Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,491,331 | A→G | 6.8% | T332A (ACC→GCC) | cysNC → | sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylyl‑sulfate kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,491,331 | 0 | A | G | 6.8% | 171.0 / 2.5 | 59 | T332A (ACC→GCC) | cysNC | sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylyl‑sulfate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/26); new base G (2/2); total (31/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 |
AGAGCAGCCGGGTCAAGTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGAACACCCTGGAGCAGG > NC_002947/1491185‑1491478 | agagCAGCCGGGTCAAGTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCATGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCAcc < 6:46259/149‑1 (MQ=255) gagCAGCCGGGTCAAGTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCg > 8:83354/1‑149 (MQ=255) agcagcCGGGTCAAGTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGa > 1:287850/1‑149 (MQ=255) gcagcCGGGTCAAGTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGa < 3:133163/148‑1 (MQ=255) gcCGGGTCAAGTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAg < 2:287850/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCAAGTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGt > 1:1564/1‑149 (MQ=255) gTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCa > 7:9028/1‑149 (MQ=255) cATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGc > 6:247358/1‑149 (MQ=255) tCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTg < 8:9028/149‑1 (MQ=255) tCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGgtg > 4:25456/1‑149 (MQ=255) tACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTTGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCa < 8:131412/136‑1 (MQ=255) tACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCa > 7:131412/1‑136 (MQ=255) gAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGc < 7:83354/149‑1 (MQ=255) ggTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCga < 5:247358/149‑1 (MQ=255) tcgAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTCGTACATCCCGACAACGTCCCGCCCGTCACCGACCAGTTc > 8:92456/3‑116 (MQ=255) tGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTc < 7:92456/116‑1 (MQ=255) gAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGAt > 1:50303/1‑149 (MQ=255) gccaggccGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCGCCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGaaa > 3:89011/1‑149 (MQ=255) ggccGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACg < 7:76921/149‑1 (MQ=255) gccGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCGCCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGa > 3:59153/1‑149 (MQ=255) gccGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACg > 7:201725/1‑148 (MQ=255) cGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACa > 8:93255/1‑149 (MQ=255) tGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACAt > 5:115799/1‑148 (MQ=255) tGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCACCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATc < 8:14960/149‑1 (MQ=255) cccTGACCATTGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCaa < 7:99207/148‑1 (MQ=255) aCCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGa < 3:48834/137‑1 (MQ=255) aCCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGa > 4:48834/1‑137 (MQ=255) cATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGcca > 1:305647/1‑149 (MQ=255) gACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCGCCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTa < 4:59153/149‑1 (MQ=255) gaTCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTCC‑GTGc > 5:76088/1‑149 (MQ=255) tCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCa < 8:201725/149‑1 (MQ=255) tCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCa < 2:305647/149‑1 (MQ=255) gACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCGCCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAg < 4:89011/148‑1 (MQ=255) tcCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGAt > 6:141890/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGAt < 2:50303/147‑1 (MQ=255) ggCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAg > 2:170608/1‑149 (MQ=255) gCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGc < 2:1564/149‑1 (MQ=255) cGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAg < 1:280165/112‑1 (MQ=255) cGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAg > 2:280165/1‑112 (MQ=255) gACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCAt > 1:107611/1‑149 (MQ=255) gctgGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCAcc > 1:126532/1‑148 (MQ=255) gctgGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCAcc > 1:131187/1‑148 (MQ=255) ctgGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCAccc < 7:93255/148‑1 (MQ=255) ctgGTAAATGCCGTCAACGTCCCGCCGGTCACCTAACAGTTCGTCGCCATGGTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAATAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTACGGTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCAccc < 1:170608/149‑1 (MQ=255) gTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCcac > 4:123767/1‑147 (MQ=255) gTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACaa < 8:35563/149‑1 (MQ=255) ccGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGAt < 5:141890/149‑1 (MQ=255) ccGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGAt < 2:107611/149‑1 (MQ=255) cAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGa < 3:268313/149‑1 (MQ=255) gTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAg < 3:145146/122‑1 (MQ=255) gTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAg > 4:145146/1‑122 (MQ=255) cccGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATCTGAACAccc > 5:169051/1‑149 (MQ=255) cgccgGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACGAGGTCGATGTGAACACCCTg > 7:287070/1‑149 (MQ=255) ccgGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGAACACCCTg > 8:256165/1‑147 (MQ=255) cgGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGAACACCCTGGAg < 3:25456/149‑1 (MQ=255) gTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGAaca < 5:193668/139‑1 (MQ=255) gTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGAaca > 6:193668/1‑139 (MQ=255) cACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGAACACCCTGGAGCAgg > 4:119987/1‑149 (MQ=255) cACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGAACACCCTGGAGCAgg > 4:17929/1‑149 (MQ=255) | AGAGCAGCCGGGTCAAGTCCATCGTCACCTACGAAGGTGAACTGGAAAACGCTGGCCCAGGCCAGGCCGTGACCCTGACCATGGAAGACGAGATCGACATCTCCCGTGGCGACCTGCTGGTACATGCCGACAACGTCCCGCCGGTCACCGACCAGTTCGACGCCATGCTGGTGTGGATGGCCGAGGAGCCGATGCTCCCGGGCAAGAAATACGACATCAAGCGTGCCACCAGCTAC‑GTGCCAGGTTCGATTGCCAGCATCACCCACAAGGTCGATGTGAACACCCTGGAGCAGG > NC_002947/1491185‑1491478 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |