Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 797,509 | G→A | 9.3% | intergenic (+33/‑44) | PP_0682 → / → PP_0683 | inner membrane protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 797,509 | 0 | G | A | 9.3% | 176.4 / 6.8 | 64 | intergenic (+33/‑44) | PP_0682/PP_0683 | inner membrane protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/26); new base A (3/3); total (35/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
TCATGGATGCGCAGAACATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTCAA > NC_002947/797361‑797656 | tCATGGATGCGCAGAACATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTgggg > 3:37471/1‑149 (MQ=255) aTGGATGCGCAGAACATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTgggg > 7:60401/1‑147 (MQ=255) gATGCGCAGAACATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGgggcggg < 1:187236/149‑1 (MQ=255) aaCATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGc < 6:41622/149‑1 (MQ=255) aTCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTcc > 5:78122/1‑149 (MQ=255) tctcCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTgggg > 6:102686/1‑131 (MQ=255) tctcCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTgggg < 5:102686/131‑1 (MQ=255) tcCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCca > 8:130532/1‑148 (MQ=255) gATTACCTGATGTGGTAAGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑Gatat < 8:60401/149‑1 (MQ=255) agcTGTTGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑TATATCGa < 3:278281/146‑1 (MQ=255) ccTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAgg > 6:56117/1‑149 (MQ=255) ccTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAg < 1:54481/148‑1 (MQ=255) tcatcCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGc < 6:78122/149‑1 (MQ=255) tcatcCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGc < 7:130532/149‑1 (MQ=255) atcCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCgt > 4:234900/1‑149 (MQ=255) atcCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCACACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCgt > 2:225468/1‑149 (MQ=255) atcCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTATGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCgt > 1:178889/1‑149 (MQ=255) gTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGAc > 1:116099/1‑122 (MQ=255) gTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGAc < 2:116099/122‑1 (MQ=255) gTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCCAGGATCAACTGACGACTGGCATCAGTCAAGCCTTGCGCa > 5:305552/1‑148 (MQ=255) ttCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTc < 5:56117/149‑1 (MQ=255) cATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTccagct > 1:207421/1‑145 (MQ=255) cATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTc < 2:207421/144‑1 (MQ=255) cATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTa > 1:39041/1‑149 (MQ=255) cATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCGTGCGCAGTCTCCCGTCCTGTa > 8:171336/1‑149 (MQ=255) gggCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTc > 4:278192/1‑141 (MQ=255) gggCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTc < 3:278192/141‑1 (MQ=255) gggCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACa > 5:256060/1‑148 (MQ=255) tACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACaaaaaa > 5:224133/1‑149 (MQ=255) ccTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAAt < 4:37471/148‑1 (MQ=255) cTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGa < 1:298484/149‑1 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTg < 2:148394/129‑1 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTg > 1:148394/1‑129 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCAt > 6:194363/1‑149 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCAt < 2:178889/149‑1 (MQ=255) gCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCAt > 7:165509/1‑149 (MQ=255) tGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGc > 2:215521/1‑149 (MQ=255) aCCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGt > 5:12172/1‑149 (MQ=255) cAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTgg > 1:60705/1‑149 (MQ=255) aaGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGTCGAGTGGCATCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGt > 6:288273/1‑149 (MQ=255) aGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCACTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGa > 5:110866/1‑133 (MQ=255) aGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCACTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGa < 6:110866/133‑1 (MQ=255) cACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTcc < 7:171336/149‑1 (MQ=255) cTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCa > 7:144086/1‑149 (MQ=255) tGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCag > 4:237445/1‑148 (MQ=255) tGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCAt > 1:278347/1‑149 (MQ=255) aGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATc < 6:256060/148‑1 (MQ=255) cccAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGGATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGt > 3:236767/1‑149 (MQ=255) ggCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGctc < 2:39041/149‑1 (MQ=255) ccTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCtctc < 6:224133/149‑1 (MQ=255) cTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGctct > 1:214464/1‑148 (MQ=255) cTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCa < 1:215521/149‑1 (MQ=255) cTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCa > 4:219807/1‑149 (MQ=255) tGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAAc > 5:91668/1‑149 (MQ=255) cAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAg < 4:295536/133‑1 (MQ=255) cAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAg > 3:295536/1‑133 (MQ=255) aCTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGc < 3:219807/149‑1 (MQ=255) aCTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGc < 8:165509/149‑1 (MQ=255) tCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCAt < 2:278347/149‑1 (MQ=255) atcTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCCCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCgtcag < 5:75553/61‑1 (MQ=25) atcTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCCCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCgtcag > 6:75553/3‑63 (MQ=25) cTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCAt > 3:115643/1‑147 (MQ=255) cTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATc < 6:12172/148‑1 (MQ=255) cTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCa < 1:225468/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCAAGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCAt > 7:203376/1‑147 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCATGCCCGCCCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCa < 7:95436/135‑1 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCATGCCCGCCCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCa > 8:95436/1‑135 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCATGCCCGCCCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCa > 8:90920/1‑135 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCATGCCCGCCCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCa < 7:90920/135‑1 (MQ=255) ggggCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTc > 6:17947/1‑148 (MQ=255) gggcgggcATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCAAGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTCaa < 8:203376/149‑1 (MQ=255) ggcgggcATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGtt > 8:11996/1‑109 (MQ=255) ggcgggcATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGtt < 7:11996/109‑1 (MQ=255) | TCATGGATGCGCAGAACATCTCCACCGATTACCTGATGTGGTACGTGATCATCCACATGACCTTCGTGGTCTCGGCGTTCTGCATGGGCTACCTGGACAAGCTGACCAAGCACTGAGTCCCCCCAGGCCTCACTGCAACTCCTGTGGGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑GATATCGAGGCTCAACTGACGAGTGGCGTCAGTCATGCCTTGCGCATTCTCCCTTCCTGTACAAAAAATGAGCTCTCATGCGTGGTTCCCATCGCGAGGTGCTCTCATGAACCTGCATCAGCTCAA > NC_002947/797361‑797656 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |