Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,366,554 | C→A | 5.9% | R49L (CGC→CTC) | PP_1191 ← | S4 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,366,554 | 0 | C | A | 5.9% | 217.9 / 2.6 | 67 | R49L (CGC→CTC) | PP_1191 | S4 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/34); new base A (2/2); total (31/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 |
GGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTCGGACA > NC_002947/1366406‑1366698 | ggCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGAcgc > 4:178660/1‑149 (MQ=255) gcACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCgctgc < 5:111883/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCGCGTCGAgctgctgcc < 4:27452/149‑2 (MQ=255) cTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCGCGTCGAgctgctgccgg < 2:46354/149‑4 (MQ=255) ggTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCgctg > 8:20817/1‑136 (MQ=255) ggTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCgctg < 7:20817/136‑1 (MQ=255) ggTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTg < 3:22077/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCg < 2:51227/149‑1 (MQ=255) gCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCgg < 7:39943/147‑1 (MQ=255) cTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGgctg > 3:220150/1‑149 (MQ=255) gCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGa > 5:249598/1‑149 (MQ=255) cATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGAccacca > 2:7438/1‑149 (MQ=255) aTGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAAc > 6:271706/1‑122 (MQ=255) aTGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAAc < 5:271706/122‑1 (MQ=255) tCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGcc > 4:197786/1‑148 (MQ=255) tCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCa > 2:64527/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATc < 1:7438/149‑1 (MQ=255) gcgGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTa > 8:236896/1‑149 (MQ=255) cTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCtt > 7:41811/1‑148 (MQ=255) cTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCtt > 8:85272/1‑148 (MQ=255) tCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCaa < 4:220150/148‑1 (MQ=255) tCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAAt > 5:245219/1‑149 (MQ=255) tCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAAt < 7:85272/149‑1 (MQ=255) cATGCCGGCTGGCTGGTGCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATg < 5:180115/148‑1 (MQ=255) ctGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCTGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGGTCGACTCGCTGCTGCTCAACCTTCAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATGGAGCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTa < 6:142919/148‑1 (MQ=255) atcccGGCTGGCAGGTTCAGAAGCAGGGTCACCGGCACCACGGTTTCGGCAC‑AGGCGCCCGGAAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGATACCCAGACTCCTTCAATGt > 5:142919/4‑148 (MQ=255) aTGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTa < 8:35697/149‑1 (MQ=255) aTGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTa < 6:3217/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCACTGGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTa > 1:230933/1‑149 (MQ=255) ctggctggTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCg < 5:10471/149‑1 (MQ=255) ctggctggTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCg < 3:197786/149‑1 (MQ=255) tggTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTc > 4:25956/1‑149 (MQ=255) tggTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTc > 7:231027/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTcgc > 2:230277/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCgcgg > 4:148913/1‑149 (MQ=255) gcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGTCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGcggcgg < 1:230277/149‑1 (MQ=255) gcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGcggcgg > 8:181222/1‑149 (MQ=255) gcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGcggcgg < 6:132940/149‑1 (MQ=255) gcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGcggcgg < 6:264895/149‑1 (MQ=255) gcagcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGcggcgg > 5:132940/1‑149 (MQ=255) agcagGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGa < 2:230933/149‑1 (MQ=255) agGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGagca > 3:99/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTc > 3:72279/1‑149 (MQ=255) cAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGa < 3:178660/149‑1 (MQ=255) ggTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGAt > 7:149993/1‑147 (MQ=255) gTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAg > 7:219262/1‑149 (MQ=255) tttCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAgg > 4:150105/1‑149 (MQ=255) tCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAg > 6:265032/1‑134 (MQ=255) tCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAg < 5:265032/134‑1 (MQ=255) tCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGc < 2:145225/148‑1 (MQ=255) ggCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGtt < 3:25956/149‑1 (MQ=255) ggCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGtt < 6:245219/149‑1 (MQ=255) ggCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGt < 8:231027/148‑1 (MQ=255) gCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGagc < 6:102053/124‑1 (MQ=255) gCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGttt < 1:64527/149‑1 (MQ=255) gCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACCGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGttt > 2:91069/1‑149 (MQ=255) gCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACCGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGttt < 1:91069/149‑1 (MQ=255) aC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTgg < 8:219262/149‑1 (MQ=255) ggCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGttt > 8:54412/1‑144 (MQ=255) ggCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGttt < 7:54412/144‑1 (MQ=255) cagcagCGCGTCGAGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACgg > 2:162830/1‑149 (MQ=255) gcagcTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGt < 3:148913/149‑1 (MQ=255) gcagcTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGt < 8:149993/149‑1 (MQ=255) gcagcGCGTCGAGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGTCGGGt > 6:236861/1‑149 (MQ=255) agcTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTc < 8:41811/149‑1 (MQ=255) tCGACGCGCTGCTGCTCAACCAACAACTGCGGCTGCACGACCACCACGCCATCGACCGTTACACAGCCTCCTACAATGTACTGCTCGCCCTCGCGGCGGGAGCACCCGACCAGCTCGAACAGGAGTTAGGAAAGGCGGACGGGTTCGGa > 2:96672/1‑149 (MQ=255) gACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTCGGACa < 7:236896/149‑1 (MQ=255) gACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTCGGACa > 7:21165/1‑149 (MQ=255) | GGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTTCAGCAGCAGGGTCACCGGCTCCAGGGTTTCGGCAC‑GGGCGCCCGGCAGCAGCTCGACGCGCTGCTGCTCAACCTTGAACTGCGGCTGCTCGACCACCACGCCATCGACCGTTACCCAGCCTCCTTCAATGTACTGCTCGGCCTCGCGGCGGGAGCAGCCGAGCTGCTCGATGAGGCGTTTGGACAGGCGGACGGGTTCGGACA > NC_002947/1366406‑1366698 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |