Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,120,934 | T→C | 5.4% | V125V (GTT→GTC) | PP_0982 → | YjgP/YjgQ family permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,120,934 | 0 | T | C | 5.4% | 221.8 / 2.2 | 75 | V125V (GTT→GTC) | PP_0982 | YjgP/YjgQ family permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/39); new base C (2/2); total (34/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.73e-01 |
CGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCGGGG > NC_002947/1120787‑1121079 | cGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTg < 5:147385/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGcc > 4:77297/1‑148 (MQ=255) cgcCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGcc > 5:125089/1‑147 (MQ=255) gcCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAg < 3:77297/149‑1 (MQ=255) ccTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCA‑ACGCCCAgg < 2:144126/149‑1 (MQ=255) tGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTg > 4:37288/1‑149 (MQ=255) gTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTg > 5:3088/1‑148 (MQ=255) gTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTg > 2:223001/1‑148 (MQ=255) tACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCA‑ACGCCCAggggg < 6:272280/148‑4 (MQ=255) ccTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTgcag > 8:162995/1‑148 (MQ=255) gAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTgcag > 4:220967/1‑144 (MQ=255) gaTGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATcagcc < 6:221459/149‑1 (MQ=255) gaTGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATcagc > 1:282118/1‑148 (MQ=255) aCCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCcagca < 1:172416/149‑1 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGcc < 2:282118/147‑1 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGcc < 6:125089/147‑1 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGcc < 3:220967/147‑1 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCt > 6:201138/1‑149 (MQ=255) ggCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGa < 8:119528/149‑1 (MQ=255) gCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAc > 3:281302/1‑149 (MQ=255) ccACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGCTCCATGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAc < 1:102375/149‑1 (MQ=255) cACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTACTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAcc > 5:116531/1‑148 (MQ=255) aCTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAcc > 5:234363/1‑147 (MQ=255) tGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCCCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGATGAGCCAGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCAACAGCCAGAAGGATGCCCTGACCGAGt > 3:296018/1‑149 (MQ=255) aTGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGa > 3:235927/1‑149 (MQ=255) tGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGac > 3:149900/1‑149 (MQ=255) ttccAGCATCGGCTTCTGGGGATGACCATG‑GCGGCGGCTGCCCTGGGTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGTGCCTGAGCCTGGCCCCCCTTGGCGTTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGac < 1:76370/146‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGCCTGCTGTGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGGTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt < 5:97452/149‑1 (MQ=255) ctgcagcGTCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGTCTGGCTGAGCCTGAGCCTTGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCtt < 7:255888/147‑1 (MQ=255) cagcagCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCtt < 6:148027/149‑1 (MQ=255) agcagcGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTg > 4:181447/1‑149 (MQ=255) gcagcGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTACTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTgg < 6:116531/149‑1 (MQ=255) gcCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCg < 1:291986/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACAcc < 2:181460/139‑1 (MQ=255) ccTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACAcc > 1:181460/1‑139 (MQ=255) tgctgGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCATGGCCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGAAAAAAGGCCCCCAGGATGCCCTGACGGATTTCCACACCTTGGTGCCGGGc > 5:162101/1‑149 (MQ=255) ctgGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGc < 6:234363/147‑1 (MQ=255) ctgGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGc < 6:267830/147‑1 (MQ=255) ggCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGc < 3:181447/147‑1 (MQ=255) gCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGATTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTc < 4:248433/149‑1 (MQ=255) gACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCtt < 7:260265/129‑1 (MQ=255) gACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCtt > 8:260265/1‑129 (MQ=255) aCCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCa > 6:300328/1‑146 (MQ=255) aCCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCa < 5:300328/146‑1 (MQ=255) aCCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGAc > 3:158497/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGc < 7:236057/148‑1 (MQ=255) cgcCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGTATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGAGCTTGCGt < 8:216135/149‑1 (MQ=255) cgcCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGt > 5:278671/1‑149 (MQ=255) gcCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGt > 6:66404/1‑148 (MQ=255) ccGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTTACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGa < 1:223001/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGa < 4:235927/149‑1 (MQ=255) cGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGAt < 3:37288/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATg < 4:209570/149‑1 (MQ=255) tGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCgg > 1:89423/1‑149 (MQ=255) gTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGc < 4:42333/117‑1 (MQ=255) cccTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAAcc > 1:178446/1‑149 (MQ=255) cccTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAAc < 4:281302/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGa < 3:37819/132‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGa > 4:37819/1‑132 (MQ=255) ccTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAAcc > 1:228890/1‑148 (MQ=255) gtggCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCg < 6:3088/148‑1 (MQ=255) tggCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAg < 5:66404/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGc < 2:228890/148‑1 (MQ=255) tgggtcagccagGCCCTCCTGTTCG‑TTGCCCAGGTGCTGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCGCTGACCGAGTTCGAGACGTTGGTGCCGGGGCTGTTGCAGTCCTTGCGTGATGGATCGCGGGTAACCTATACGGAGGATCTGtg < 4:92548/140‑2 (MQ=255) gcctgagcctgGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGAt < 7:162995/149‑1 (MQ=255) gcctgagcctgGCCCCCCTGGGCG‑TAGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCAATACCGCGCAACTTTCGGAt > 6:12802/1‑149 (MQ=255) agcctgGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGAcc < 2:89423/148‑1 (MQ=255) ctgcaccTGGGCA‑ACGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACATTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCaa > 8:249239/6‑149 (MQ=255) ccccccTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAAc > 4:67932/1‑149 (MQ=255) cccccTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAAcc > 3:138282/1‑149 (MQ=255) ccccTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAACAACTGTCGGATGACCGCATCAACCt < 6:278671/149‑1 (MQ=255) cccTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGa < 7:249619/87‑1 (MQ=255) cccTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGa > 8:249619/1‑87 (MQ=255) ccTGGGCA‑ACGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTgg > 6:285823/1‑149 (MQ=255) cG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGAAGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCgggg > 1:205546/1‑149 (MQ=255) | CGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATG‑GCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCTGGGCG‑TTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCGGGG > NC_002947/1120787‑1121079 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |