| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 699,722 | A→G | 43.8% | intergenic (+115/‑129) | PP_t06 → / → PP_23SD | tRNA‑Ala/23S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 699,722 | 0 | A | G | 43.8% | 31.3 / 87.5 | 73 | intergenic (+115/‑129) | PP_t06/PP_23SD | tRNA‑Ala/23S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/19); new base G (14/18); total (36/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTACGAAT > NC_002947/699574‑699800 | gaggTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGa < 5:129654/149‑1 (MQ=37) aGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGaa > 8:249417/1‑148 (MQ=37) aGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGaa > 2:140203/1‑148 (MQ=37) aGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGaa > 1:18582/1‑148 (MQ=37) cGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCCTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAacac > 6:25074/1‑149 (MQ=37) ggTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACAcc < 1:16099/149‑1 (MQ=37) gATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGtt < 5:275971/148‑1 (MQ=37) aTCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGttt > 4:74369/1‑148 (MQ=37) aTCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGttt > 4:994/1‑148 (MQ=37) aTCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGttt > 7:151669/1‑148 (MQ=37) ccGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCAc < 7:249417/148‑1 (MQ=37) cagCTTGGCTCCACCACTTTCGCAGTACGCAGTTACTTGTCAGAAATTAGAAATGAACATTC‑ATCTCGAATGTTGATTTCTTGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCAc < 7:268818/146‑1 (MQ=255) cTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCActgct < 7:55131/149‑1 (MQ=37) ttGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCActgctg > 6:153844/1‑149 (MQ=37) ggCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCtgg < 5:153844/148‑1 (MQ=37) gCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCtggt < 4:71790/148‑1 (MQ=37) gCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCtggt < 1:260768/148‑1 (MQ=37) gCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCtggt > 2:260768/1‑148 (MQ=37) tacaccacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGa < 4:232494/147‑1 (MQ=37) tCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGa > 6:210200/1‑149 (MQ=37) ccaccaCTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGAt > 7:51410/1‑149 (MQ=37) ccaccaCTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCtgg > 5:50492/1‑144 (MQ=37) ccaccaCTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCtgg < 6:50492/144‑1 (MQ=37) caccacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGAt > 4:120328/1‑148 (MQ=37) caccacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATc < 8:151669/149‑1 (MQ=37) ccacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAg > 2:41402/1‑149 (MQ=37) tttCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCt > 2:117617/1‑148 (MQ=37) ttCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCt > 4:44073/1‑147 (MQ=37) ttCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCt > 4:40017/1‑147 (MQ=37) tCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTaa < 5:84660/148‑1 (MQ=37) cGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATTCATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAg < 1:218015/148‑1 (MQ=255) cGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAg < 2:194476/148‑1 (MQ=37) cGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAg < 1:213724/148‑1 (MQ=37) ctgaGTTACTTTTCAGTCCTTAGATATGAACATTC‑AGCTAGAATTTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTGGGATATTTCATAGATATAGGG‑TGAACAGCAGTTTCACTGCTGGTTGATCAGGCTAAGGTAAAAt < 5:190343/145‑1 (MQ=11) cGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAAtt < 6:9435/149‑1 (MQ=37) aGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATTAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt < 5:25074/149‑1 (MQ=37) aGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt > 6:203846/1‑149 (MQ=37) aGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt < 1:140203/149‑1 (MQ=37) aGTTACTTGTCAGAACTTAGAAAAGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt < 7:55481/149‑1 (MQ=255) ttACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTTATTTCTGGCTTTTGTAAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACAAGTTTCAATGCTGGTGTATCATGCTAAGTTAAAATTTGTGa > 4:229709/1‑149 (MQ=11) ttACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt > 8:131138/1‑147 (MQ=25) ttACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 3:74369/149‑1 (MQ=25) ttACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 1:245476/149‑1 (MQ=25) ttACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 5:184482/149‑1 (MQ=25) tACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 8:51410/148‑1 (MQ=25) tACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 1:224272/148‑1 (MQ=35) aCTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 1:103934/147‑1 (MQ=21) aCTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa > 2:103934/1‑147 (MQ=21) aCTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAg < 1:117617/148‑1 (MQ=21) aCTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACATGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 1:226082/148‑1 (MQ=21) aCTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGt > 5:70000/1‑149 (MQ=34) ttGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt > 4:113355/1‑143 (MQ=21) ttGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt < 3:113355/143‑1 (MQ=21) gTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCTAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTc < 5:210200/147‑1 (MQ=21) cAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGc < 7:131138/148‑1 (MQ=21) aaaagccaGAAATCAACATTCGAGCT‑GAATGTTCATTTCTGGCTTTTGTAAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGTTAAAATTTGTGAGTTCTGCTc > 5:293879/8‑149 (MQ=11) aGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTc < 4:198625/149‑1 (MQ=21) aGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCt > 2:287649/1‑148 (MQ=34) aGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCt < 1:287649/148‑1 (MQ=34) aaCTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCg > 6:278834/1‑148 (MQ=34) cTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGa > 1:10823/1‑147 (MQ=34) ttAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGa > 4:26773/1‑146 (MQ=34) aGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAagag > 1:255336/1‑149 (MQ=34) gAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAagag > 3:189785/1‑148 (MQ=34) gAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAagag < 1:82171/148‑1 (MQ=34) aaaTGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTaaa > 2:61664/1‑123 (MQ=25) aaaTGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTaaa < 1:61664/123‑1 (MQ=25) aaTGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCaa < 4:189785/149‑1 (MQ=34) aaTGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATATCTGGCTTTAGACAGATCGTTCTTTAAAAATTCGTATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGATTCACTGCTGGAGGATCACGCTAAGGAAAAATTAGTGACTTCTGCTCGAAAGAGCaa > 3:122056/1‑149 (MQ=11) aTGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGtt < 7:106539/92‑1 (MQ=37) aTGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGtt > 8:106539/1‑92 (MQ=37) aaCATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTa > 8:84759/1‑149 (MQ=34) cATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTCGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTAc > 1:251437/1‑148 (MQ=21) tC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTACGAAt > 4:17191/1‑149 (MQ=18) | GAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTACGAAT > NC_002947/699574‑699800 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |