| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,293,721 | G→T | 6.6% | A222A (GCC→GCA) | mmsA‑II ← | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,293,721 | 0 | G | T | 6.6% | 222.4 / 3.9 | 70 | A222A (GCC→GCA) | mmsA‑II | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/28); new base T (3/2); total (40/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
CATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCA > NC_002947/5293576‑5293869 | cATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCa > 7:136728/1‑149 (MQ=255) aGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATcc < 5:88856/148‑1 (MQ=255) aGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGCGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATTGCATcc < 2:239570/148‑1 (MQ=255) ggCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATccac < 6:268530/149‑1 (MQ=255) agcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATAcaccac > 7:277153/1‑149 (MQ=255) accaccGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGAACACTCTTGACATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGCCATTTGCACccacca < 5:17579/145‑1 (MQ=255) caccGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCt > 5:44847/1‑149 (MQ=255) ccGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAA‑GAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTgc < 4:286974/149‑1 (MQ=255) gcgTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTgcc > 2:288080/1‑149 (MQ=255) tCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTg > 3:115953/1‑148 (MQ=255) tCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTg > 3:206969/1‑148 (MQ=255) ttGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcac > 4:127088/1‑149 (MQ=255) gCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcaccac > 1:123034/1‑149 (MQ=255) cccccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACg < 8:117746/149‑1 (MQ=255) cccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGtt > 3:96944/1‑149 (MQ=255) ccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTc < 1:288080/149‑1 (MQ=255) catcatTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGtt > 4:97216/1‑147 (MQ=255) ttGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGc < 4:69594/122‑1 (MQ=255) ttGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGc > 3:69594/1‑122 (MQ=255) cacGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGccggccgg > 4:68213/1‑148 (MQ=255) cacGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGt < 8:136728/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcacc > 8:208257/1‑125 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcacc < 7:208257/125‑1 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcacc > 8:204221/1‑125 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcacc < 7:204221/125‑1 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTAc > 2:206219/1‑148 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTAc < 1:206219/148‑1 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAAAGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAAACGCCTTCATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACg > 4:189074/1‑149 (MQ=255) ccATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCgg < 4:115953/148‑1 (MQ=255) tGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTc < 6:44847/149‑1 (MQ=255) tggctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAg > 4:66379/1‑149 (MQ=255) ggctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAgc < 4:47152/149‑1 (MQ=255) gctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAgc < 4:242589/148‑1 (MQ=255) tgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCTACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGACATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAgcgc > 5:169328/1‑148 (MQ=255) gTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGAcc < 4:297481/148‑1 (MQ=255) aCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcaccac < 6:261219/98‑1 (MQ=255) aCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcaccac > 5:261219/1‑98 (MQ=255) cGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAg > 1:265685/1‑148 (MQ=255) cGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATg < 3:66379/148‑1 (MQ=255) ccGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGCAGCATGGTCGa > 6:254462/1‑149 (MQ=255) gACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTGCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGa > 7:54388/1‑147 (MQ=255) aCTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAg > 8:90699/1‑149 (MQ=255) gTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATc > 6:161247/1‑149 (MQ=255) cccACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTc > 1:278801/1‑149 (MQ=255) cGACGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGGGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGAt < 4:191819/149‑1 (MQ=255) cGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGAt > 5:22718/1‑149 (MQ=255) aGGAAATCGCCTTGCTGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGCATGGt < 7:279875/149‑1 (MQ=255) cTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACg > 1:3030/1‑148 (MQ=255) gATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAgg > 7:110671/1‑149 (MQ=255) aTGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGgt > 1:60600/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTGCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGtt < 8:54388/149‑1 (MQ=255) tCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGtt < 4:96944/149‑1 (MQ=255) ggtggtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTg > 1:288149/3‑149 (MQ=255) gtggtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGc > 8:200036/2‑149 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCCTGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAg < 5:87136/142‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAg > 6:87136/1‑142 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGc < 3:68213/149‑1 (MQ=255) ggtggatgCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCg > 4:183559/1‑149 (MQ=39) gtgggtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGcc < 2:278801/147‑1 (MQ=255) gggtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCg > 6:76716/1‑146 (MQ=255) tgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa > 6:121646/1‑126 (MQ=255) tgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa < 5:121646/126‑1 (MQ=255) gCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGa > 1:301629/1‑149 (MQ=255) cAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGAt < 2:60600/149‑1 (MQ=255) aaaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAg < 7:66614/131‑1 (MQ=255) aaaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAg > 8:66614/1‑131 (MQ=255) aaaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATg > 3:179733/1‑149 (MQ=255) aaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGc > 2:154572/1‑124 (MQ=255) aaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGc < 1:154572/124‑1 (MQ=255) aTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGc > 5:203258/1‑149 (MQ=255) ggCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCa > 8:39365/1‑149 (MQ=255) | CATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATGGCCA > NC_002947/5293576‑5293869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |