| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,790,152 | C→T | 8.9% | intergenic (+31/+37) | ynfM → / ← PP_5073 | efflux transporter/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,790,152 | 0 | C | T | 8.9% | 187.5 / 6.7 | 67 | intergenic (+31/+37) | ynfM/PP_5073 | efflux transporter/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/33); new base T (2/4); total (30/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.12e-02 | |||||||||||
GGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTCGGCGGCAG > NC_002947/5790007‑5790299 | ggTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCtgt < 7:127785/149‑1 (MQ=255)ggTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCtgt < 1:86835/149‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCtgtg < 4:6393/149‑1 (MQ=255) tgtTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTgg < 2:41007/149‑1 (MQ=255) gCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTG‑Cgg < 2:149121/148‑1 (MQ=255) cACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACACCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTG‑Cgggc < 3:114267/149‑2 (MQ=39) ccAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGgtgt < 7:280579/149‑1 (MQ=255) ccAGTGGCGCTTGAACGGGATCTGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTTCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGgtgt < 2:239344/149‑1 (MQ=255) tGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGAcc < 8:224562/149‑1 (MQ=255) gggCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCa < 2:226701/148‑1 (MQ=255) ggCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGGCTTGATGCCGGTGGCGTTGATGTTGGCTTTGCACCTGAGCAATTTGCCCCCCAAAACGGTGTGATGAATTCTTGGGCACCCCCCAACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGtgtgccaa > 1:31885/1‑144 (MQ=255) tGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTGTgggtg > 3:67504/1‑130 (MQ=255) tGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTGTgggtg < 4:67504/132‑3 (MQ=255) gAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGaa > 3:71813/1‑146 (MQ=255) gAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAagag > 2:175422/1‑149 (MQ=255) gAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAaga < 4:71813/148‑1 (MQ=255) aaCGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAgg < 1:72173/149‑1 (MQ=255) gATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCat > 5:83629/1‑148 (MQ=255) gATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCat > 1:241760/1‑148 (MQ=255) cGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCat > 3:31506/1‑145 (MQ=255) ggCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCtg > 4:289355/1‑113 (MQ=255) ggCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCtg < 3:289355/113‑1 (MQ=255) ggCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGGGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGGGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAGCCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatcagat < 1:175422/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatcagatca < 7:88149/149‑1 (MQ=255) tGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGt > 7:155475/1‑149 (MQ=255) ttCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatc > 3:124200/1‑139 (MQ=255) ttCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatc < 4:124200/139‑1 (MQ=255) cA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGAtctc > 1:228556/1‑149 (MQ=255) gCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCTATCAGATCAGTTGATGATCTCGa < 2:179990/149‑1 (MQ=255) gCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGa < 8:155475/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAata < 8:259528/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAatat > 5:167891/1‑149 (MQ=255) gCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGGGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGTGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatccacatcc < 8:133648/149‑1 (MQ=255) ccTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCACTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatcagatcag > 5:284800/1‑121 (MQ=255) ccTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCACTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatcagatcag < 6:284800/121‑1 (MQ=255) gtggCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCgg > 5:309148/1‑149 (MQ=255) gtggCGTTGCACCTGAGCAAGATGCCACCCAAAACGGTGTGATCCATTCGTCGGCACGCCCGCACCCACAACCTGAGGCAG‑CGGGTGTCACCACGAAGTGGCCAACAGATCAGTTGATGATCACGACTATATCCACATCCACTAcccag > 3:81991/1‑147 (MQ=255) tggCGTTGCGCCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGGGACCACGAAGAGGACATCAGATCAGGTGATGAGCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGc > 4:38546/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGTCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCt < 6:272900/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCt < 2:228556/148‑1 (MQ=255) ttGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCtcatc < 1:210247/149‑1 (MQ=255) cACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAgg > 1:178449/1‑149 (MQ=255) aCCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCtcatc > 8:27242/1‑145 (MQ=255) aCCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCtcatc < 7:27242/145‑1 (MQ=255) cTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTG‑Cggg < 4:78458/73‑1 (MQ=21) cTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTGTGGGTG‑Cggg > 3:78458/1‑73 (MQ=21) cTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGc > 3:250495/1‑149 (MQ=255) caGCAAGCTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCtt < 8:253082/148‑1 (MQ=255) aGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCGCGGCTCATCAGGTGCttt > 3:42621/1‑149 (MQ=255) gCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCtttt < 2:241760/149‑1 (MQ=255) aGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCa > 5:124633/1‑148 (MQ=255) gTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAAc < 2:31885/149‑1 (MQ=255) cACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCAc > 8:97030/1‑149 (MQ=255) cACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCACGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCAc < 4:42621/149‑1 (MQ=255) cAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCAc < 3:199761/145‑1 (MQ=255) cAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCAc > 4:199761/1‑145 (MQ=255) tgATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCAcc > 3:103133/1‑149 (MQ=255) tgATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCAc < 6:309148/148‑1 (MQ=255) aTGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCtt > 3:5386/1‑149 (MQ=255) tGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTg < 3:135750/149‑1 (MQ=255) tGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTg < 4:5386/149‑1 (MQ=255) aTTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTc < 4:31506/149‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCACCAACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCAACATCCACTTCCCGGCTCATCAGTTGCTTTTCAACATCACCGGTAAGCTTCAAATTGGTCTTGTCg > 6:259856/1‑149 (MQ=255) gggCACGAACGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAAAATCCACATCCACTTACCGGCTCATCAGGAGCTTTTCAACCTCACCGGACAGCTTCACCTTGGTCTtctct > 8:14772/1‑148 (MQ=255) gCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAAc < 6:167591/149‑1 (MQ=255) ccACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTcgg > 7:211138/1‑149 (MQ=255) ccACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGATCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTcgg > 7:98743/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGGAG‑GGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTCGGCGGCAg < 3:38546/149‑1 (MQ=255) | GGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCA‑GCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACGCCCGCACCCACAACCTGTGGGAG‑CGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTCGGCGGCAG > NC_002947/5790007‑5790299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |