| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 516,282 | A→T | 6.3% | L237Q (CTG→CAG) | PP_0429 ← | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 516,282 | 0 | A | T | 6.3% | 202.4 / 2.9 | 68 | L237Q (CTG→CAG) | PP_0429 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/28); new base T (2/2); total (38/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
TCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGCGTGC > NC_002947/516141‑516430 | tCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTCGCTATTCCATGCCTGAGGCGCAATAGCGGCGGAGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACAAGCCAGCGCGGCTGCAGCCGAgg > 5:171573/1‑149 (MQ=255) cacaGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTTCGCACCAGCCCCCCCGGCTGCGGCcccgcgg > 5:176493/1‑146 (MQ=255) cacaGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGt < 6:130327/148‑1 (MQ=255) cacaGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCACCGCGGCTGCTGCcgcgct < 6:282538/148‑3 (MQ=255) acaGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGt > 6:178031/1‑147 (MQ=255) acaGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGt < 5:178031/147‑1 (MQ=255) gCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGaa > 6:275596/1‑149 (MQ=255) aCTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACg > 3:123202/1‑149 (MQ=255) ttGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCTGCTGCCGCGCTg < 3:193808/141‑1 (MQ=255) ttGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCTGCTGCCGCGCTg > 4:193808/1‑141 (MQ=255) gCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACgccag > 5:41427/1‑149 (MQ=255) gCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACgccag > 4:86918/1‑149 (MQ=255) ggTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTgcgc > 8:75014/1‑149 (MQ=255) ggTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTgcgc > 8:239943/1‑149 (MQ=255) gCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCgccggccg > 7:236908/1‑149 (MQ=255) gAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCGTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGc < 4:203243/149‑1 (MQ=255) tACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGAt < 3:15820/149‑1 (MQ=255) cTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATc < 6:41427/148‑1 (MQ=255) cTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCa < 6:172571/149‑1 (MQ=255) 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gCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTc < 3:67797/147‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTc < 3:101343/147‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTc > 5:268545/1‑147 (MQ=255) cAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTgcg < 8:174577/133‑1 (MQ=255) cAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTgcg > 7:174577/1‑133 (MQ=255) gTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGcc > 1:281463/1‑149 (MQ=255) tATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCAc > 6:312023/1‑149 (MQ=255) ttCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCAc < 6:276221/147‑1 (MQ=255) ccATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGgt < 6:267376/148‑1 (MQ=255) cATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGgtg > 4:160622/1‑148 (MQ=255) aTGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTa > 3:74719/1‑149 (MQ=255) gCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTa > 2:247842/1‑147 (MQ=255) ccTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTaga < 6:268545/148‑3 (MQ=255) cTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTgc > 2:208160/1‑93 (MQ=255) cTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTgc < 1:208160/93‑1 (MQ=255) gAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAgcgc > 6:99515/1‑149 (MQ=255) gCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCCCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGACATGATCAGTGCGAGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACtt > 7:21836/1‑149 (MQ=255) cAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGt > 2:146833/1‑123 (MQ=255) cAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGt < 1:146833/123‑1 (MQ=255) aaTAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTcc > 8:83599/1‑149 (MQ=255) ggcggTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCgggg < 7:239943/149‑1 (MQ=255) ggTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCTGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTg < 5:299264/149‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAgg > 3:231665/1‑147 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAgcgc < 2:281463/149‑1 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAg < 5:186731/146‑1 (MQ=255) ccccGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAg > 6:186731/1‑146 (MQ=255) gCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCtt > 3:90551/1‑149 (MQ=255) aGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGcc < 4:123202/149‑1 (MQ=255) aGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGCCATGATCAGTGCGCGGTGCTTGTCCAGAGCCCGCACGGTCTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTAGc > 3:221120/1‑148 (MQ=255) cTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCtt < 1:133460/144‑1 (MQ=255) cTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCtt > 2:133460/1‑144 (MQ=255) cTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCAt < 5:312023/149‑1 (MQ=255) ttGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATc > 2:295899/1‑149 (MQ=255) 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gccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCgcgc > 5:95993/1‑148 (MQ=255) ccagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCaa < 3:86918/149‑1 (MQ=255) cagcGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAAt < 7:75014/149‑1 (MQ=255) caccgcgGCTGCTGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAAt > 6:267648/4‑149 (MQ=255) gcgGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATgcgc > 6:93285/1‑149 (MQ=255) ggCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCg < 4:74719/149‑1 (MQ=255) cagcagCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGccggccgg > 2:81780/1‑44 (MQ=255) cagcagCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGccggccgg < 1:81780/44‑1 (MQ=255) cagcagCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGc < 4:257139/149‑1 (MQ=255) cagcagCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGc < 5:93285/149‑1 (MQ=255) agcCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGCGTGc < 3:160622/149‑1 (MQ=255) | TCCACAGCACTTGCTCCATGGTGAGGGTCGGGCCGAGTGTACTCAGCCGTGAGCCGCTCGCCCAGTGGCTATTCCATGCCTGAGGGGCAATAGCGGCGGTGGATGGCCCCGGCCAGCTTGCGCACCAGCCAGCGCGGCAGCAGCCGCGGTGCGAACGCCAGCCAGCGGTTGCGCCGGCCGGGCATGATCAGTGCGCGGTTCTTGTCCAGTGCCCGCACGGTGTACAGCGCCACTTCCTCGGGGCTGAGGCAGCGCGGCTTGCCATCGAGCCGCGCAATGCGCCGGCGTGC > NC_002947/516141‑516430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |