| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,019,419 | T→C | 5.1% | M204V (ATG→GTG) | dppD ← | dipeptide ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,019,419 | 0 | T | C | 5.1% | 239.7 / 2.1 | 80 | M204V (ATG→GTG) | dppD | dipeptide ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/40); new base C (2/2); total (38/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
GGCTTCGCTGTAAGGGTGGGCGGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCCACACGTTGGCTCATGCCGCCT > NC_002947/1019276‑1019567 | ggCTTCGCTGTAAGGGTGGGCGGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTgc < 4:18617/149‑1 (MQ=255)ggCTACGCTCTAAGGGTGGGCGGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTgc > 2:100519/1‑149 (MQ=255) gCTGTAAGGGTGGGCGGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCt < 6:94269/149‑1 (MQ=255) cTGTAAGGGTGGGCGGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTTATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCtt < 6:304292/149‑1 (MQ=255) cTGTAAGGGTGGGCGGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCtt < 2:286203/149‑1 (MQ=255) aaGGGTGGGCTGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GTCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTg < 8:216442/148‑1 (MQ=255) gggTGGGCGGGGACATCGAACAGTTGTGGCACCTGGCCCACTTCGACTGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACAGCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGAGCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAg < 3:210454/149‑1 (MQ=255) gTGGGCGGGCCCATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACATCAACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCA‑GGCGGGTTCGGCGACCAC‑CGCGAGGGCGTGGGTGATCAGGATGAGAGCCAAGTTGAGCTCCGTCTGCAGGt > 6:295824/1‑149 (MQ=255) tGGGCGGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGtt < 7:102883/149‑1 (MQ=255) gggcACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCATGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑TGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGAc > 1:213257/1‑147 (MQ=255) gcACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACcag > 2:146/1‑148 (MQ=255) aTCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGtt < 1:146/149‑1 (MQ=255) aTCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGtt > 3:236535/1‑149 (MQ=255) cGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTc > 8:179184/1‑148 (MQ=255) aaCAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGTCCGGCGTACATCACGCACAGCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGAGCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCAt < 2:215848/149‑1 (MQ=255) aGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGAt < 5:178007/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCt < 5:312283/149‑1 (MQ=255) cTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCtgt > 5:15685/1‑149 (MQ=255) ccACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGt > 2:104948/1‑148 (MQ=255) ccACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGt > 2:163885/1‑148 (MQ=255) ccACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGt > 4:169352/1‑148 (MQ=255) cACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCAACATGGCGCTcatcc < 5:93940/106‑5 (MQ=255) cACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCAACATGGCGCTcatcc > 6:93940/1‑102 (MQ=255) aCTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCAc < 4:236535/149‑1 (MQ=255) cACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTc > 1:289193/1‑147 (MQ=255) aCGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCtt > 4:228332/1‑98 (MQ=255) aCGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCtt < 3:228332/98‑1 (MQ=255) aCGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCAACATGGCGCTcatc < 6:236190/98‑4 (MQ=255) aCGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCAACATGGCGCTcatc > 5:236190/1‑95 (MQ=255) cTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATc > 5:251594/1‑134 (MQ=255) cTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATc < 6:251594/134‑1 (MQ=255) cTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGcc > 7:87373/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCTGGGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGcc > 1:31638/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCACGGGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGcc > 1:230826/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCg > 7:174025/1‑149 (MQ=255) ggCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑TGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCg < 7:40038/147‑1 (MQ=255) ccGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGt > 5:82780/1‑149 (MQ=255) cGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGt < 8:87373/149‑1 (MQ=255) cGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGt < 7:179184/149‑1 (MQ=255) tACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTc < 7:153816/149‑1 (MQ=255) tACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTc < 1:163885/149‑1 (MQ=255) aTCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTc > 5:175968/1‑149 (MQ=255) tCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCt > 5:131106/1‑149 (MQ=255) cACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTg > 1:299243/1‑149 (MQ=255) gCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGa < 2:230826/149‑1 (MQ=255) acacCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATc < 2:299243/149‑1 (MQ=255) cacCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGAt > 8:28528/1‑147 (MQ=255) acCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATcag < 3:169352/149‑1 (MQ=255) acCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATcag < 8:174025/149‑1 (MQ=255) acCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATcag > 6:282404/1‑149 (MQ=255) ccGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATcag > 2:23574/1‑147 (MQ=255) gTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTc > 6:242975/1‑149 (MQ=255) tCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGc < 6:15685/148‑1 (MQ=255) ggCGACCAC‑GGCGAGGGCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGAACAGGTGTTCCATGATCTGTGCCTGTATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGATTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCg < 8:56419/148‑1 (MQ=255) aCCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTggg < 2:202426/137‑1 (MQ=255) aCCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTggg > 1:202426/1‑137 (MQ=255) aCCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAAt > 4:106769/1‑149 (MQ=255) ccAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATg < 1:23574/149‑1 (MQ=255) cAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATgg > 2:180233/1‑149 (MQ=255) aC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTTCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGc < 2:289193/149‑1 (MQ=255) cGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATg > 2:259414/1‑149 (MQ=255) gAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGTTCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATgg < 6:82780/149‑1 (MQ=255) gAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATgg < 5:282404/149‑1 (MQ=255) gAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATgg < 2:31638/149‑1 (MQ=255) aGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGc < 5:242975/149‑1 (MQ=255) tCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGAt < 5:295824/149‑1 (MQ=255) gTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCtt < 8:51595/120‑1 (MQ=255) gTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCtt > 7:51595/1‑120 (MQ=255) tGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGc < 8:41478/149‑1 (MQ=255) tGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGc < 1:100519/149‑1 (MQ=255) gTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCca > 8:254530/1‑148 (MQ=255) aTCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCCACACg > 2:252920/1‑149 (MQ=255) aGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCCACACGTTg < 1:180233/149‑1 (MQ=255) ggATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCCACACGTTgg < 6:175968/149‑1 (MQ=255) gATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATc > 1:187870/1‑136 (MQ=255) gATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATc > 1:192366/1‑136 (MQ=255) gATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATc < 2:187870/136‑1 (MQ=255) gATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATc < 2:192366/136‑1 (MQ=255) gATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCCACACGTTGGc > 1:28115/1‑149 (MQ=255) gcgcCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTTGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCCACACGTTGGCTCATg > 4:217264/1‑149 (MQ=255) tGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCCACACGTTGGCTCATGCCGCCt < 7:28528/149‑1 (MQ=255) | GGCTTCGCTGTAAGGGTGGGCGGGCACATCGAACAGTTCTGGCACCTGGCCCACTTCCACGGCTTGGCCGGCGTACATCACGCACACCCGCCT‑GGCGGTTTCGGCGACCAC‑GGCGAGGTCGTGGGTGATCAGGATGAGCGCCATGTTGCGCTCCTTCTGCAGGTTGACCAGCAGTTCCATGATCTGTGCCTGGATCGTCACGTCGAGGGCCGTGGTCGGTTCGTCTGCGATCAGCAGCTTGGGCTCGCCGGCAATGGCCATGGCGATCGCCACACGTTGGCTCATGCCGCCT > NC_002947/1019276‑1019567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |