Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 344,887 | G→T | 6.4% | A239D (GCC→GAC) | mutY ← | A/G‑specific adenine glycosylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 344,887 | 0 | G | T | 6.4% | 196.3 / 2.4 | 62 | A239D (GCC→GAC) | mutY | A/G‑specific adenine glycosylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/26); new base T (2/2); total (34/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 |
GGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTTGCTGCGCGTACACAGC > NC_002947/344742‑345033 | ggcgtggcgGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGcc > 8:202395/1‑148 (MQ=255) gcgtggcgGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCaa > 5:15118/1‑149 (MQ=255) ggcCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGGCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGc < 5:188631/149‑1 (MQ=255) cccgccagGCGCAGGCCGTGCTGGGAGGCCAGGGCGGCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCCCAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCAt < 6:203570/146‑1 (MQ=255) gccagGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCaa < 1:252032/149‑1 (MQ=255) ccagGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAAt < 6:15118/149‑1 (MQ=255) ggCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGt > 1:182378/1‑149 (MQ=255) ggCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGt > 1:40397/1‑149 (MQ=255) gTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAgcg < 2:182378/149‑1 (MQ=255) gtcgtcGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAgcg > 8:234936/1‑140 (MQ=255) gtcgtcGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAgcg < 7:234936/140‑1 (MQ=255) tcccggAGCTGGACGACATCGCCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCgg > 2:216220/6‑149 (MQ=255) cgAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTg > 7:39701/1‑149 (MQ=255) gAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTg < 3:195064/148‑1 (MQ=255) gCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGc < 3:137022/149‑1 (MQ=255) ggCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCgg < 5:139400/149‑1 (MQ=255) ggCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCg < 2:40397/148‑1 (MQ=255) gacatcgccCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCTATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGt < 1:216220/145‑1 (MQ=255) gtcgtcCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTg < 3:45101/136‑1 (MQ=255) gtcgtcCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTg > 4:45101/1‑136 (MQ=255) gtcCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTa < 5:1129/144‑1 (MQ=255) gtcCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTa > 6:1129/1‑144 (MQ=255) gtcCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCggg > 8:234738/1‑149 (MQ=255) tcCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGt > 7:232848/1‑149 (MQ=255) aGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTc > 3:28293/1‑149 (MQ=255) ggAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCg > 3:80458/1‑149 (MQ=255) ggCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTg > 3:192617/1‑148 (MQ=255) ggCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGc < 8:39701/149‑1 (MQ=255) gCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGTGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTg > 2:183796/1‑147 (MQ=255) gCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATCGCGCCTTCGTGCTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGATGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCa > 8:89689/1‑149 (MQ=255) tCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTgc > 3:249941/1‑108 (MQ=255) tCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTgc < 4:249941/108‑1 (MQ=255) acaAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTgc > 4:260847/1‑149 (MQ=255) acaAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTgc > 1:264792/1‑149 (MQ=255) accaccCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTATCCTCGCCGTGCAGGTGCGCtt > 1:120666/1‑149 (MQ=255) caccCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCg < 7:202395/149‑1 (MQ=255) cacaGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGTCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGTCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGcc > 2:275301/1‑149 (MQ=255) cacaGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGTCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGcc > 2:271094/1‑149 (MQ=255) cacaGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCg < 3:76920/144‑1 (MQ=255) cacaGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCg > 4:76920/1‑144 (MQ=255) caGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCcgc < 2:264792/149‑1 (MQ=255) aGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCcgcg > 3:225138/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGTGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCt < 1:183796/149‑1 (MQ=255) tGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCGTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAAc > 1:25505/1‑149 (MQ=255) gAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACgg > 7:287021/1‑149 (MQ=255) gcggcgGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACggg > 6:227943/1‑145 (MQ=255) ggcggTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCcgcg < 1:148078/133‑1 (MQ=255) ggcggTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCcgcg > 2:148078/1‑133 (MQ=255) ggTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAgg > 8:87408/1‑149 (MQ=255) ggTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAgg < 5:291488/149‑1 (MQ=255) gCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTg > 6:255425/1‑149 (MQ=255) cAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTgg < 7:87408/149‑1 (MQ=255) cAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTgg < 8:287021/149‑1 (MQ=255) gATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCt < 7:234738/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTtgct > 3:244540/1‑149 (MQ=255) cgcCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACggg > 2:240516/1‑125 (MQ=255) cgcCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACggg < 1:240516/125‑1 (MQ=255) gcagtCGTGGGTTGGCAACATTGGCATCTATGTGCGCCGTTGCGTGAGCGGCTTGCGCGGTTTGGACTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCTGGTTCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTtgctgc < 2:132060/145‑1 (MQ=255) gcCTTCGTGGTTGTCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTtgctgc < 1:271094/149‑1 (MQ=255) gcCTTCGTGGTTGTCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTtgctgc < 1:275301/149‑1 (MQ=255) tGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTTGCTGCGCGTaca > 8:13273/1‑149 (MQ=255) ggTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTTGCTGCGCGTaca > 7:198468/1‑148 (MQ=255) ggCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTTGCTGCGCGTACACAGc < 3:260847/148‑1 (MQ=255) | GGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCACAAACCACCCCACAGGCCGCTGGAAGGGCGGCGGTAAAGCAGGATGGCGCCTTCGTGGTTGGCCAACAGTGGCATCAATGTGCGCCGTTGCGGCAGCGCCTTGCGCGGTTTGGGCTCGGGGTAGCGGGTTTCCTCGCCGTGCAGGTGCGCTTCGCAGCCGCGCTGCAACGGGCAGATCAGGCAACTGGGCTTGCTGCGCGTACACAGC > NC_002947/344742‑345033 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |