New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4459136 | 29 (0.590) | 3 (0.070) | 3/244 | NT | 9.7% | coding (161/1455 nt) | trkH‑I | potassium transporter |
? | NC_002947 | = 4459162 | 29 (0.640) | coding (187/1455 nt) | trkH‑I | potassium transporter |
GTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGACGCGTTCTTCGAAACCATGTCGGGAATCAC > NC_002947/4459016‑4459310 | gtgtATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGTCCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGGCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑Ccc < 3:286762‑M2/149‑3 (MQ=255) ttCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑Cccgaca < 2:175250‑M2/148‑7 (MQ=255) tCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑Cccgacaca < 4:103417‑M2/149‑9 (MQ=255) cTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCTAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑Cccgacacac > 4:267460‑M2/1‑139 (MQ=255) cTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACAcc > 2:183276/1‑149 (MQ=255) tCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCaa < 1:233431/149‑1 (MQ=255) aCGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACt < 2:270256/149‑1 (MQ=255) cGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTg < 1:167153/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGc > 6:4538/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGc < 5:37338/149‑1 (MQ=255) ttGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCg < 8:271733/149‑1 (MQ=255) ttGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCg < 6:206834/149‑1 (MQ=255) gcGTCAGCATTGGAATCACCATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGAc > 4:291760/2‑148 (MQ=255) gTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAg < 3:103417/149‑1 (MQ=255) gTCAGCATGGGGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTGCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAg < 3:212517/149‑1 (MQ=255) gCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTACCCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGa < 1:175250/149‑1 (MQ=255) aTGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACAt > 7:41181/1‑149 (MQ=255) tGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATg > 7:126385/1‑149 (MQ=255) tGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATg > 6:39945/1‑149 (MQ=255) tCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTg < 8:65426/148‑1 (MQ=255) cAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACATACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCt < 7:274040/148‑1 (MQ=255) aCGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGc < 1:183276/149‑1 (MQ=255) tgGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCGTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATTTATCTGCTCACGACGGCAAGCTgt < 8:41181/149‑2 (MQ=255) gtACGACCGCAGCGACGTCCTCGGTGGATTCGTCTGGTGGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGAAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGAAGGCAAGCTGGGTCa > 6:139571/1‑149 (MQ=255) cGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATc < 5:4538/148‑1 (MQ=255) gACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGTCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCgt > 4:230477/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGgtgt < 5:39945/146‑1 (MQ=255) tGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTc < 8:62099/144‑1 (MQ=255) tGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTc > 7:62099/1‑144 (MQ=255) tCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACAt > 6:30987/1‑148 (MQ=255) tgtgtgTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑Cccgacacacagaacgatcaggctcgaccagacgaatgcaccgaggtcgtcgctgcggtcgtacaccagcagcgtcagcattggaatcaccatgctgacggccaacgtgatcag < 4:57341‑M2/149‑114 (MQ=255) tgtgtCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑Cccgacacacagaacgatcaggctcgaccagacgaatgcaccgaggtcgtcgctgcggtcgtacaccagcagcgtcagcattggaatcaccatgctgacggccaacgtgatcagg < 8:12965‑M2/148‑115 (MQ=255) tgtgtCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑Cccgacacacagaacgatcaggctcgaccagacgaatgcaccgaggtcgtcgctgcggtcgtacaccagcagcgtcagcattggaatcaccatgctgacggccaacgtgatcagg > 3:57341‑M2/1‑34 (MQ=255) tCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGAc < 1:239724/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGTGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGAc < 7:249877/148‑1 (MQ=255) cTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGACGCGttctt < 8:126385/149‑1 (MQ=255) tggtggCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGACGCGTTCTTCGaa < 6:245333/149‑1 (MQ=255) gtggTCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGACGCGTTCTTCGaaa < 3:230477/148‑1 (MQ=255) cccGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGACGCGTTCTTCGAAACCATGTCGGGAATcac < 3:170312/149‑1 (MQ=255) cccGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGACGCGTTCTTCGAAACCATGTCGGGAATcac > 4:170312/1‑149 (MQ=255) | GTGTATTCCTGATCACGTTGGCCGTCAGCATGGTGATTCCAATGCTGACGCTGCTGGTGTACGACCGCAGCGACGACCTCGGTGCATTCGTCTGGTCGAGCCTGATCGTTCTGTGTGTCGGCCTGCTCATGGTGGCCCGCGGCGTA‑CCCGACACACCGCAACTGCGGACCAGGGACATGTATCTGCTCACGACGGCAAGCTGGGTCATCGTGTGCGCATTCGCGGCGCTGCCAATGGTGTTCATTCGACACATCAGTTACACGGACGCGTTCTTCGAAACCATGTCGGGAATCAC > NC_002947/4459016‑4459310 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |