| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,669,284 | C→T | 5.8% | T131T (ACC→ACT) | rimM → | ribosome maturation factor RimM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,669,284 | 0 | C | T | 5.8% | 252.8 / 2.6 | 85 | T131T (ACC→ACT) | rimM | ribosome maturation factor RimM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/39); new base T (2/3); total (43/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.66e-01 | |||||||||||
GTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCGGACTTCTAAACGA > NC_002947/1669136‑1669432 | gTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGAcc > 2:234276/1‑149 (MQ=255) ttctGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGt > 5:81194/1‑149 (MQ=255) tctGAGCGGTTACGAAATCTGCTTCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCCGTTGGTAGGGCTGAAGGTCATCACCCAGGAGCAACTACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGt < 1:210686/148‑1 (MQ=255) tctGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGt > 2:210686/1‑148 (MQ=255) tGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGc > 8:221328/1‑148 (MQ=255) aGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGaa < 6:81194/149‑1 (MQ=255) ggTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGa > 2:166874/1‑149 (MQ=255) aCGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGt > 7:262724/1‑148 (MQ=255) 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ccGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGcc < 4:44159/149‑1 (MQ=255) gcgGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCt < 8:262724/149‑1 (MQ=255) gcgGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCt < 5:10234/149‑1 (MQ=255) ccTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCgcag > 4:156391/1‑149 (MQ=255) ttttGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACTGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCgcagg > 4:233970/1‑148 (MQ=255) ttttGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACTGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCgcagg > 4:238031/1‑148 (MQ=255) ttttGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTgc < 5:156059/143‑1 (MQ=255) ttttGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTgc > 6:156059/1‑143 (MQ=255) cccAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCt > 6:215396/1‑149 (MQ=255) ccAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTg > 8:31448/1‑149 (MQ=255) cAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCTAGCCCTGCGCATGCAGCCTg > 6:212910/1‑148 (MQ=255) cAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTg > 4:237911/1‑148 (MQ=255) aaCCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGga < 3:237911/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGgat < 1:73345/149‑1 (MQ=255) tGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATcgc > 6:163463/1‑148 (MQ=255) 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ctGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGccc > 7:62336/1‑148 (MQ=255) ctGGTACCAGTTGGAAGCTCAGAAGGTCATCTACCAGGACGAACAACAGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTCGAGACCGGGGCGAACGATGTTATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGACTGGATC‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGacc > 8:271342/1‑148 (MQ=255) tGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCta < 5:163463/149‑1 (MQ=255) gTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGATACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGCATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCtata > 2:282848/1‑149 (MQ=255) tACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATAc > 2:186431/1‑149 (MQ=255) 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gTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGGCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAAt < 2:78953/148‑1 (MQ=255) ggTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAAtgtgt < 1:166874/149‑1 (MQ=255) ggTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGAACGGTGCGAGCGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAAtgtg < 7:162187/148‑1 (MQ=255) aaGGTCATCAACCAGGACGAACTTCTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCTGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGGGCAGGGTGCATGGATT‑TTCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTgg < 5:4183/148‑1 (MQ=255) tcatcaACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATGGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATc < 7:271342/149‑1 (MQ=255) tcatcaACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATc < 8:62336/149‑1 (MQ=255) atcaACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAAAGTGTGCTGGCAATCGa < 7:31448/149‑1 (MQ=255) tcaACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGAc > 6:191435/1‑149 (MQ=255) aaCCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAAt > 7:276749/1‑143 (MQ=255) aaCCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAAt < 8:276749/143‑1 (MQ=255) 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aGGACGAACAACTGTTCGGCAAAGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCg > 7:193350/1‑147 (MQ=255) aCGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTATGTTGCCCTATACGGAg > 6:197289/1‑119 (MQ=255) aCGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTATGTTGCCCTATACGGAg < 5:197289/119‑1 (MQ=255) acaacTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCg > 3:152649/1‑149 (MQ=255) acaacTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAAAGATGTAATGGTGGTCAATCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAGCCGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGc < 1:234276/149‑1 (MQ=255) tGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGc > 7:164548/1‑143 (MQ=255) tGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGc < 8:164548/143‑1 (MQ=255) tggctttgTCGATCTCCTGTTGGAGTCTGGTGCGAACGATGTATTGGTGGTCTAGGCCTGCGATGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGTG‑CTTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCTAAGCAGGCGTGATGCgg < 2:212336/141‑1 (MQ=255) cGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCgg < 4:152649/148‑1 (MQ=255) cGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGCTGCCCTATAc < 1:265860/102‑1 (MQ=255) cGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGATGCCCTATAc > 2:265860/1‑102 (MQ=255) gCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGAc < 2:229903/125‑1 (MQ=255) gCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGAc > 1:229903/1‑125 (MQ=255) gCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACATCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTc < 5:217538/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGAAATGGTGGTCAAGTACTGCGCAGCCAGCCTGGATG‑AACGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAAACCACCTCGAAGCAGGCGTGATGCgg > 1:212336/1‑146 (MQ=255) ggTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAAt > 8:200995/1‑149 (MQ=255) aTCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATGTATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCa < 1:62634/111‑1 (MQ=255) aTCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCa > 2:62634/1‑110 (MQ=255) aCCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGAcgcg > 6:164599/1‑149 (MQ=255) cTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCgg > 3:158564/1‑148 (MQ=255) ttGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCGGAc < 8:29674/147‑1 (MQ=255) ttGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCGGACtt > 7:31666/1‑149 (MQ=255) ttGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCGGACtt < 4:23161/149‑1 (MQ=255) gagaCCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAAt > 2:39909/1‑133 (MQ=255) gagaCCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAAt < 1:39909/133‑1 (MQ=255) aCCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCGGACTTCTAAAc < 5:215396/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCTAT‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCGGACTTCTAAAc < 1:282848/148‑1 (MQ=255) cGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCGGACTTCTAAACGa < 7:221328/149‑1 (MQ=255) | GTCTTCTGAGCGGTTACGAAATCTGCATCCCGCGGAGCCTTTTGCCCAACCTGGCTGCCGACGAGTACTACTGGTACCAGTTGGTAGGTCTGAAGGTCATCAACCAGGACGAACAACTGTTCGGCAAGGTCGATCACCTGTTGGAGACCGGTGCGAACGATGTAATGGTGGTCAAGCCCTGCGCAGGCAGCCTGGATG‑ATCGCGAG‑CGTCTGTTGCCCTATACGGAGCAATGTGTGCTGGCAATCGACCTCGAAGCAGGCGTGATGCGGGTCGAATGGGACGCGGACTTCTAAACGA > NC_002947/1669136‑1669432 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |