| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,089,074 | G→C | 5.8% | G255G (GGC→GGG) | astA‑I ← | arginine N‑succinyltransferase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,089,074 | 0 | G | C | 5.8% | 224.2 / 3.8 | 69 | G255G (GGC→GGG) | astA‑I | arginine N‑succinyltransferase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/33); new base C (2/2); total (34/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 | |||||||||||
GTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTGG > NC_002947/5088929‑5089219 | gTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATggccgggccg > 6:42718/1‑149 (MQ=255)gTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATggccgggccg < 5:42718/149‑1 (MQ=255) tGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGGCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGgccgggccgg < 4:75364/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CAt > 1:129119/1‑149 (MQ=255) agggATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGAT‑GCCGGCCCGGCCATCGa < 6:152039/146‑1 (MQ=255) gTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGaa < 2:52593/149‑1 (MQ=255) gTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGAT‑GCCGGCCCGGCCATCGag > 5:283072/1‑148 (MQ=255) gTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGGGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGaa < 7:9766/149‑1 (MQ=255) tGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCg > 6:300360/1‑146 (MQ=255) tGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAg < 6:266490/149‑1 (MQ=255) aTGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCTCTGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGAt < 7:47447/149‑1 (MQ=255) aTGCGACAGTCGGCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGa < 1:285455/148‑1 (MQ=255) cGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTc < 4:269843/149‑1 (MQ=255) cGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTc > 5:172697/1‑149 (MQ=255) cGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTc < 6:172697/149‑1 (MQ=255) cGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGAT‑GCCGGCCCGGCCATCGagtgtgac < 6:283072/149‑8 (MQ=255) aCAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGa < 5:300360/149‑1 (MQ=255) aCAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGa < 2:64967/149‑1 (MQ=255) aCAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGa > 4:221446/1‑149 (MQ=255) tcgtcgCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACg > 6:287651/1‑147 (MQ=255) cgtcgCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAg > 3:171145/1‑149 (MQ=255) tcgCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGt > 5:189627/1‑145 (MQ=255) tcgCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGt < 6:189627/145‑1 (MQ=255) gCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTa < 3:271579/147‑1 (MQ=255) cGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATTGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGtt < 1:182561/149‑1 (MQ=255) ggTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGtt > 3:48247/1‑148 (MQ=255) ttGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGaa < 4:171145/149‑1 (MQ=255) ggATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCt > 2:229228/1‑149 (MQ=255) gaAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTc < 5:89918/144‑1 (MQ=255) gaAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTc > 6:89918/1‑144 (MQ=255) gaAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCt > 3:247395/1‑149 (MQ=255) aaaGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGGCCAGCCCCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATggccgggccg > 1:40492/1‑103 (MQ=255) aaaGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATggccgggccg < 2:40492/102‑1 (MQ=255) aGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGa < 3:221446/149‑1 (MQ=255) gTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCAt < 4:247395/149‑1 (MQ=255) gcgTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGc > 5:150686/1‑149 (MQ=255) aTCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAgcg > 4:26223/1‑149 (MQ=255) tCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCt > 4:48254/1‑133 (MQ=255) tGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCCG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCt > 5:72074/1‑149 (MQ=255) gTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGgt < 2:63415/149‑1 (MQ=255) ctacc‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCg > 2:123799/1‑89 (MQ=255) ctacc‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCg < 1:123799/89‑1 (MQ=255) acc‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCttt > 4:210342/1‑149 (MQ=255) cc‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCttt < 4:48247/148‑1 (MQ=255) aCCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTtgt > 3:17433/1‑142 (MQ=255) aCCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTtgt < 4:17433/142‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACgg > 7:41571/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACgg > 7:36735/1‑149 (MQ=255) ggTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGa < 7:33026/149‑1 (MQ=255) tcGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTgcg > 1:192036/1‑149 (MQ=255) tcGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTgcg > 8:277038/1‑149 (MQ=255) cgTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTgcgcgc > 3:281144/1‑149 (MQ=255) cgcgGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCg > 1:145351/1‑149 (MQ=255) cgcgGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCg < 3:210342/149‑1 (MQ=255) gcgGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCg > 8:122243/1‑148 (MQ=255) gcgGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCg > 6:299990/1‑148 (MQ=255) cgGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCAG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGa < 6:72074/149‑1 (MQ=255) gATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACa < 8:36735/149‑1 (MQ=255) gATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACa < 8:41571/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAg < 1:229228/148‑1 (MQ=255) ggCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAg > 2:153527/1‑148 (MQ=255) gCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGc < 4:281144/148‑1 (MQ=255) cAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAg < 2:129119/149‑1 (MQ=255) gtgtCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGgt < 7:122243/149‑1 (MQ=255) acacTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATg > 6:46667/1‑73 (MQ=255) acacTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATg < 5:46667/73‑1 (MQ=255) acacTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAg < 5:91932/139‑1 (MQ=255) acacTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAg > 6:91932/1‑139 (MQ=255) acacTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTa > 1:23806/1‑147 (MQ=255) acacTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTa > 6:264694/1‑147 (MQ=255) ttCGAT‑GCCGGCCCGGCCATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACATCg > 8:245046/2‑149 (MQ=255) gATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCgg < 2:192036/147‑1 (MQ=255) tGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAAc > 4:221705/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAAc < 3:26223/149‑1 (MQ=255) gccgggccgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACtt < 7:277038/149‑1 (MQ=255) ccgggccgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTg < 5:299990/149‑1 (MQ=255) cgggccgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTgg < 2:23806/149‑1 (MQ=255) gggccgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCg < 7:115989/75‑1 (MQ=255) gggccgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCg > 8:115989/1‑75 (MQ=255) | GTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACC‑GCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTGG > NC_002947/5088929‑5089219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |