| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 704,281 | A→C | 6.4% | Q125P (CAG→CCG) | PP_5745 → | paraquat‑inducible protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 704,281 | 0 | A | C | 6.4% | 281.3 / 6.1 | 89 | Q125P (CAG→CCG) | PP_5745 | paraquat‑inducible protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/43); new base C (3/3); total (43/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCTGG > NC_002947/704137‑704424 | cGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCg < 7:192119/149‑1 (MQ=255) cacCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTCCTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCttt < 1:160921/149‑1 (MQ=255) cacCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCttt < 8:105046/149‑1 (MQ=255) acCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCGATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATGCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtgaa < 8:8542/149‑4 (MQ=255) acCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtgaa < 1:36823/149‑4 (MQ=255) acCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtgaa < 3:19307/149‑4 (MQ=255) acCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtga > 4:19307/1‑146 (MQ=255) catcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCgg > 5:233874/1‑149 (MQ=255) aatcatGTCCGGTGTAATCACCCTGATCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATACTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCgg > 8:186225/2‑149 (MQ=255) atGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGccc < 6:128311/148‑1 (MQ=255) atGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCg > 2:107118/1‑149 (MQ=255) gTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCgg > 6:45945/1‑148 (MQ=255) tCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCa < 1:48671/149‑1 (MQ=255) cGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGc > 3:49051/1‑149 (MQ=255) ggTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCg < 4:28583/149‑1 (MQ=255) atcaCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATAtt > 2:146604/1‑149 (MQ=255) tcaCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATAtt > 3:255238/1‑148 (MQ=255) tcaCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTg < 4:232596/149‑1 (MQ=255) caCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGa > 6:264219/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGAt < 6:233874/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTCTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGAt < 5:264219/149‑1 (MQ=255) cccTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATg > 4:33871/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCAGTTCAGCGGCGGCAGCCGCATTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATg > 8:244311/1‑148 (MQ=255) aaGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGc < 3:74547/147‑1 (MQ=255) aaGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCtt < 1:290230/149‑1 (MQ=255) actgCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATc < 7:186225/146‑1 (MQ=255) ggCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCg > 5:53572/1‑148 (MQ=255) tGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAAtt > 5:102138/1‑148 (MQ=255) tgcactttGGGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCAtt < 7:72793/143‑1 (MQ=255) ccATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCGCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTggg < 5:216429/149‑1 (MQ=255) cATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGgc < 4:255238/149‑1 (MQ=255) aTTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGgcg > 8:181874/1‑149 (MQ=255) ttGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGgcgc < 5:45945/149‑1 (MQ=255) gCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCt < 4:49051/148‑1 (MQ=255) cGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTgg < 1:146604/149‑1 (MQ=255) cGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTg < 3:33871/148‑1 (MQ=255) ggCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGt > 5:180596/1‑149 (MQ=255) tggtgTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCAt < 6:180596/148‑1 (MQ=255) tggtgTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCAt < 1:107118/148‑1 (MQ=255) tggtgTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATg < 4:228844/149‑1 (MQ=255) tggtgTTCATTGCAAGTATACTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATg > 6:111916/1‑149 (MQ=255) gtgtTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGTGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCt > 3:126797/1‑149 (MQ=255) gtgtTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGc < 4:68676/100‑1 (MQ=255) gtgtTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGc > 3:68676/1‑100 (MQ=255) tgtTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTg > 7:174592/1‑149 (MQ=255) 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cAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTGCCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCg < 7:22110/149‑1 (MQ=255) cAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCg > 8:183481/1‑149 (MQ=255) gTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGAc < 1:14999/140‑1 (MQ=255) gTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGAc > 2:14999/1‑140 (MQ=255) cTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTg < 1:4814/148‑1 (MQ=255) tGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGc > 2:36679/1‑148 (MQ=255) gTCCCCACGTTCAAGCTGGTTGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGTACATCTTCTTCATTGcc < 6:102138/147‑1 (MQ=255) ccccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATcc > 8:266695/1‑149 (MQ=255) ccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCt < 3:71618/124‑1 (MQ=255) ccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtg < 4:266128/149‑1 (MQ=255) ccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtg > 3:136161/1‑149 (MQ=255) ccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtg > 5:249991/1‑149 (MQ=255) aCGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtggt < 7:181874/149‑1 (MQ=255) aCGTTAAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtggt > 3:197838/1‑149 (MQ=255) gtggGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTg > 8:125936/1‑127 (MQ=255) gtggGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGaa < 6:53572/149‑1 (MQ=255) 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cTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGc < 6:249991/149‑1 (MQ=255) gtACTCCGTTCAGCGGTGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCTAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAgt < 4:126797/148‑1 (MQ=255) aCTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAgtgt < 8:174592/148‑1 (MQ=255) cTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTc > 5:311708/1‑148 (MQ=255) tCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCg > 7:189361/1‑148 (MQ=255) tCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAAGTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCg > 5:220115/1‑148 (MQ=255) tCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGAGATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGTGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCAGCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCGGAATAGCCAGTGTCg > 5:295533/1‑148 (MQ=255) ggccgaaaGCGGCTGCCGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCg > 3:191768/8‑148 (MQ=255) ccGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGaa < 8:26896/149‑1 (MQ=255) ccgaaaGCGGCTGCCGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAg > 1:216159/6‑149 (MQ=255) cGTTCAGCGGCGTCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGaa < 7:183481/148‑1 (MQ=255) gTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGCCATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGc > 7:146563/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTAATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTTGCAGTCGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAg < 1:36679/149‑1 (MQ=255) cggcggCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTg > 7:94271/1‑121 (MQ=255) cggcggCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTg < 8:94271/121‑1 (MQ=255) cggcggCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCt > 2:48856/1‑149 (MQ=255) gcggcAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCTAAGCCAACCTgg < 1:186651/149‑1 (MQ=255) | CGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGT‑GGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCTGG > NC_002947/704137‑704424 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |