Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,090,047 | A→G | 6.0% | L297P (CTG→CCG) | astA‑II ← | arginine N‑succinyltransferase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,090,047 | 0 | A | G | 6.0% | 197.4 / 2.3 | 68 | L297P (CTG→CCG) | astA‑II | arginine N‑succinyltransferase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/33); new base G (2/2); total (33/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.36e-01 |
CGTCTGTTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCT > NC_002947/5089901‑5090194 | cGTCTGTTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAgg < 3:252150/149‑1 (MQ=255) tatGTTCCCAGACCTCAAACCGCGACCACGCGCACGCTGGCGCCCACACCCACCCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCACGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGACCAGAAACACCCCGCGCTACTCCTGCAAAATGcc > 2:81229/3‑149 (MQ=255) cTGTTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGATGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCg > 7:126842/1‑149 (MQ=255) tGTTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGt > 5:164666/1‑149 (MQ=255) ttGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTg < 5:147652/149‑1 (MQ=255) gCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGc < 2:278858/148‑1 (MQ=255) aCCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCa < 7:25041/149‑1 (MQ=255) cTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAgg < 4:301227/149‑1 (MQ=255) cAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCTCCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTa > 4:264451/1‑149 (MQ=255) cAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTa > 8:112042/1‑149 (MQ=255) aaaCCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTAc < 1:228997/149‑1 (MQ=255) gcgACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGgcg > 3:256553/1‑149 (MQ=255) cgACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGgcgc < 8:279569/149‑1 (MQ=255) gACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGcgcc < 8:126842/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGcgccc < 4:92026/149‑1 (MQ=255) ggCGCACGCTGGCGCCCTCCCCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCt > 3:190189/1‑149 (MQ=255) ggCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCt < 4:218888/149‑1 (MQ=255) ggCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCt > 3:193989/1‑149 (MQ=255) cgcACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAGCACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCttt < 3:47324/149‑1 (MQ=255) cgcACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCttt < 3:121792/149‑1 (MQ=255) gcACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTg < 8:31277/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGc < 8:141401/149‑1 (MQ=255) tCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGcaca < 7:190749/112‑1 (MQ=255) tCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGcaca > 8:190749/1‑112 (MQ=255) cccTCGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACGGGGGCCTCTTTGAt < 1:81229/149‑1 (MQ=255) ccACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACCGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc > 2:61394/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc > 4:188978/1‑149 (MQ=255) cGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTc < 1:182924/149‑1 (MQ=255) cccAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCAc < 4:190189/149‑1 (MQ=255) cccAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCAc < 4:193989/149‑1 (MQ=255) aGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCgg > 1:303369/1‑149 (MQ=255) ccACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTgg < 6:164666/149‑1 (MQ=255) aGGCTGACCGGCTTGCCAGGCTCCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATc < 3:264451/147‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGc > 2:19970/1‑149 (MQ=255) tGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACCCCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCg > 1:170817/1‑149 (MQ=255) tGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCg > 8:106714/1‑148 (MQ=255) gACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGa > 2:52134/1‑149 (MQ=255) ccGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGAt < 8:28526/148‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGa > 5:308314/1‑146 (MQ=255) cGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGa < 6:308314/146‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGc > 5:136990/1‑149 (MQ=255) cGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGCGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGc < 1:80683/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGAAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGc > 2:80683/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAAGACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCa < 8:127285/149‑1 (MQ=255) gcgaGGCTCCCAGTGCA‑GTTCCAGCAACACGGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGTAGACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCggg < 4:105441/88‑1 (MQ=255) gCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTGCAGAAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTCTACACCACGTACGGGCGCCCCCCATAGACCgcg > 3:105441/1‑89 (MQ=255) gCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCagag < 1:52134/148‑1 (MQ=255) cAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTg > 2:124884/1‑149 (MQ=255) aCCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCAGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTgcgcgc < 7:112042/149‑1 (MQ=255) cccAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCa > 5:140783/1‑149 (MQ=255) aGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATg > 6:69589/1‑148 (MQ=255) a‑ggtccagCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGt > 6:255662/1‑149 (MQ=255) cagCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGgc > 1:115774/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCg < 6:136990/149‑1 (MQ=255) cgcgcgGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCg > 5:162783/1‑148 (MQ=255) gcgcgGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAg < 4:195694/131‑1 (MQ=255) gcgcgGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAg > 3:195694/1‑131 (MQ=255) gcgcgGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGaa < 4:256553/149‑1 (MQ=255) gTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCg < 5:69589/148‑1 (MQ=255) gtgtGCAACGGCCTGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGAt > 4:82341/4‑149 (MQ=255) tgtGCAACGGCCTGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTc > 7:288029/3‑136 (MQ=255) tgtGCAACGGCCTGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTc < 8:288029/134‑1 (MQ=255) tGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATg > 6:145241/1‑147 (MQ=255) tGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATg > 5:216853/1‑147 (MQ=255) tGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTa > 8:23772/1‑149 (MQ=255) cAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTa < 6:216853/147‑1 (MQ=255) cAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGt > 8:288437/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCt < 2:303369/149‑1 (MQ=255) | CGTCTGTTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCA‑GGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCT > NC_002947/5089901‑5090194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |