Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,622,284 | G→A | 7.0% | E400K (GAA→AAA) | PP_1421 → | sensor histidine kinase TctE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,622,284 | 0 | G | A | 7.0% | 165.0 / 2.3 | 57 | E400K (GAA→AAA) | PP_1421 | sensor histidine kinase TctE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/25); new base A (2/2); total (30/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTG > NC_002947/1622135‑1622424 | cgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACC‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtgg < 1:98/149‑1 (MQ=255) gctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtgg < 6:185629/149‑1 (MQ=255) gAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACTACgg > 7:256551/1‑149 (MQ=255) gcCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAg > 7:245202/1‑149 (MQ=255) gcCGGTGTGGGGTTAGGGTGCGCCGACATTGATCAACGAGTTGTGGAGCAACCTGGTGGACACTGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGAGTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAg < 8:256551/149‑1 (MQ=255) cGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtgg > 3:220887/1‑132 (MQ=255) cGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtgg < 4:220887/132‑1 (MQ=255) tgGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTcg > 2:295241/1‑148 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTccc < 3:63484/148‑1 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCg > 6:234471/1‑149 (MQ=255) aaGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGc > 3:252778/1‑149 (MQ=255) gggggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCg > 4:103581/1‑149 (MQ=255) ggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgc < 3:149052/149‑1 (MQ=255) ggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgc < 6:136096/149‑1 (MQ=255) ggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgc < 3:144454/149‑1 (MQ=255) cATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg > 1:142458/1‑149 (MQ=255) tCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTc > 4:123080/1‑149 (MQ=255) tCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGAAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTc > 5:38392/1‑149 (MQ=255) tCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGAAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTc > 5:42929/1‑149 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGa < 4:252778/149‑1 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCAGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacgt > 8:115364/1‑106 (MQ=255) gAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCg > 1:77656/1‑149 (MQ=255) ctcgttgAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGt > 7:167856/4‑120 (MQ=255) ctcgttgAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGt < 8:167856/117‑1 (MQ=255) tgtttcgCAACCTGGTTGAGAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGTGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGtt < 6:212919/142‑1 (MQ=255) tgttgAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGtt < 2:131961/148‑1 (MQ=255) gttgAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAAGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgtgt > 3:3494/1‑137 (MQ=255) gttgAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAAGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgtgt < 4:3494/137‑1 (MQ=255) gAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCGCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTAc < 1:295241/148‑1 (MQ=255) aGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgc < 7:288656/121‑1 (MQ=255) aGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTAcc < 3:103581/148‑1 (MQ=255) aGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGCCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgc > 8:288656/1‑121 (MQ=255) cAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCATGGCCGAGCGCGAACGGgt > 1:122913/1‑129 (MQ=255) ccTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCCGCGaa < 8:245202/149‑1 (MQ=255) tggtggACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGt > 7:255350/1‑149 (MQ=255) tggACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCg < 4:86311/142‑1 (MQ=255) tggACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCg > 3:86311/1‑142 (MQ=255) gACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCa < 8:255350/149‑1 (MQ=255) aCAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAg < 2:142458/149‑1 (MQ=255) aTGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAggg > 4:116593/1‑148 (MQ=255) cgctGGCGTATGCGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGt > 5:295051/4‑149 (MQ=255) ggCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGAAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTgg < 6:42929/147‑1 (MQ=255) ggCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGAAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTgg < 6:38392/147‑1 (MQ=255) cgcATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGt > 5:287827/1‑147 (MQ=255) gcATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAg > 2:189040/1‑149 (MQ=255) gCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAt < 2:77656/149‑1 (MQ=255) cAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCg < 6:287827/149‑1 (MQ=255) aaTGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGc > 8:53184/1‑147 (MQ=255) aaTGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGc > 5:24881/1‑147 (MQ=255) aTGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGc > 6:272768/1‑146 (MQ=255) aTGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCgag < 3:123080/149‑1 (MQ=255) gtgATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGc > 4:234497/1‑144 (MQ=255) gtgATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGc < 3:234497/144‑1 (MQ=255) tgATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATc < 5:234471/149‑1 (MQ=255) gATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCt > 7:78992/1‑149 (MQ=255) cGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCggg < 6:295051/148‑1 (MQ=255) gggTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCGGgcg > 3:272174/1‑149 (MQ=255) gTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCa > 5:274626/1‑149 (MQ=255) ggCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAg < 3:116593/149‑1 (MQ=255) gCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGt > 1:65933/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGt < 1:189040/149‑1 (MQ=255) ggaagtggaagACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTgg < 1:295842/111‑1 (MQ=255) ggaagtggaagACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTgg > 2:295842/1‑111 (MQ=255) ggaagtggaagACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAAAGGGTGTTCGAGCGGTTATACCGGAGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTg > 7:193255/1‑148 (MQ=255) gaagtggaagACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGCTTATAAGACGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGAAAGtcagcg > 1:257002/1‑144 (MQ=255) | CGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCTACCGGCGAAGTGCGCAGGGCAGTGGGTTAGGGCTGGCGAT‑‑‑‑CGTTGGCGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTG > NC_002947/1622135‑1622424 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |