgccac > 4:273894‑M2/1‑21 (MQ=255) cAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAgg > 3:30273/1‑149 (MQ=255) aCGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGa < 8:284445/149‑1 (MQ=255) | TGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGT‑GAATGCCAGCTGGC‑TGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGA > NC_002947/3552507‑3552795 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |