| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 640,263 | A→T | 6.3% | L161Q (CTG→CAG) | PP_0551 ← | MORN domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 640,263 | 0 | A | T | 6.3% | 239.7 / 5.0 | 79 | L161Q (CTG→CAG) | PP_0551 | MORN domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/40); new base T (2/3); total (36/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.43e-01 | |||||||||||
CCGTCGGCCAGTTCCAGTTGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGCC > NC_002947/640116‑640408 | ccGTCGGCCAGTTCCAGTTGGCCTTCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAg < 4:232808/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTTCCAGTTGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCa < 6:120197/148‑1 (MQ=255) ggCCAGTTCCAGTTGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑c < 7:42552/149‑1 (MQ=255) ccagttccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑cc > 3:18616/1‑148 (MQ=255) cagttccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCa < 5:99456/149‑1 (MQ=255) cagttccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGACA‑cc > 4:5322/1‑147 (MQ=255) agttccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAg > 7:50738/1‑149 (MQ=255) ttccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGTTACGGCTTGCTTGAGGGTGACCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAg > 1:242679/1‑149 (MQ=255) tccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCT‑GGGTGACCTGATCA‑ccccaggc < 4:135791/148‑6 (MQ=255) ccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGcc < 4:246897/148‑1 (MQ=255) ccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGcc < 4:255519/148‑1 (MQ=255) ccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGcc < 8:176435/148‑1 (MQ=255) ccagttGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCT‑GGGTGACCTGATCA‑ccccaggca < 6:28796/148‑7 (MQ=255) ggCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGaaa > 6:112000/1‑148 (MQ=255) gCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGaaa > 2:43250/1‑147 (MQ=255) gCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGaaa < 6:214206/147‑1 (MQ=255) gCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGaaa > 5:214206/1‑147 (MQ=255) gCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGaaa > 3:266416/1‑147 (MQ=255) gCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAAc < 5:112000/148‑1 (MQ=255) gCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACa < 4:189348/149‑1 (MQ=255) ccTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAg < 3:292648/149‑1 (MQ=255) cTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGc < 5:137962/149‑1 (MQ=255) tACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGaa < 4:266416/149‑1 (MQ=255) aGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGAGGCGGCCGTGGCGGAAGGCGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGAACAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTg > 7:174425/1‑149 (MQ=255) ttGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGcccc < 8:27812/129‑1 (MQ=255) ttGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGcccc > 7:27812/1‑129 (MQ=255) ttGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCgg > 1:161098/1‑147 (MQ=255) ttGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCgg > 3:288845/1‑147 (MQ=255) ttGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTCGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCgg > 3:85404/1‑147 (MQ=255) ttGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGAGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGACGTGTCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTCGGTTGATCATGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCATCGGCGAACTGGACcgcg > 3:4292/1‑147 (MQ=255) gAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTa < 7:55039/147‑1 (MQ=255) aaCTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGAc > 6:33897/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGCGCGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAAc > 1:63106/1‑134 (MQ=255) cTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAAc < 2:63106/133‑1 (MQ=255) tGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGGCCTc > 8:47179/1‑149 (MQ=255) gCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGc > 7:203406/1‑149 (MQ=255) tATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTg < 5:33897/149‑1 (MQ=255) cTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCt < 1:195366/143‑1 (MQ=255) cTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCt > 2:195366/1‑143 (MQ=255) tGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGgccatg < 8:203406/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGgccatgccat < 2:242679/148‑1 (MQ=255) cttgcttgAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCg > 4:220165/1‑149 (MQ=255) gcttgAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGccc > 5:25199/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGt < 1:215970/149‑1 (MQ=255) tGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGc < 4:18616/149‑1 (MQ=255) tGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGc < 7:269936/149‑1 (MQ=255) tGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGc < 3:220165/149‑1 (MQ=255) ccTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCAc < 7:84384/149‑1 (MQ=255) cTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACt > 6:210889/1‑149 (MQ=255) gC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGc < 1:43250/149‑1 (MQ=255) gcggcgGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCTAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTcc < 4:85404/148‑1 (MQ=255) gcggcgGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTcc < 4:288845/148‑1 (MQ=255) gcggcgGCCGTGGCGGAAGGTGAAGCTATAGTGGCTGACTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATTCCAATCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCt > 7:195113/1‑149 (MQ=255) cggcggCCGTGGCGGAAGGCGCCGCTATAGTGGCTGCCTTGGGTGAGCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCACCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTTCCACTGGCCGTCCtt < 8:174425/149‑1 (MQ=255) gCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCgg > 2:62870/1‑149 (MQ=255) ggAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCg > 3:223120/1‑149 (MQ=255) ggAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCg < 6:25199/149‑1 (MQ=255) gAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACt > 4:161182/1‑71 (MQ=255) gAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACt < 3:161182/71‑1 (MQ=255) gTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTAc > 6:47714/1‑147 (MQ=255) gCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGt < 1:34886/140‑1 (MQ=255) gCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGt > 2:34886/1‑140 (MQ=255) gCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGc < 8:50738/149‑1 (MQ=255) gCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGc > 2:80631/1‑149 (MQ=255) gTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTgg < 5:210889/149‑1 (MQ=255) gTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTgg < 1:80631/149‑1 (MQ=255) gTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTg < 1:62870/148‑1 (MQ=255) tGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTggg < 1:197937/149‑1 (MQ=255) gCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTgggg < 3:5322/148‑1 (MQ=255) tGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAg > 5:148895/1‑149 (MQ=255) gggcctgggTGACCTGATCACCCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGcc > 4:13958/7‑140 (MQ=255) gggcctgggTGACCTGATCACCCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGcc < 3:13958/134‑1 (MQ=255) gCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CAGCGGTATACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGt > 5:215062/1‑149 (MQ=255) gcctgggTGACCTGATCACCCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGt > 2:38578/5‑149 (MQ=255) cTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTc > 4:6078/1‑148 (MQ=255) ggggTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGAt > 3:108623/1‑149 (MQ=255) gggTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGa < 2:161098/147‑1 (MQ=255) aTCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGc < 6:148895/148‑1 (MQ=255) tCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGcc > 5:141979/1‑148 (MQ=255) | CCGTCGGCCAGTTCCAGTTGGCCTGCACCGTCGTACAGGTCGTCCTTGAACTGGCCGCGGTATGTCTGGT‑‑CGGCTTGCTTGAGGGTGCCCTCGC‑CGTCGCGGCGGCCGTGGCGGAAGGTGCCGCTATAGTGGCTGCCTGGGGTGATCAGGTCA‑CCCAGGCCCTGAAACAGCCCCTCGGCGAACTGG‑CCGCGGTAGACCTCGCCGTTCTGGCCATGCCATTCGCCCTGGCCGTGCCACTGGCCGTCCTTGAAGCTGCCGGCGTACCAGCTGCCGTTGGGGTAGTCGATCCGGCC > NC_002947/640116‑640408 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |