| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,376,322 | G→C | 11.9% | intergenic (+31/+18) | kup → / ← PP_1201 | potassium transport system protein Kup/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,376,322 | 0 | G | C | 11.9% | 200.3 / 18.7 | 76 | intergenic (+31/+18) | kup/PP_1201 | potassium transport system protein Kup/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/33); new base C (5/4); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.93e-01 | |||||||||||
CTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTGCCG > NC_002947/1376180‑1376470 | cTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGc < 4:53515/149‑1 (MQ=255)cTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGc < 2:279757/149‑1 (MQ=255) gCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCt < 2:56982/149‑1 (MQ=255) ggggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGGACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGa < 8:208236/149‑1 (MQ=255) ggggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGa < 5:171329/149‑1 (MQ=255) ggggCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTAGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGa < 8:77186/149‑1 (MQ=255) aaCCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCtt > 3:283633/1‑149 (MQ=255) gcgTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTCAGCCTAGTCACTTCt > 8:172370/1‑149 (MQ=255) cgTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGcc > 7:50102/1‑130 (MQ=255) cgTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGcc < 8:50102/130‑1 (MQ=255) tCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGAGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCt > 4:297194/1‑148 (MQ=255) tGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGa > 4:34942/1‑125 (MQ=255) tGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGa < 3:34942/125‑1 (MQ=255) gaagaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGGCAGTTCTGCTCAGCTACg > 6:240091/1‑149 (MQ=255) aataaTGCCAACGGCAACTTGCTCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTAAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACg < 8:132168/145‑1 (MQ=255) aagaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGc > 8:238137/1‑149 (MQ=255) aagaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGc > 3:65469/1‑149 (MQ=255) gaaTGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTg < 5:194950/149‑1 (MQ=255) tGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGAc < 4:243536/149‑1 (MQ=255) ccAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACtt > 1:124294/1‑149 (MQ=255) ccAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACtt < 4:283633/149‑1 (MQ=255) cAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTg > 5:275672/1‑149 (MQ=255) cAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCACGGCCCCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTAAGCTGGACTTg > 4:175728/1‑149 (MQ=255) aaCGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGc > 4:210030/1‑149 (MQ=255) aaCCGCAACTTGCGCGTCTTCAACCGGCCGTAGAACCGGGGGACCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGACTGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGc < 8:279920/149‑1 (MQ=255) cAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAg < 3:56637/129‑1 (MQ=255) cAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAg > 4:56637/1‑129 (MQ=255) ttGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGcgcg > 6:240442/1‑149 (MQ=255) gcgcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGAGGCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGATCAGGGCCGCAGAGCGGCCGTGAGCCTTGTCAGTTGTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGt > 1:217982/1‑149 (MQ=255) cgcTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGttt < 2:217982/149‑1 (MQ=255) ttcttcAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGa < 6:275672/149‑1 (MQ=255) aaCCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCATTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGc > 5:271728/1‑149 (MQ=255) aaCCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCg < 7:172370/148‑1 (MQ=255) aaCCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGc < 3:210030/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑GCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGTGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTTCCTTGGCGCGTTTCTATCTCGcc < 1:140697/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCg < 3:200583/141‑1 (MQ=255) aCCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCg > 4:200583/1‑141 (MQ=255) cGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTGAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCaa > 5:232986/1‑149 (MQ=255) gTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAAc < 4:65469/149‑1 (MQ=255) ttGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAAcc > 7:17979/1‑149 (MQ=255) ttGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTAAGTTCTGCTCAGCAACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAAcc > 8:118966/1‑149 (MQ=255) aaCCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCAGAGCCTTGTCAGTTATGCTCAGCTACGCTGGACTTGACTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAAACGCt > 3:47906/1‑149 (MQ=255) aCCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCtt < 8:17979/149‑1 (MQ=255) aCCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCtt > 1:41750/1‑149 (MQ=255) cGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGc > 2:206914/1‑134 (MQ=255) cGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGc < 1:206914/134‑1 (MQ=255) ggTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGc > 6:118093/1‑148 (MQ=255) gTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGa < 8:106453/149‑1 (MQ=255) gAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCg < 8:200753/149‑1 (MQ=255) gA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCACACGGCCGCAGAGCGGCCCAGAGCCGTGTGAGTTGTGCTAAGCAAAGCTGGAAATGGCATGGCGGGTTTAGATCTAGCCAATAAAACGCATGGGGAGTGGCGGGTAGtta > 4:153914/1‑148 (MQ=255) a‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTACCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTtct > 3:232569/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCGAGATCTGAATGGGGTGATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTtctc < 7:111548/149‑1 (MQ=255) aGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGt < 5:184151/139‑1 (MQ=255) aGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGt > 6:184151/1‑139 (MQ=255) aGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCtcgtc < 5:240091/149‑1 (MQ=255) tCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGAAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGa < 6:69495/53‑1 (MQ=18) tCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGAAGGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGa > 5:69495/1‑53 (MQ=18) agaTCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGAGTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAgtg < 7:262355/149‑1 (MQ=255) gaTCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCCATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAgtgg > 1:157803/1‑149 (MQ=255) aaTGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGc < 7:238137/146‑1 (MQ=255) gggTTATACAGCAGGCTCAGAGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCa < 3:297194/148‑1 (MQ=255) ggTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCAGCCAgg > 8:154015/1‑149 (MQ=255) ggTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGGTTCGATCTCGCCCATCAACCGCGTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCACGCCAgg > 4:25060/1‑149 (MQ=255) ttATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCa < 2:124294/149‑1 (MQ=255) aCAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCGGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGttt > 7:160502/1‑149 (MQ=255) gacaagGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGttt > 5:143816/5‑148 (MQ=255) agcagGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGt > 6:97820/1‑106 (MQ=255) agcagGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGt < 5:97820/106‑1 (MQ=255) cagGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTa < 6:227987/112‑1 (MQ=255) aagGCTCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAgg > 2:273400/2‑149 (MQ=255) tCAGGGCCGCTCTGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCGTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCt > 4:285317/1‑148 (MQ=255) tCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAggtggtg > 1:109752/1‑144 (MQ=255) tCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCt > 7:283291/1‑148 (MQ=255) tCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTc > 3:7382/1‑149 (MQ=255) gtcGCAGAGAGGGCCTGTTCCTTGTCAGTTCTGCTCTGCTTGGGTGGAGTTGCGTTGGCGGGTTTCGATCTCGGGAAGCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCtc < 3:175728/147‑2 (MQ=255) cAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTGc < 3:153914/149‑1 (MQ=255) gagCGGGCCGGAGCCTTGTCAGTTCGGCTCAGCTACGCGGGACTTGCCTTGGCGCGTGTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTGCCg < 6:18309/149‑1 (MQ=255) | CTGGCGGGGCAACCTGTTCGCGTTCTTGCTGAAGAATGCCAACGGCAACTTGCGCTTCTTCAACCTGCCGTTGAACCGGGTGATCGAGCTAGGGA‑CCCAGGTCGAGATCTGAATGGGGTTATACAGCAGGCTCAGGGCCGCAGAGCGGCCCTGAGCCTTGTCAGTTCTGCTCAGCTACGCTGGACTTGCCTTGGCGCGTTTCGATCTCGCCAATCAACCGCTTGGCGAGTGCCGGGTAGTTCTCGTCGAAGTGGTGCCCGCCAGGCAGTTTCAGGCGCTCACCTACTGCCG > NC_002947/1376180‑1376470 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |