Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,041,939 | A→C | 10.8% | E141A (GAG→GCG) | colR → | two‑component system response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,041,939 | 0 | A | C | 10.8% | 182.2 / 12.8 | 65 | E141A (GAG→GCG) | colR | two‑component system response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/32); new base C (3/4); total (29/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.34e-01 |
TCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAGCCTG > NC_002947/1041792‑1042087 | tCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGGGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAg > 1:98267/1‑149 (MQ=255) cTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTa > 7:69582/1‑149 (MQ=255) gggggCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCA‑GGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTaac < 1:199476/147‑3 (MQ=255) gCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCa < 7:208129/149‑1 (MQ=255) tGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTAACCTCCAgg < 7:182809/149‑1 (MQ=255) tGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAgg > 3:21790/1‑149 (MQ=255) acgacTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAggg < 5:271495/148‑1 (MQ=255) acgacTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAgg < 7:245421/147‑1 (MQ=255) gacTATCTGCTCCAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCg < 7:136895/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTAACCTCCAGGGtatcga < 3:210404/147‑6 (MQ=255) ccTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTg < 7:168350/148‑1 (MQ=255) cTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTg > 2:288249/1‑147 (MQ=255) aaGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGCCTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAg < 1:91252/148‑1 (MQ=255) aaGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGc > 6:61797/1‑148 (MQ=255) aaGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCt > 6:197500/1‑149 (MQ=255) aGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCt > 1:68540/1‑139 (MQ=255) aGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCt < 2:68540/139‑1 (MQ=255) gCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCa < 2:98267/149‑1 (MQ=255) cATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAAc < 4:72379/149‑1 (MQ=255) gCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGt > 8:190362/1‑149 (MQ=255) ccTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCg > 2:131551/1‑149 (MQ=255) tCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGc < 4:69027/147‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAgctg > 3:110592/1‑149 (MQ=255) ggcggcGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAgctgc > 2:277747/1‑149 (MQ=255) gcggcgCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAgctgct > 1:143330/1‑149 (MQ=255) ggcgCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTgg < 1:131551/149‑1 (MQ=255) gcgcATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGtatcga > 2:109345/1‑106 (MQ=255) gcgcATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGtatcga < 1:109345/111‑6 (MQ=255) cgcATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGt < 4:21790/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACt > 8:158705/1‑149 (MQ=255) cGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAC‑GAGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTg > 4:4239/1‑148 (MQ=255) gAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGa < 7:190362/148‑1 (MQ=255) aaGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTgg > 6:303561/1‑138 (MQ=255) aaGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTgg < 5:303561/138‑1 (MQ=255) ctgcGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGaaaa < 1:288249/148‑1 (MQ=255) ctgcGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGaaaa < 5:61797/148‑1 (MQ=255) ccGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGGAAAGCCCGc < 5:207707/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACt < 5:216624/149‑1 (MQ=255) gTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGcgccgc > 2:50486/1‑149 (MQ=255) tGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGaa < 2:19186/126‑1 (MQ=255) tGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGaa > 1:19186/1‑126 (MQ=255) gggCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGa < 5:197500/149‑1 (MQ=255) ggcggcGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTTCTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAg < 1:50486/149‑1 (MQ=255) gcACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTg < 7:158705/149‑1 (MQ=255) cAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACt < 7:121491/125‑1 (MQ=255) cAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACt > 8:121491/1‑125 (MQ=255) cAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCTAGGTGCTGGaagaag < 8:69582/148‑1 (MQ=255) cAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGgaagaa < 1:277747/147‑1 (MQ=255) cTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTgg > 2:133651/1‑149 (MQ=255) gACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTgggg < 3:4239/149‑1 (MQ=255) aGCTACGTCCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGcgac < 2:143330/147‑1 (MQ=255) aGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGaaaa > 5:24894/1‑97 (MQ=255) aGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGaaaa < 6:24894/97‑1 (MQ=255) cTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTtgtg > 4:193070/1‑138 (MQ=255) cTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTtgtg < 3:193070/138‑1 (MQ=255) tACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTg > 3:285671/1‑149 (MQ=255) tCGATACACTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACACGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGa > 1:101590/1‑148 (MQ=255) cGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGa > 2:303642/1‑147 (MQ=255) gATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATa < 4:110592/148‑1 (MQ=255) cccTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGAc < 1:133651/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGGGTAACCTCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCCACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCTGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGAGACGACTGCCCTGATAGCGa > 2:104336/1‑147 (MQ=255) ccTGGCGGGTAACCTCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGc > 5:133633/1‑145 (MQ=255) ccTGGCGGGTAACCTCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGc < 6:133633/145‑1 (MQ=255) ccTGGCGGGTAACCTCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGa > 4:209929/1‑147 (MQ=255) cTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAg > 2:283179/1‑149 (MQ=255) aGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAGCCTg < 4:285671/149‑1 (MQ=255) | TCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAG‑GTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAGCCTG > NC_002947/1041792‑1042087 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |