| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,582,773 | C→A | 7.8% | intergenic (‑219/‑39) | ttgA ← / → ttgR | efflux pump periplasmic linker TtgA/HTH‑type transcriptional regulator TtgR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,582,773 | 0 | C | A | 7.8% | 185.1 / 5.8 | 64 | intergenic (‑219/‑39) | ttgA/ttgR | efflux pump periplasmic linker TtgA/HTH‑type transcriptional regulator TtgR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/27); new base A (2/3); total (33/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.53e-01 | |||||||||||
TATCCGGTGGATAAATAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAACCACCCTGGCCGACA > NC_002947/1582627‑1582920 | tATCCGGTGGATAAATAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCAc > 2:67986/1‑149 (MQ=255)tATCCGGTGGATAAATAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCAGAGAGGCCCAGGAAGAGTTGACACCGGAGCGTTCACCGAAc > 5:14571/1‑149 (MQ=255) tCCGGTGGATAAATAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCAcgc > 1:10756/1‑149 (MQ=255) tGGATAAATAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTgc < 6:97646/149‑1 (MQ=255) tGGATAAATAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTgc < 3:292732/149‑1 (MQ=255) ggATAAATAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTgcg > 4:256316/1‑149 (MQ=255) tAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGAACGCGCAGCGCGTGCgg < 1:147673/149‑1 (MQ=255) tAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGAACGCGCAGCGCGTGCgg < 6:201866/149‑1 (MQ=255) aGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGAACGCGCAGCGCGTGCggg < 3:181213/149‑1 (MQ=255) ttGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTAAAGCATCAGCGCTTTATTAGATTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGAACCCGGAGCGTTCCACGCACGCGATGCGCGTTCGGGc > 3:199910/1‑147 (MQ=255) gCTAAGTAATATACTTACATTCCTGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGGGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGTAGCATTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCa < 5:185690/147‑1 (MQ=255) tAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGAACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTAACCGAGAGGCCCCGCCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCTCTGCGCGATCGGGCCAGAt > 3:245231/1‑148 (MQ=255) aGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑g < 2:10756/147‑1 (MQ=255) aGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAg < 3:256316/149‑1 (MQ=255) gAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGt > 3:130505/1‑149 (MQ=255) aaTATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGtt < 3:75673/149‑1 (MQ=255) ataCTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTa > 3:254444/1‑149 (MQ=255) ttACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTa > 4:93929/1‑145 (MQ=255) ttACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTa < 3:93929/145‑1 (MQ=255) aCATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGcc < 6:130055/148‑1 (MQ=255) cATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCa < 6:219484/148‑1 (MQ=255) aTTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATg > 7:235404/1‑149 (MQ=255) cATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGt < 4:254444/148‑1 (MQ=255) tGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCg > 6:89157/1‑149 (MQ=255) gttgttTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGt < 1:67986/148‑1 (MQ=255) gtAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCa > 3:290658/1‑148 (MQ=255) aaaTACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCaaa < 2:130390/148‑1 (MQ=255) tgctgGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAaagaagaag > 2:60025/1‑149 (MQ=255) ctgGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGcc > 1:260815/1‑149 (MQ=255) ctgGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGcc > 2:329/1‑149 (MQ=255) tgGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGGGTTCGGGCCTGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGACGcc > 2:238913/1‑148 (MQ=255) tgGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGcc > 2:242699/1‑148 (MQ=255) tgGGTGGTACTCAGGGACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGccc < 8:235404/149‑1 (MQ=255) gggTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGcc > 3:154941/1‑147 (MQ=255) ggtggtACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAg > 4:71852/1‑149 (MQ=255) cTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTGGTACTGCCATGGTCCGTCGCACGAAAGAAGAAGCCCAGGAAcccg > 6:214021/1‑148 (MQ=255) tCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAaagaagaa < 5:243862/135‑1 (MQ=255) tCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAaagaagaa > 6:243862/1‑135 (MQ=255) aGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTg < 1:60025/149‑1 (MQ=255) gTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGc < 7:201116/69‑1 (MQ=255) gTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGc > 8:201116/1‑69 (MQ=255) gTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGcc > 3:181555/1‑149 (MQ=255) caaccTCATCGCTTGTTTATCTTATCCGAGATGCCCCGGCACAGGTGGCCCCGGAGCGTTTCCCGCACGCGCGGCGCGTTCGGGGCATTTCTAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCa < 1:242699/146‑1 (MQ=255) cAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAg < 2:260815/149‑1 (MQ=255) aatccTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGTCGTTCCCCCCGAGCGTTACCCCCACGCGCTGCGGGTTCGGGCCATATAGAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCa < 1:238913/146‑1 (MQ=255) gcgcTTGATTAGCTTATCCTAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTAGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGa < 6:14571/149‑1 (MQ=255) ttGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGat < 6:246618/139‑1 (MQ=255) ttGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGat > 5:246618/1‑139 (MQ=255) gATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAggcgg < 5:89157/148‑1 (MQ=255) gCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGa > 1:29889/1‑147 (MQ=255) ttATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCGCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGGTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAGGCCGAGGAATCCCGTGGCCAGCGCATCGCGGCGGCGGactgg > 4:255742/1‑145 (MQ=255) tATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAggg > 7:59134/1‑149 (MQ=255) agGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTAc < 8:59134/149‑1 (MQ=255) agGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTAc < 4:130505/149‑1 (MQ=255) ccccGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAg < 4:154941/149‑1 (MQ=255) cGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCATTGCCCAGAGCATCGAGGCCGCGCAAAGGGCCTGCGACAAgcgc > 1:171460/1‑149 (MQ=255) gCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCGGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCgg < 3:270790/149‑1 (MQ=255) cccGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGaa > 2:99065/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAaccac > 8:22694/1‑149 (MQ=255) gCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAACCAccc < 1:329/149‑1 (MQ=255) atctggcccGAACGCGCAGCGCGTGCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAaccacc > 2:273446/7‑148 (MQ=255) cGTTCCGCGGACGCGGTGCGCGTTCGGGCCAGAG‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAATGGACTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAACCACCCt < 2:171460/149‑1 (MQ=255) ccccGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAACCACCCTGGc < 2:29889/148‑1 (MQ=255) ccGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAACCACCCTGGCCGa > 8:113012/1‑149 (MQ=255) ccGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAACAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGAACATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCCGGGTTGCGCGAACCACCCTGGCCGa > 1:303410/1‑149 (MQ=255) gCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAACCACCCTGGCCGACa > 7:286297/1‑149 (MQ=255) | TATCCGGTGGATAAATAGCTTGCTAAGGAATATACTTACATTCATGGTTGTTTGTAAATACTGCTGGGTGGTACTCAGGTACAGCCTCAGCGCTTGATTAGCTTATCCGAGAGGCCCCGGCAGAGGTGCCCCCGGAGCGTTCCCCGCACGCGCTGCGCGTTCGGGCCAGAT‑GAGGTTGTACTGCCATGGTCCGTCGAACCAAAGAAGAAGCCCAGGAAACCCGTGCCCAGATCATCGAGGCGGCGGAAAGGGCCTTCTACAAGCGCGGGGTTGCGCGAACCACCCTGGCCGACA > NC_002947/1582627‑1582920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |