Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 854,035 | A→G | 6.3% | Q153R (CAG→CGG) | prmC → | release factor‑(glutamine‑N5) methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 854,035 | 0 | A | G | 6.3% | 234.6 / 3.0 | 79 | Q153R (CAG→CGG) | prmC | release factor‑(glutamine‑N5) methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/43); new base G (2/3); total (33/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCACCTGGTGGCCGGCGACGTGCGCTTCGAACC > NC_002947/853888‑854182 | tGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAg > 1:52863/1‑149 (MQ=255) cAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAg < 6:26487/147‑1 (MQ=255) aCCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGt < 7:282559/149‑1 (MQ=255) cccGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGtt > 7:258522/1‑149 (MQ=255) cccGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCCCAACCG‑CTGGCGGtt < 8:98922/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTgg < 8:258522/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTgg < 3:235982/149‑1 (MQ=255) cgcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCt < 5:246967/148‑1 (MQ=255) gcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CTGGCGGTTgcgctc < 4:232233/147‑3 (MQ=255) gcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CTGGCGGTTgcgctc < 4:228095/147‑3 (MQ=255) gcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CGGGCGGTTgcgctcgc > 3:228095/1‑145 (MQ=255) gcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTgg < 6:173759/149‑1 (MQ=255) gcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAAACG‑CTGGCGGTTgcgctgca > 3:232233/1‑145 (MQ=255) cccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGc < 1:128043/149‑1 (MQ=255) cccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGc < 1:132764/149‑1 (MQ=255) cgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGcc > 5:181405/1‑148 (MQ=255) ccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAAc > 6:266260/1‑149 (MQ=255) ccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAAc < 7:186729/149‑1 (MQ=255) cAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACg > 7:51187/1‑149 (MQ=255) ttCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCgg < 6:251062/149‑1 (MQ=255) ttCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCgg < 7:80233/149‑1 (MQ=255) gtctcGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCgg < 6:201325/148‑1 (MQ=255) aCCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACgg > 4:258001/1‑149 (MQ=255) ccTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGc < 2:52863/149‑1 (MQ=255) tACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGcc < 2:302748/149‑1 (MQ=255) ccGGTACGGGGGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCAc < 6:108705/149‑1 (MQ=255) cGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACt > 2:301708/1‑149 (MQ=255) cGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACt > 2:124781/1‑149 (MQ=255) gTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTgg < 4:148892/149‑1 (MQ=255) gTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGa > 6:286179/1‑148 (MQ=255) ccATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGc < 8:84423/149‑1 (MQ=255) ccATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGc > 2:86233/1‑149 (MQ=255) aTCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCAc < 4:13926/135‑1 (MQ=255) aTCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCAc > 3:13926/1‑135 (MQ=255) aTCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCt < 1:184178/149‑1 (MQ=255) aTCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCt > 1:106406/1‑149 (MQ=255) aTCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGCTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCt > 5:183887/1‑149 (MQ=255) tCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGcccg < 5:286179/149‑3 (MQ=255) ctctGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGcc < 6:181405/149‑1 (MQ=255) tctGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCcg > 2:114384/1‑149 (MQ=255) gcTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGc < 8:144784/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCcgcg < 5:153643/141‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCcgcg > 6:153643/1‑141 (MQ=255) gCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGttt < 2:106039/149‑1 (MQ=255) cAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGc > 7:59065/1‑135 (MQ=255) cAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGc < 8:59065/135‑1 (MQ=255) cAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCg < 1:86233/149‑1 (MQ=255) cgcCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCAt > 7:182491/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGt > 7:121673/1‑148 (MQ=255) aGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGACCAGCGGTTGGGCATGGCCAACGCACGGGTACGGGTGAGCCAATGGTAGGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAAccc > 1:238325/1‑149 (MQ=255) aGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCg > 6:109205/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCGGCAACCCGCCCTAc < 8:210654/149‑1 (MQ=255) aCCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCt < 6:183887/149‑1 (MQ=255) ccGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTg < 2:106406/149‑1 (MQ=255) cGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGa < 3:258001/149‑1 (MQ=255) gggTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGaa < 5:266260/149‑1 (MQ=255) gaggagGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGAccc > 5:233535/1‑149 (MQ=255) gaggagGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGAcc < 1:114384/148‑1 (MQ=255) ggaggCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGc < 8:182491/149‑1 (MQ=255) gaggCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCa > 8:148905/1‑149 (MQ=255) aggCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCAc < 6:233535/149‑1 (MQ=255) ggCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCAcc > 3:22575/1‑149 (MQ=255) gctgcCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCACCtggt > 1:197363/1‑149 (MQ=255) 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gcAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCACCTGGTGGCCGGCGACGTgcgc > 6:121253/1‑149 (MQ=255) gcAACCG‑CCAGCGGTTGGACCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCACCTGGTGGCCGGCGACGTgcgc > 2:58709/1‑149 (MQ=255) aaCCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCACCTGGTGGCCGGCGACGTGCGCtt < 4:154028/149‑1 (MQ=255) aCCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCACCTGGTGGCCGGCGACGTGCGCTTc < 8:121673/149‑1 (MQ=255) g‑CCAGCGGGTGGGCCTGTCCAACGCGCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCTCACCTGGTGGCCGGCGACGTGCGCTTCGaa < 1:301708/149‑1 (MQ=255) cAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCACCTGGTGGCCGGCGACGTGCGCTTCGAAcc < 2:238325/149‑1 (MQ=255) | TGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCG‑CCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACCTCATTGTCAGCAACCCGCCCTACATCGCCGCTGAAGACCCGCACCTGGTGGCCGGCGACGTGCGCTTCGAACC > NC_002947/853888‑854182 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |