| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 375,297 | T→G | 6.3% | L196R (CTG→CGG) | PP_0312 → | electron transfer flavoprotein subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 375,297 | 0 | T | G | 6.3% | 190.3 / 3.4 | 64 | L196R (CTG→CGG) | PP_0312 | electron transfer flavoprotein subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/33); new base G (2/2); total (28/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
GCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCTGCCGAGTGCGCCGAGCCGG > NC_002947/375151‑375443 | gctgctGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTgg > 1:40261/1‑149 (MQ=255)gctgctGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTgg < 2:242657/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTggg < 7:9471/149‑1 (MQ=255) ctgGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGt < 7:36345/147‑1 (MQ=255) ctgGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTg < 4:24768/148‑1 (MQ=255) gTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGTGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCcgc > 4:296592/1‑149 (MQ=255) gTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGcc < 2:87756/147‑1 (MQ=255) gTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGcc < 6:19557/147‑1 (MQ=255) gTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCcgc < 6:96012/149‑1 (MQ=255) cGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCACCCAGGCGCcga < 3:128594/144‑2 (MQ=255) cGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCACCCAGGCGCcga > 4:128594/1‑143 (MQ=255) aaGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGTGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGc < 3:296592/149‑1 (MQ=255) aaGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGc > 3:3567/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGa < 2:112854/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGa < 6:117930/149‑1 (MQ=255) cGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAgc < 2:156459/149‑1 (MQ=255) ccTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCg < 2:41909/149‑1 (MQ=255) tttGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCgg > 5:72215/1‑148 (MQ=255) tttGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCgg > 1:82270/1‑148 (MQ=255) tttGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCgg > 3:236773/1‑148 (MQ=255) gTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCgg < 6:242086/149‑1 (MQ=255) gTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCgg < 6:72215/149‑1 (MQ=255) gTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCgg < 7:111927/149‑1 (MQ=255) gTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCgg < 1:110781/149‑1 (MQ=255) tGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGc < 3:77810/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTAt > 4:182299/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATc < 2:82270/147‑1 (MQ=255) cGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCgg < 2:40261/149‑1 (MQ=255) gtgGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGcc < 1:272077/133‑1 (MQ=255) gtgGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGcc > 2:272077/1‑133 (MQ=255) tgGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCgcgcc < 4:3567/149‑1 (MQ=255) gATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCgcgccgg > 6:45427/1‑149 (MQ=255) gATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGACCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCgcgccgg > 6:260725/1‑149 (MQ=255) aaCCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAgt < 3:21337/130‑1 (MQ=255) aaCCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAgt > 4:21337/1‑130 (MQ=255) aCCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCgcgccggcgcc > 3:12567/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGcgccggcgccgg > 1:207998/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGcgccggcgccgg > 8:121067/1‑149 (MQ=255) aGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGTGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCgccggcgccggc < 8:24561/149‑1 (MQ=255) gcgccgcgccACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGc > 2:139332/1‑148 (MQ=255) gcgccgcgccACTGGCTGCTGCCAGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGc < 4:236773/148‑1 (MQ=255) gccgcgccACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTAT‑GCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGa > 5:309492/1‑149 (MQ=255) cgcgccACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATc > 8:132543/1‑122 (MQ=255) cgcgccACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATc < 7:132543/122‑1 (MQ=255) cgcgccACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGAc < 3:91098/149‑1 (MQ=255) cgcgccACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGAc > 2:308048/1‑149 (MQ=255) gctgctGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGc < 1:278527/148‑1 (MQ=255) ctgcCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACtgt < 3:182299/149‑1 (MQ=255) cGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCcgc < 5:45427/149‑1 (MQ=255) aGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCt < 5:260725/149‑1 (MQ=255) ccGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCcgc > 8:218611/1‑143 (MQ=255) ccGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCcgc < 7:218611/143‑1 (MQ=255) ccGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGa > 6:56891/1‑149 (MQ=255) ccGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCGGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGa > 8:247052/1‑149 (MQ=255) ccGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCGGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGa > 2:112814/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCGGGGAACTGGATCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTgg > 4:52607/1‑149 (MQ=255) ggCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTggcgg > 2:233913/1‑148 (MQ=255) ggCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACCCACTGTGCCGCGCCTGATCCTggcgcc > 2:229971/1‑147 (MQ=255) gAACTGGATCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCTGCCGa < 3:52607/149‑1 (MQ=255) tGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCTGCCGAGTgc > 7:238646/1‑149 (MQ=255) cgcCNGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCTGCCGAGTGCGCCGAGcc > 5:80412/1‑149 (MQ=255) gcCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCTGCCGAGTGCGCCGAGCCg < 1:139332/149‑1 (MQ=255) gcCGGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCTGCCGAGTGCGCCGAGCCg < 7:247052/149‑1 (MQ=255) gcCGGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCTGCCGAGTGCGCCGAGCCg < 1:112814/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGACGCGCCTGATACTGGCGGCTGCCGAGAGCGCCGAGCCgg > 2:249472/1‑149 (MQ=255) | GCTGCTGGTTATCGAAGGCGAGGCCTTTGAAGGTTATGCACCGGAGCAACTGGTGCAAGGCCTGCGGGCTGTGGATAACCAGTTCGCGCCGCGCCACTGGCTGCTGCCCGACAGCCGCACCGGTGGCGGGGAACTGGGTCGGCGCCTGGGTGCCGCGCTGGGCGAGCGCCCGGCAACCCGGGTATGGCAGGTCAAGGACGGCCAGTGTATCGGCCGCGCCGGCGCCGGCCAGCAAGACCTGCAACGCACTGTGCCGCGCCTGATCCTGGCGGCTGCCGAGTGCGCCGAGCCGG > NC_002947/375151‑375443 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |