Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 590,361 | G→A | 6.3% | G162D (GGC→GAC) | PP_0500 → | dTDP‑4‑rhamnose reductase‑like protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 590,361 | 0 | G | A | 6.3% | 189.4 / 2.0 | 63 | G162D (GGC→GAC) | PP_0500 | dTDP‑4‑rhamnose reductase‑like protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (25/34); new base A (2/2); total (27/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
GCGAAAAGGACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATGCGCCGCTGTGGGGCACCTAC > NC_002947/590220‑590509 | gCGAAAAGGACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTc < 2:10000/149‑1 (MQ=255) cGAAAAGGACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTcc < 5:188062/149‑1 (MQ=255) gAAAAGGACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCt < 8:150681/149‑1 (MQ=255) gAAAAGGACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCt < 6:129455/149‑1 (MQ=255) aaaGGACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGa < 6:287738/149‑1 (MQ=255) aGGACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGAcc < 2:244066/149‑1 (MQ=255) ggACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGAccc < 5:20009/149‑1 (MQ=255) ggACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGAccc < 5:24567/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGa < 6:137297/149‑1 (MQ=255) aGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGa > 4:259447/1‑137 (MQ=255) aGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGa < 3:259447/137‑1 (MQ=255) ccGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAAc < 6:220788/148‑1 (MQ=255) gCTTGCGTGGCCAGGGCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAg < 8:707/149‑1 (MQ=255) ttGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCt < 4:218353/122‑1 (MQ=255) ttGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCt > 3:218353/1‑122 (MQ=255) tGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGa < 2:233351/141‑1 (MQ=255) tGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGa > 1:233351/1‑141 (MQ=255) tGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGACCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAgctgctgc > 6:161766/1‑149 (MQ=255) tGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGACCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAgctgctgc > 6:165934/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGc < 8:100232/149‑1 (MQ=255) ccTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCGTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCgat > 1:85310/1‑148 (MQ=255) tGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATc < 3:39904/148‑1 (MQ=255) tGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGACCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATc < 5:165934/148‑1 (MQ=255) tGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGACCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATc < 5:161766/148‑1 (MQ=255) gcATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGt > 5:242032/1‑149 (MQ=255) gcATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGt < 6:225027/149‑1 (MQ=255) cATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTg < 6:141811/149‑1 (MQ=255) gAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCaa < 2:185209/149‑1 (MQ=255) gAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCCATGATCGACGTGGCaa > 2:218185/1‑149 (MQ=255) aGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAAc > 1:159559/1‑149 (MQ=255) aGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAAc > 5:150729/1‑149 (MQ=255) aGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAAc > 4:284895/1‑149 (MQ=255) gcgtgcgGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCCATGGCGCATTCGGACGCTACCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCgg > 6:297233/1‑149 (MQ=255) gcgGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCga < 2:159559/149‑1 (MQ=255) gCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCgatga > 7:230159/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCg < 6:243471/140‑1 (MQ=255) ccTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCg > 5:243471/1‑140 (MQ=255) cTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTAGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATGGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGacgatg < 1:200935/149‑1 (MQ=255) cccGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTggg > 8:271801/1‑63 (MQ=255) cccGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTggg < 7:271801/63‑1 (MQ=255) cccGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGc < 6:197014/134‑1 (MQ=255) cccGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGc > 5:197014/1‑134 (MQ=255) cccGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCgatgat < 2:135328/145‑1 (MQ=255) cccGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCgatgat > 1:135328/1‑145 (MQ=255) agcaTGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGa < 4:207015/149‑1 (MQ=255) gcaTGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCCATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAg < 1:218185/149‑1 (MQ=255) tgtTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATc < 6:242032/149‑1 (MQ=255) gtTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAAcc < 6:208254/116‑1 (MQ=255) gtTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGt < 4:201355/144‑1 (MQ=255) gtTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGt > 3:201355/1‑144 (MQ=255) gctgcGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGt > 8:219708/1‑149 (MQ=255) gctgcGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGt > 5:99219/1‑149 (MQ=255) ctgcGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGt < 3:284895/148‑1 (MQ=255) tgcGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCg > 8:138238/1‑149 (MQ=255) tGGTTGCTGGACGAGAGCATAGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAAACCGACGCCGGTCGATGATGCCGCACGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGc > 7:173606/1‑148 (MQ=255) tGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCgg > 2:94337/1‑132 (MQ=255) tGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCgg < 1:94337/132‑1 (MQ=255) gACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTg > 6:167388/1‑149 (MQ=255) gagaGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCaa < 7:138238/149‑1 (MQ=255) gagCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATg > 1:510/1‑149 (MQ=255) aTCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATgc > 4:201019/1‑146 (MQ=255) aTCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATgc < 3:201019/146‑1 (MQ=255) tCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATGcgccg > 5:14607/1‑149 (MQ=255) gATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATGCGCCGCt > 4:170647/1‑149 (MQ=255) gcgcATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATGCGCCGCtgtg < 8:230159/148‑1 (MQ=255) gggCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATGCGCCGCTGTGGGGCAcc > 8:104021/1‑148 (MQ=255) gCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATGCGCCGCTGTGGGGCACCTAc < 5:167388/149‑1 (MQ=255) | GCGAAAAGGACGAGCCAGTGCCGCTGGGCTTGCGTGGCCAGGCCCTATGGCGCATCGAGCAGAGCGTGCGTGCGGCCTGCCCGCAGCATGTGTTGCTGCGCTTTGGCTGGTTGCTGGACGAGAGCATCGATGGCGCATTGGGCCGCTTCCTGACCCGTGCCGAGCAACCACAGGAGCTGCTGCTGGCCGATGATCGACGTGGCAACCCGACGCCGGTCGATGATGCCGCCCGAGTGATCCTGTCGGTGCTCAAGCAACTGGATTGCAATGCGCCGCTGTGGGGCACCTAC > NC_002947/590220‑590509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |