Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,091,697 | C→A | 5.8% | P41Q (CCG→CAG) | PP_5343 → | putative Transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,091,697 | 0 | C | A | 5.8% | 223.1 / 3.3 | 69 | P41Q (CCG→CAG) | PP_5343 | putative Transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/33); new base A (2/2); total (34/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.23e-01 |
TGGAACCATTCGACAAGGATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGTCAGCCCCGGCTATTA > NC_002947/6091550‑6091844 | tGGAACCATTCGACAAGGATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCg < 6:198212/149‑1 (MQ=255) aaCCATTCGACAAGGATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTg > 4:5879/1‑149 (MQ=255) aaCCATTCGACAAGGATCCAGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGTACACGACCTCACACGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCTGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTg < 6:176018/149‑1 (MQ=255) ttCGACAAGGATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCGGCAGGTGcgtgg < 2:223072/149‑5 (MQ=255) ttCGACAAGGATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCA‑GCACCGGCAGGTGcgtggc < 7:134160/149‑6 (MQ=255) aaGGATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATAc > 3:68133/1‑149 (MQ=255) ggATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATAccg > 3:264187/1‑149 (MQ=255) gATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATAccgc < 1:267897/149‑1 (MQ=255) cGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAgg < 4:68133/149‑1 (MQ=255) cGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAgg > 3:127082/1‑149 (MQ=255) cATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGc > 6:47242/1‑148 (MQ=255) cATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCg < 3:5879/149‑1 (MQ=255) aacaGTAAGCCGCATCAGTAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCgg < 6:129419/149‑1 (MQ=255) aacaGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCTGTGCTGGTCGATACCGCCGATGGCGATTTCgg > 6:215797/1‑149 (MQ=255) caGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCa > 8:105388/1‑149 (MQ=255) gTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATTCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACt < 2:125768/149‑1 (MQ=255) gCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACtgtg > 3:118865/1‑148 (MQ=255) gCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATg < 4:264187/149‑1 (MQ=255) cATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCgg > 7:48678/1‑137 (MQ=255) cATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCgg < 8:48678/137‑1 (MQ=255) cAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCa > 2:195058/1‑149 (MQ=255) ccTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCggg < 3:242932/149‑1 (MQ=255) cTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGc > 7:1768/1‑149 (MQ=255) cccGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATAccgcc > 3:186980/1‑104 (MQ=255) cccGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATAccgcc < 4:186980/104‑1 (MQ=255) gCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGc < 4:118865/149‑1 (MQ=255) ttGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCTGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAAcc > 5:99786/1‑145 (MQ=255) ttGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCTGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAAcc < 6:99786/145‑1 (MQ=255) aCCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATgg > 5:259838/1‑149 (MQ=255) cAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGcc < 8:103805/135‑1 (MQ=255) cAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGcc > 7:103805/1‑135 (MQ=255) cAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGc > 5:280437/1‑148 (MQ=255) cAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCa < 5:60510/149‑1 (MQ=255) cTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTgca < 8:1768/149‑1 (MQ=255) gACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTgcagca > 7:232901/1‑149 (MQ=255) acacCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGTGCGATTTCTGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCAc < 5:215797/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCAcggcg > 8:243460/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCAcggcg > 1:308015/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCAcgg > 5:7559/1‑143 (MQ=255) cTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCAcgg < 6:7559/143‑1 (MQ=255) gCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGccc > 3:166465/1‑106 (MQ=255) gCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGccc < 4:166465/106‑1 (MQ=255) cGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATTCCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGccc > 1:252406/1‑104 (MQ=255) cGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGccc < 2:252406/104‑1 (MQ=255) cGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCAc > 3:39820/1‑149 (MQ=255) ttCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCActg > 2:89415/1‑149 (MQ=255) gTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCActgct < 6:280437/146‑1 (MQ=255) gTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTgg > 3:128624/1‑148 (MQ=255) gCCAGGGCGAACCGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTc < 3:77919/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTc < 4:39820/149‑1 (MQ=255) gggCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCg < 6:259838/149‑1 (MQ=255) aCAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTg < 3:157497/109‑1 (MQ=255) aCAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTg > 4:157497/1‑109 (MQ=255) cAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGa < 2:308015/149‑1 (MQ=255) ccTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCt < 7:105388/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCa < 3:67090/119‑1 (MQ=255) ttCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCa > 4:67090/1‑119 (MQ=255) cTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGTCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGAGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTAt < 8:232901/147‑1 (MQ=255) cTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATg < 1:89415/148‑1 (MQ=255) tGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGt > 7:136492/1‑148 (MQ=255) tGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGt > 1:1992/1‑148 (MQ=255) ggCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGc > 5:111772/1‑141 (MQ=255) ggCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGc < 6:111772/141‑1 (MQ=255) gaccagCACCGGCAGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGTCat > 7:65450/6‑148 (MQ=255) ccACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGTCAGc < 1:229092/149‑1 (MQ=255) ccagCACCGGCAGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGTCAGcc > 8:217802/4‑149 (MQ=255) cACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGTCAGcc > 2:55971/1‑149 (MQ=255) gCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGc < 3:71367/54‑1 (MQ=255) gCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGc > 4:71367/1‑54 (MQ=255) ccGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGTCAGCCCCGGCTAtt < 4:128624/148‑1 (MQ=255) ccGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGTCAGCCCCGGCTATTa < 1:195058/149‑1 (MQ=255) | TGGAACCATTCGACAAGGATCCCGCCATGTACAACAGTAAGCCGCATCAGGAACACGACCTCACCCGCTTGCACCAGCACATGCTAGACACCCGCCTGGCCGTTCTGGTCAGCCAGGGCGAACAGGGCCTTCTGGCCACGCACCTGCCGGTGCTGGTCGATACCGCCGAGGGCGATTTCGGCACTGTGTATGCCCACCTGGCCCGGGCCAACCGCCAATGGCAAGACCTGCAGCACGGCGGCGAAGCACTGCTGGTATTCCCCGGCGCCGATGCCTATGTCAGCCCCGGCTATTA > NC_002947/6091550‑6091844 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |