| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 554,939 | T→A | 7.0% | R51R (CGT→CGA) | rplP → | 50S ribosomal protein L16 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 554,939 | 0 | T | A | 7.0% | 197.7 / 5.0 | 71 | R51R (CGT→CGA) | rplP | 50S ribosomal protein L16 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/28); new base A (2/3); total (39/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
TGCAACCAAAGCGTACAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGATTCAGC > NC_002947/554791‑555081 | tGCAACCAAAGCGTACAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCAcgt > 6:149863/1‑149 (MQ=255) cAAAGCGTACAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTGTAGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCGGAAAGATGTTGATCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTgc > 1:83721/1‑149 (MQ=255) cAAAGCGTACAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTgcg > 5:161824/1‑149 (MQ=255) aGCGTACAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGACGTgcggac < 6:50943/149‑4 (MQ=255) aGCGTACAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGACGTgcggac < 8:100126/149‑4 (MQ=255) tACAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGAccc > 5:43028/1‑149 (MQ=255) cAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGt < 3:240537/149‑1 (MQ=255) aaaaTTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTc > 2:228016/1‑149 (MQ=255) aaTTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGATTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCACATCGAGTCCGAACGTCGTGCGCTGACCCGTccc > 2:255101/1‑147 (MQ=255) cGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGtt > 8:89347/1‑147 (MQ=255) cAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGc < 1:228016/149‑1 (MQ=255) aaGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTgc > 1:192008/1‑128 (MQ=255) gATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGACGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑Cg > 5:234744/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCACAACCGTTGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTaa < 3:171315/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGTTAGCAAAGTCTGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTaa < 1:255101/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGt > 2:233979/1‑147 (MQ=255) aCTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTaa < 1:233979/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTaa < 6:43028/149‑1 (MQ=255) tGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGGCACGGTAAGCGTGG‑CGGTAAg > 3:167845/1‑148 (MQ=255) ccACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCt < 6:125962/149‑1 (MQ=255) ccGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATcc > 3:296515/1‑149 (MQ=255) cGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGATGCTCGCGCTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCg > 5:218537/1‑149 (MQ=255) gTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATccat > 3:137932/1‑147 (MQ=255) gTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCgtgt < 5:130127/148‑1 (MQ=255) tCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCgt < 3:297602/145‑1 (MQ=255) tCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCgt > 4:297602/1‑145 (MQ=255) gCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTccc > 8:43089/1‑149 (MQ=255) gCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTccc < 6:132955/149‑1 (MQ=255) cgGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGc < 1:308906/149‑1 (MQ=255) aaGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTg > 5:87647/1‑118 (MQ=255) aaGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTg < 6:87647/118‑1 (MQ=255) aaGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGAtctc > 3:260489/1‑148 (MQ=255) aaGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTcc < 3:37714/149‑1 (MQ=255) aaGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTcc < 5:149863/149‑1 (MQ=255) aGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCaaaa < 8:58448/148‑1 (MQ=255) aGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCaaaa > 4:264879/1‑148 (MQ=255) cTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGACGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAAc < 6:234744/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAAcc > 7:161565/1‑149 (MQ=255) gCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCtt > 6:110104/1‑149 (MQ=255) gAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTGCGCTCGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGa < 2:305039/149‑1 (MQ=255) aaTTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCATATCGAGTCCGCACGGCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGGCCGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGa < 1:238757/149‑1 (MQ=255) cGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGtt < 7:89347/148‑1 (MQ=255) gaccTGAAACCAGTTGCTCGAGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCCTGCGCTGACCCGTCACGTTAACCGTGG‑CGGAAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCAGAACTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCg > 6:99569/3‑149 (MQ=255) gCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCaaaa > 4:187720/1‑133 (MQ=255) gCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCaaaa < 3:187720/133‑1 (MQ=255) ccTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTa > 2:58977/1‑149 (MQ=255) cTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTTAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTGCGTAt > 8:18105/1‑149 (MQ=255) cTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTAt > 1:166460/1‑149 (MQ=255) aaaGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACTGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGGTAAGGGTGG‑CGGTAAGATATGGATCCGTGTGGTCCCGGACAAGCGGATGTCAAAAACGCGTCTTGAGGTTCGTCTggg > 8:222688/1‑149 (MQ=255) aaaGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATgg < 1:11544/148‑1 (MQ=255) aaaGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATgg < 5:110104/148‑1 (MQ=255) aaaGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATgg < 7:43089/148‑1 (MQ=255) aaaGCTGTTGCTCGCGGTCGCCGCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGGGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGGGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATgg < 6:218537/148‑1 (MQ=255) tGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAg > 4:276277/1‑149 (MQ=255) ttGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGt < 3:264879/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGt > 5:181521/1‑147 (MQ=255) cTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAg < 6:161824/149‑1 (MQ=255) gcgGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAggg < 3:276277/148‑1 (MQ=255) cgGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCt > 8:235227/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTc > 3:134212/1‑149 (MQ=255) 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gAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGAt > 7:13653/1‑149 (MQ=255) gcGCACGACGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGATTCAg > 6:147264/2‑149 (MQ=255) cGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGATTCAGc > 1:46495/1‑149 (MQ=255) cGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTGGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGATTc > 1:273937/1‑146 (MQ=255) cGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAACCGTGG‑CGGTAATATCTGGTTCCGTGTTTTTCCGGAAAATCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGATTc < 2:273937/146‑1 (MQ=255) gCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGATTCAGc > 6:111560/1‑148 (MQ=255) cACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGATTCAGc > 6:130028/1‑147 (MQ=255) | TGCAACCAAAGCGTACAAAATTCCGCAAGCAGATGACTGGCCACAACCGTGGTCTGGCACTG‑CGCGGTAGCAAAGTCAGCTTCGGCGAATTCGCCCTGAAAGCTGTTGCTCGCGGTCGCCTCACCGCTCGCCAGATCGAGTCCGCACGTCGTGCGCTGACCCGTCACGTTAAGCGTGG‑CGGTAAGATCTGGATCCGTGTGTTCCCGGACAAGCCGATCTCCAAAAAACCTCTTGAGGTTCGTATGGGTAAAGGTAAGGGCTCCGTGGAATACTGGGTTGCCCAGATTCAGC > NC_002947/554791‑555081 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |