| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,565,749 | G→A | 8.9% | H579H (CAC→CAT) | mutL ← | DNA mismatch repair protein MutL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,565,749 | 0 | G | A | 8.9% | 220.9 / 8.7 | 78 | H579H (CAC→CAT) | mutL | DNA mismatch repair protein MutL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/36); new base A (4/3); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
GGAAAAGTTTGTCCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGCCAGG > NC_002947/5565601‑5565896 | ggAAAAGTTTGTCCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCg > 2:225351/1‑149 (MQ=255) gAAAAGTTTGTCCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGt > 2:298252/1‑149 (MQ=255) gTTTGTCCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGc > 7:149831/1‑147 (MQ=255) gTTTGTCCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCaa < 5:88372/149‑1 (MQ=255) gTCCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCa > 7:27237/1‑149 (MQ=255) tCCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCCTGCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACCGCACCGTGGGAAGCCa > 1:84135/1‑149 (MQ=255) cAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATgg < 3:162199/149‑1 (MQ=255) cAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATg < 4:102225/148‑1 (MQ=255) cAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATg < 1:298252/148‑1 (MQ=255) gATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACTACCATGGTTGCACTGGGC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCTGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGtt < 6:161748/149‑2 (MQ=255) gATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTg > 8:126531/1‑149 (MQ=255) gATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCATGGCTTGCCACGGTg < 1:263437/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGag > 3:140835/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGag < 2:249652/149‑1 (MQ=255) cAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCTGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGagca < 3:198868/149‑1 (MQ=255) cAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGagca < 6:73956/149‑1 (MQ=255) ccccCTCGGGGGCCCGGTCGCACCACCAGGGTCCCCCTGGCC‑GCTGCGCTCGGGGTTTCCCATGCCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGCCAATCCCCCGCCGCCGGTGGGCGCGCACGCCACCGTGGCACGCCATGGTGCCGtgcgcgc < 2:84135/149‑5 (MQ=255) cATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCa > 6:56750/1‑148 (MQ=255) cATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCa < 5:56750/148‑1 (MQ=255) ggTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAg < 1:57741/147‑1 (MQ=255) ggTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAg < 6:222241/147‑1 (MQ=255) cAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTgcgc > 5:165339/1‑149 (MQ=255) ggTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCt > 5:5128/1‑149 (MQ=255) gTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCt > 3:76767/1‑148 (MQ=255) ggACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAAt < 8:149831/149‑1 (MQ=255) acgacCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGc > 5:301178/1‑149 (MQ=255) gacCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGa > 4:27860/1‑149 (MQ=255) gacCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATATCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGa > 2:181152/1‑149 (MQ=255) gTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTg < 4:76767/148‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGt < 3:19785/149‑1 (MQ=255) aCTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑Cg > 4:172738/1‑149 (MQ=255) aCTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑Cg > 4:176561/1‑149 (MQ=255) tGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCACACGGCACCATGGCTTGCCACGGTg < 2:116446/102‑1 (MQ=255) tGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCACACGGCACCATGGCTTGCCACGGTg > 1:116446/1‑102 (MQ=255) cTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGa < 1:136434/100‑1 (MQ=255) cTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGa > 2:136434/1‑100 (MQ=255) cTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGt < 6:165339/149‑1 (MQ=255) tCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTc > 5:5832/1‑149 (MQ=255) ggTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCgg > 8:134784/1‑149 (MQ=255) ttttCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAg > 2:26768/1‑149 (MQ=255) ttCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCa > 3:218734/1‑149 (MQ=255) aTGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTc > 6:24586/1‑149 (MQ=255) tCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTg < 8:27237/149‑1 (MQ=255) tCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTg < 5:24586/149‑1 (MQ=255) gcagGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAgg < 4:140835/149‑1 (MQ=255) gggCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGAGGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCgg > 1:8042/1‑149 (MQ=255) ggCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGt > 1:86485/1‑149 (MQ=255) gCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGtt < 2:53081/149‑1 (MQ=255) gTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAg < 5:40538/78‑1 (MQ=255) gTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAg > 6:40538/1‑78 (MQ=255) gTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTg < 8:287042/148‑1 (MQ=255) gTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTg > 7:287042/1‑148 (MQ=255) tctcGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCtt > 2:244019/1‑147 (MQ=255) tcGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGc > 6:291617/1‑149 (MQ=255) gggAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCa < 1:225351/145‑1 (MQ=255) gggAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCt > 3:134190/1‑149 (MQ=255) ggAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTg < 5:291617/149‑1 (MQ=255) gAATTGCCAGACGCCGGTTGGTGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGc < 5:205842/149‑1 (MQ=255) gCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAg > 6:71590/1‑149 (MQ=255) ccAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAg < 8:95224/138‑1 (MQ=255) ccAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAg > 7:95224/1‑138 (MQ=255) ccAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAg < 3:176561/148‑1 (MQ=255) ccAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAg < 3:172738/148‑1 (MQ=255) ccAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGc < 4:134190/149‑1 (MQ=255) cAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGc > 8:87105/1‑148 (MQ=255) aGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGc > 7:54364/1‑147 (MQ=255) aCGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGCACGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAg < 1:91861/149‑1 (MQ=255) cGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCgg > 6:169268/1‑149 (MQ=255) ggTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCggg < 6:5128/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGCGCACGGCACCGTGTCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCTATCACTTGTGC‑AGTACTCCATAAGGTCGGCAATCACGTCCTGCACCAGGCTGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGccttta < 6:301178/149‑5 (MQ=255) ttGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGAt < 4:218734/149‑1 (MQ=255) gcgcgcACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCt < 7:134784/148‑1 (MQ=255) tgctcGGCACCATGGCTTGCCACGGTGCCGTGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTc < 6:3748/115‑1 (MQ=38) tgctcGGCACCATGGCTTGCCACGGTGCCGTGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTc > 5:3748/5‑119 (MQ=38) ctcGGCACCATGGCTTGCCACGGTGCCGTGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGaa > 8:99836/3‑149 (MQ=255) ctcGGCACCATGGCTTGCCACGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGaa > 7:249604/3‑149 (MQ=255) cACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGc > 7:80707/1‑148 (MQ=255) aCCGTGGCAAGCCATGCTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGCCGGTTGGCTTCAGACTGCTTCAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGc > 4:204519/1‑147 (MQ=255) cGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGCCAgg < 5:169268/149‑1 (MQ=255) gTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGa < 6:17110/139‑1 (MQ=255) gTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGa > 5:17110/1‑139 (MQ=255) | GGAAAAGTTTGTCCAGATCGTCCAGCCCCATCTGGGTCCAGGTAGGACGACCATGGTTGCACTGGCC‑GCTGCGCTCGGTGTTTTCCATGTCGCGCAGCAGGGCGTTCATCTCGGGAATTGCCAGACGCCGGTTGGCGCGCACGGCACCGTGGCAAGCCATGGTGCCGAGCAGCTCATTGAGGTGCGCCTGAATGCGATCACTGGTGC‑CGTACTCCATAAGGTCGGCAAGCACGTCCTGCACCAGGCGGTTGGCTTCAGCCTGCTTGAGCAAGGCCGGGATCTGGCGAATCGCCAGG > NC_002947/5565601‑5565896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |